RNA–Protein interactions for RNA: YPL062W

YPL062W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YPL062W, Length 405 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YPL062W	YPL062W	CDC5	P32562	705 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	PTC1	P35182	281 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	OMA1	P36163	345 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	MBA1	P38300	278 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	ARN2	P38724	620 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	YHK8	P38776	514 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	IPT1	P38954	527 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	VPS52	P39904	641 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	PGD1	P40356	397 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	CIN1	P40987	1014 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	YGR201C	P42936	225 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	CAF16	P43569	289 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	PAC10	P48363	199 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	YGR042W	P53227	271 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	GPI1	P53306	609 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	RNH70	P53331	553 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	ATG4	P53867	494 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	YNL095C	P53932	642 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	OCA2	P53949	197 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	NUP116	Q02630	1113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	YMR209C	Q03648	457 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	RUB1	Q03919	77 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	YDR387C	Q04162	555 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	RTT103	Q05543	409 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	GPN3	Q06543	272 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	YDL086W	Q07505	273 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	FRE3	Q08905	711 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	MDY2	Q12285	212 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	YPL247C	Q12523	523 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	ARG81	P05085	880 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	BAR1	P12630	587 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	ENA1	P13587	1091 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	FPS1	P23900	669 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	LDS1	P31379	325 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	MKK1	P32490	508 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	TAT1	P38085	619 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	YJL206C	P39529	758 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	UIP3	P39547	235 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	TOK1	P40310	691 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	HIS6	P40545	261 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	TIR3	P40552	269 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	YIR035C	P40579	254 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	MAD2	P40958	196 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	SLS1	P42900	643 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	VOA1	P53262	265 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	SMA2	Q04658	369 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	HDA2	Q06629	674 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	YET3	Q07451	203 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	UAF30	Q08747	228 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	SPC3	Q12133	184 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	ENA5	Q12691	1091 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	SAS5	Q99314	248 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	CBS2	P14905	389 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	CCA1	P21269	546 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
YPL062W	YPL062W	PDC2	P32896	925 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	SPO23	P33757	523 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	LST4	P34239	828 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	RIM2	P38127	377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	BZZ1	P38822	633 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	YIL169C	P40442	995 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
YPL062W	YPL062W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	YDL183C	P48569	320 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	ALG12	P53730	551 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	YPL071C	Q02864	156 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	MET31	Q03081	177 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	HSP31	Q04432	237 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	HOF1	Q05080	669 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	YLR224W	Q05947	369 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	REX4	Q08237	289 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	CSM4	Q08955	156 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	ATX2	Q12067	313 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YPL062W	YPL062W	HTB2	P02294	131 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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