RNA–Protein interactions for RNA: YHR064C

SSZ1, Transcript of Hsp70 protein that interacts with Zuo1p (a DnaJ homolog), yeast

Gene SSZ1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SSZ1	YHR064C	PMT3	P47190	753 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	PPT1	P53043	513 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	NRK1	P53915	240 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	RHO4	Q00246	291 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	ODC1	Q03028	310 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	YDR444W	Q04093	687 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	CRT10	Q08226	957 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	ZEO1	Q08245	113 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	YOR385W	Q08909	290 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	YOS9	Q99220	542 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	CBS1	P14066	229 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	YMC1	P32331	307 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	YKL107W	P34251	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	YPC1	P38298	316 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	LAG1	P38703	411 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	IKI1	P38874	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	SRB7	P47822	140 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	YGL235W	P53071	178 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	CGR1	P53188	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	YPL113C	Q02961	396 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	YDR541C	Q03049	344 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	MSC1	Q03104	513 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	SSY1	Q03770	852 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	SNX41	Q04053	625 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	YMR252C	Q04814	134 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	MET32	Q12041	191 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	TY1A-BL	Q12266	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	RRI1	Q12468	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	YPR064W	Q12492	139 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	MDM35	O60200	86 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	RPB5	P20434	215 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	STE50	P25344	346 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	YCR100C	P25606	316 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	ADE1	P27616	306 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	MRP20	P32387	263 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	SUA5	P32579	426 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	YKL162C	P36052	402 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	FLO10	P36170	1169 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	MET30	P39014	640 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	GTT1	P40582	234 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	PAM16	P42949	149 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	CAF16	P43569	289 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	SNN1	P48232	102 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	YGL204C	P53089	101 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	GIM3	P53900	129 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.62	not detected
SSZ1	YHR064C	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	CAC2	Q04199	468 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	GIC2	Q06648	383 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	CDA2	Q06703	312 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	CYK3	Q07533	885 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	FDH1	Q08911	376 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	YDL211C	Q12121	372 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	YDL177C	Q12257	170 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	AHC1	Q12433	566 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SSZ1	YHR064C	SOD2	P00447	233 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	FUS1	P11710	512 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	APA2	P22108	325 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	YEF1	P32622	495 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	SRY1	P36007	326 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	BET3	P36149	193 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	PGD1	P40356	397 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	SYS1	P41544	203 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	MRX5	P47007	382 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	PHO23	P50947	330 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	COG7	P53195	279 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	YNR040W	P53736	256 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	NAT4	Q04751	285 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	ROY1	Q04847	553 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	VPS68	Q12016	184 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	TMS1	Q12116	473 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	SKS1	Q12505	502 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	PCC1	Q3E833	88 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	YLR422W	Q06409	1932 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	INH1	P01097	85 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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