RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM167A	Q96KS9	214 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	CEP170P1	Q96L14	293 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	NT5C1B	Q96P26	610 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	AGPAT1	Q99943	283 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	CARD9	Q9H257	536 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	TFR2	Q9UP52	801 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-222	ENST00000459758	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	KCNK3	O14649	394 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	IVL	P07476	585 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	POTEJ	P0CG39	1038 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	TGFB3	P10600	412 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	GPC3	P51654	580 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	AP3M2	P53677	418 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	GALC	P54803	685 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	KCNA1	Q09470	495 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	MTMR3	Q13615	1198 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	GPD1L	Q8N335	351 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	MREG	Q8N565	214 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	FBXL18	Q96ME1	805 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	RAB17	Q9H0T7	212 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	CSAD	Q9Y600	493 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	DENND3	A2RUS2	1198 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	BACH1	O14867	736 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC16A4	O15374	487 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	KCNA2	P16389	499 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	CNGA1	P29973	690 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	NPTX2	P47972	431 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	PDE6C	P51160	858 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	HMGCS2	P54868	508 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	GPC5	P78333	572 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	NEDD9	Q14511	834 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	CBWD6	Q4V339	395 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	CROCCP2	Q86T23	111 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	HES6	Q96HZ4	224 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	GDF3	Q9NR23	364 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF233	A6NK53	670 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	ZBTB39	O15060	712 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	CEP104	O60308	925 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	MTA2	O94776	668 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	ZBTB7A	O95365	584 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC25A27	O95847	323 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	FTCD	O95954	541 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	TRIM49	P0CI25	452 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	TRIM49C	P0CI26	452 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	MYBL1	P10243	752 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	NF2	P35240	595 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	NAMPT	P43490	491 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	GCNT1	Q02742	428 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	SURF1	Q15526	300 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-222	ENST00000459758	WDR44	Q5JSH3	913 aa		12.43	□□□□□ -0.42

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms