RNA–Protein interactions for RNA: YOR247W

SRL1, Transcript of Mannoprotein that exhibits a tight association with the cell wall, yeast

Gene SRL1, Length 633 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cellular bud, Cytoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SRL1	YOR247W	RNH1	Q04740	348 aa		2.62	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	COX2	P00410	251 aa		2.61	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	RAD3	P06839	778 aa		2.61	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	EPT1	P22140	391 aa		2.61	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	YPC1	P38298	316 aa		2.61	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	TAE1	P38340	232 aa		2.61	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	PET8	P38921	284 aa		2.61	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	GGC1	P38988	300 aa		2.61	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	FMC1	P40491	155 aa		2.61	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	BNA6	P43619	295 aa		2.61	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	SDS23	P53172	527 aa		2.61	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	TPC1	P53257	314 aa		2.61	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	YNR066C	P53752	436 aa		2.61	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	RMI1	Q02685	241 aa		2.61	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	SCS7	Q03529	384 aa		2.61	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	COX20	Q04935	205 aa		2.61	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	TAF9	Q05027	157 aa		2.61	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	CTS2	Q06350	511 aa		2.61	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	MMT2	Q08970	484 aa		2.61	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	PER33	Q12144	273 aa		2.61	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	CYM1	P32898	989 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	HSM3	P38348	480 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	YHR045W	P38775	560 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	COA1	P40452	197 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	TIS11	P47977	285 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	MRPL50	P53724	139 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	PET117	Q02771	107 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	SRL4	Q03085	281 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	VBA1	Q04301	562 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	PEX30	Q06169	523 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	MCH1	Q07376	486 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	TY3A-G	Q12173	290 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	TY3A-I	Q99219	290 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	RRT12	P25381	491 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	SUA5	P32579	426 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	MRPL6	P32904	214 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	SDS24	P38314	527 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	ECM34	P38728	170 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	SHC1	P39000	512 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	DDI1	P40087	428 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	YGL262W	P53054	175 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	YPS5	P53057	165 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	VEL1	P53058	206 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	COG7	P53195	279 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	INP2	Q03824	705 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	DPP1	Q05521	289 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	BOP2	Q06150	570 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	TAZ1	Q06510	381 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	ARV1	Q06541	321 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	CTR3	Q06686	241 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	BSC6	Q08280	497 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SRL1	YOR247W	DAL81	P21657	970 aa		2.58	□□□□□ -2
SRL1	YOR247W	CWP1	P28319	239 aa		2.58	□□□□□ -2
SRL1	YOR247W	ZIP1	P31111	875 aa		2.58	□□□□□ -2
SRL1	YOR247W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SRL1	YOR247W	AEP1	P32493	518 aa		2.58	□□□□□ -2
SRL1	YOR247W	SRB4	P32569	687 aa		2.58	□□□□□ -2
SRL1	YOR247W	TIP20	P33891	701 aa		2.58	□□□□□ -2
SRL1	YOR247W	TCD1	P38756	429 aa		2.58	□□□□□ -2
SRL1	YOR247W	VAB2	P40003	282 aa		2.58	□□□□□ -2
SRL1	YOR247W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SRL1	YOR247W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SRL1	YOR247W	MIC19	P43594	170 aa		2.58	□□□□□ -2
SRL1	YOR247W	ASG7	P46993	209 aa		2.58	□□□□□ -2
SRL1	YOR247W	TIM21	P53220	239 aa		2.58	□□□□□ -2
SRL1	YOR247W	FMP48	P53233	369 aa		2.58	□□□□□ -2
SRL1	YOR247W	HAL1	Q01766	294 aa		2.58	□□□□□ -2
SRL1	YOR247W	MRPS16	Q02608	121 aa		2.58	□□□□□ -2
SRL1	YOR247W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SRL1	YOR247W	VHS1	Q03785	461 aa		2.58	□□□□□ -2
SRL1	YOR247W	SFH1	Q06168	426 aa		2.58	□□□□□ -2
SRL1	YOR247W	MHR1	Q06630	226 aa		2.58	□□□□□ -2
SRL1	YOR247W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SRL1	YOR247W	MIM1	Q08176	113 aa		2.58	□□□□□ -2
SRL1	YOR247W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
SRL1	YOR247W	YOR292C	Q08743	309 aa		2.58	□□□□□ -2
SRL1	YOR247W	YOR376W	Q08900	122 aa		2.58	□□□□□ -2
SRL1	YOR247W	PSK1	P31374	1356 aa		2.58	□□□□□ -2
SRL1	YOR247W	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.57	□□□□□ -2	not detected
SRL1	YOR247W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
SRL1	YOR247W	NTG1	P31378	399 aa		2.57	□□□□□ -2
SRL1	YOR247W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.57	□□□□□ -2	not detected
SRL1	YOR247W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
SRL1	YOR247W	BIG1	P38813	335 aa		2.57	□□□□□ -2
SRL1	YOR247W	YIL054W	P40524	105 aa		2.57	□□□□□ -2
SRL1	YOR247W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2

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