RNA–Protein interactions for RNA: YKL038W

RGT1, Transcript of Glucose-responsive transcription factor, yeast

Gene RGT1, Length 3,513 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RGT1	YKL038W	EMC5	P40540	141 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	CAT5	P41735	233 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	YJR012C	P47087	207 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	HMS2	P47175	358 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.99	□□□□□ -1.61	not detected
RGT1	YKL038W	YLR346C	Q06139	101 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	ECM7	Q06200	448 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.99	□□□□□ -1.61	not detected
RGT1	YKL038W	RRI1	Q12468	440 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	RIF1	P29539	1916 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	SIR2	P06700	562 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	ERD2	P18414	219 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	EHD3	P28817	500 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	SPO73	P40031	143 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	ASK10	P48361	1146 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	TRM9	P49957	279 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	SGF73	P53165	657 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	SAY1	P53324	424 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	YNL184C	P53876	108 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	GPI15	P53961	229 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	SFC1	P33303	322 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	SKN1	P33336	771 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	COS9	P36034	407 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	MNL1	P38888	796 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	SSU1	P41930	458 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	IBA57	P47158	497 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	NBP35	P52920	328 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	AAT1	Q01802	451 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	AIM39	Q08223	395 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	MED7	Q08278	222 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	COX5B	P00425	151 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	SEC22	P22214	214 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	CWP1	P28319	239 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	FAT1	P38225	669 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	PRE3	P38624	215 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	ELO3	P40319	345 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	POG1	P40473	351 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	SNM1	P40993	198 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	NCS6	P53088	359 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	FLC3	P53121	802 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	YGR012W	P53206	393 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	TAM41	P53230	385 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	MEP3	P53390	489 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	DIA1	P54005	336 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	PRY2	P36110	329 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	COA1	P40452	197 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	SYS1	P41544	203 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	QRI7	P43122	407 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	YGR042W	P53227	271 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	CYT2	Q00873	224 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	YMR087W	Q04299	284 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	PEX30	Q06169	523 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	YLR455W	Q06188	304 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	FRE6	Q12473	712 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	PHO91	P27514	894 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	MRP17	P28778	131 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	YKU70	P32807	602 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	MTH1	P35198	433 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
RGT1	YKL038W	RCK1	P38622	512 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	MEP2	P41948	499 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	YDL183C	P48569	320 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	UPS3	Q04006	179 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	EMI1	Q04406	187 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	MSC3	Q05812	728 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	YCT1	Q12235	531 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	FSH3	Q99369	266 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	YOR304C-A	O14468	76 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	HEM2	P05373	342 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	CDC42	P19073	191 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	STP22	P25604	385 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	AIM26	P32858	118 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	YEL057C	P39983	233 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	GWT1	P47026	490 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	RPN14	P53196	417 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	MRPL35	Q06678	367 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	GUD1	Q07729	489 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RGT1	YKL038W	TEN1	Q07921	160 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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