RNA–Protein interactions for RNA: YOR104W

PIN2, Transcript of Exomer-dependent cargo protein, yeast

Gene PIN2, Length 849 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PIN2	YOR104W	RRG9	P40156	214 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIN2	YOR104W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PIN2	YOR104W	SWP82	P43554	623 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIN2	YOR104W	MNN5	P46982	586 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIN2	YOR104W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PIN2	YOR104W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PIN2	YOR104W	ATG4	P53867	494 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIN2	YOR104W	SDC1	Q03323	175 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIN2	YOR104W	DML1	Q03652	475 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIN2	YOR104W	SNX41	Q04053	625 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIN2	YOR104W	SMP3	Q04174	516 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIN2	YOR104W	SNO4	Q04902	237 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIN2	YOR104W	COX20	Q04935	205 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIN2	YOR104W	MLC2	Q06580	163 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIN2	YOR104W	IRC19	Q07843	230 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIN2	YOR104W	COQ10	Q08058	207 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIN2	YOR104W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PIN2	YOR104W	HSP32	Q08992	237 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PIN2	YOR104W	TPK3	P05986	398 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	STE12	P13574	688 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	YPK2	P18961	677 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	MSN4	P33749	630 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	NIC96	P34077	839 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	CHK1	P38147	527 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	MED8	P38304	223 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	ARN2	P38724	620 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	SHO1	P40073	367 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	YNL195C	P40168	261 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	POP1	P41812	875 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	YNR062C	P53748	327 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	ASI1	P54074	624 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	SPC19	Q03954	165 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	YDL218W	Q07629	317 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	SPC3	Q12133	184 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	RLM1	Q12224	676 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	HER1	Q12276	1246 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	SWM1	Q12379	170 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	YEF1	P32622	495 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	YBR285W	P38354	144 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	YEL057C	P39983	233 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	MSS2	P40990	351 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	RET2	P43621	546 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	YFR054C	P43622	192 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	NIT2	P47016	307 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	YGR066C	P53242	292 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	SPO19	Q03029	223 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	FDC1	Q03034	503 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	HOT1	Q03213	719 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	YMD8	Q03697	442 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	GRC3	Q07845	632 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	YRM1	Q12340	786 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	TRM13	Q12383	476 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	SET6	Q12529	373 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	PHO2	P07269	559 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	UTR1	P21373	530 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	SED4	P25365	1065 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	ERG9	P29704	444 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	ATS1	P31386	333 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	DBF20	P32328	564 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	OAC1	P32332	324 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	CHL4	P38907	458 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	YER184C	P39961	794 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	BNA1	P47096	177 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	HMS2	P47175	358 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	COS10	P52924	374 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	SLD3	P53135	668 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	RPN14	P53196	417 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	SNF12	P53628	566 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	MNT4	P53745	580 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	BSC5	P53755	489 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	SNZ1	Q03148	297 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	SCS7	Q03529	384 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	BTS1	Q12051	335 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	COX17	Q12287	69 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	NUM1	Q00402	2748 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	PHO80	P20052	293 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	SCO1	P23833	295 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	VPH2	P32341	215 aa		4.93	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.7 ms