RNA–Protein interactions for RNA: YJL036W

SNX4, Transcript of Sorting nexin, yeastyeast

Gene SNX4, Length 1,272 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNX4YJL036W SPT4P32914 102 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W CBF5P33322 483 aaKnown RBP RIP-Chip data2.87□□□□□ -1.95not detected
SNX4YJL036W MRPL10P36520 322 aa2.87□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W RFS1P38234 210 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W PFS1P38872 237 aa2.87□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W AIM10P39965 576 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W YER186CP40101 306 aa2.87□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W CGR1P53188 120 aa2.87□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W CDH1P53197 566 aa2.87□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W VHT1P53241 593 aa2.87□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W ENT5Q03769 411 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W MYO5Q04439 1219 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W TAZ1Q06510 381 aa2.87□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W CTR3Q06686 241 aa2.87□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W FDH1Q08911 376 aa2.87□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W MSH5Q12175 901 aa2.87□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W MCT1Q12283 360 aa2.87□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W ADF1Q2V2Q1 113 aa2.87□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W YBL111CQ3E7Y5 667 aa2.87□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W LAG2Q92325 660 aa2.87□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W CHD1P32657 1468 aa2.87□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W SAC3P46674 1301 aa2.87□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W ARG80P07249 177 aa2.86□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W ZIP1P31111 875 aa2.86□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W YBR241CP38142 488 aa2.86□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W CHL4P38907 458 aa2.86□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W PET8P38921 284 aa2.86□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W OTU1P43558 301 aa2.86□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W HIT1P46973 164 aa2.86□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W PGA2P53903 129 aa2.86□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W ADD37Q03233 198 aa2.86□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W YDR209CQ03480 137 aa2.86□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W YET2Q04210 160 aa2.86□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W GMC1Q04399 608 aa2.86□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W FAR10Q06001 478 aa2.86□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W LIP2Q06005 328 aa2.86□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W RPN8Q08723 338 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W PER33Q12144 273 aa2.86□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W GIS3Q12418 502 aa2.86□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W TDH2P00358 332 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W STE7P06784 515 aa2.85□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W MATALPHA1P0CY06 175 aa2.85□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W HMLALPHA1P0CY07 175 aa2.85□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W CMK2P22517 447 aa2.85□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W IFM1P25038 676 aa2.85□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W POF1P25576 258 aa2.85□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W IES6P32617 166 aa2.85□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W SOL2P37262 315 aa2.85□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W LDB7P38210 180 aa2.85□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W RCK1P38622 512 aa2.85□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W BAT1P38891 393 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W TIM17P39515 158 aa2.85□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W STB1P42845 420 aa2.85□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W NBP1P52919 319 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W PEX31P53203 462 aa2.85□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W YGR015CP53208 328 aa2.85□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W TPC1P53257 314 aa2.85□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W YNL040WP53960 456 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W DPP1Q05521 289 aa2.85□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W YLR283WQ05867 314 aa2.85□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W SFH1Q06168 426 aa2.85□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W PEX30Q06169 523 aa2.85□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W YLR177WQ06251 628 aa2.85□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W YPL245WQ12179 454 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W BI3Q9ZZW7 517 aa2.85□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W PPA2P28239 310 aa2.84□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W BMT2P38278 337 aa2.84□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W PRS2P38620 318 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W NPT1P39683 429 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W MIG3P39943 394 aa2.84□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W YJR012CP47087 207 aa2.84□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W YJR054WP47114 497 aa2.84□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W YPT32P51996 222 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W BOR1P53838 576 aa2.84□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W RNH201P53942 307 aa2.84□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W KTR6P54070 446 aa2.84□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W CDC14Q00684 551 aa2.84□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W SCS7Q03529 384 aa2.84□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W YDR115WQ04598 105 aa2.84□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W GTO3Q04806 366 aa2.84□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W YLR446WQ06204 433 aa2.84□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W MMT2Q08970 484 aa2.84□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W PLP2Q12017 286 aa2.84□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W RPL21BQ12672 160 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
SNX4YJL036W BGL2P15703 313 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SNX4YJL036W RNA15P25299 296 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
SNX4YJL036W CDC50P25656 391 aa2.83□□□□□ -1.96
SNX4YJL036W SIP3P38717 1229 aa2.83□□□□□ -1.96
SNX4YJL036W SHC1P39000 512 aa2.83□□□□□ -1.96
SNX4YJL036W RPL10P41805 221 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SNX4YJL036W ASG7P46993 209 aa2.83□□□□□ -1.96
SNX4YJL036W NOP13P53883 403 aaKnown RBP RIP-Chip data2.83□□□□□ -1.96not detected
SNX4YJL036W YOR376WQ08900 122 aa2.83□□□□□ -1.96
SNX4YJL036W VIK1Q12045 647 aa2.83□□□□□ -1.96
SNX4YJL036W YOR114WQ12219 294 aa2.83□□□□□ -1.96
SNX4YJL036W RPS3P05750 240 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
SNX4YJL036W CDC36P06100 191 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
SNX4YJL036W RHO1P06780 209 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
SNX4YJL036W NHP6BP11633 99 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
SNX4YJL036W ZRC1P20107 442 aa2.82□□□□□ -1.96
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