RNA–Protein interactions for RNA: YML115C

VAN1, Transcript of Component of the mannan polymerase I, yeast

Gene VAN1, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAN1	YML115C	EFM1	P38732	585 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	CEM1	P39525	442 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	CIN2	P46670	268 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	PHO86	P46956	311 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	ABF2	Q02486	183 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	YMR279C	Q03263	540 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	MRX4	Q12467	430 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	ZPS1	Q12512	249 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	CDC7	P06243	507 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	UGX2	P32772	223 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	RGT1	P32862	1170 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	MRPL16	P38064	232 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	AIM18	P38884	321 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	PFA3	P42836	336 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	TRS85	P46944	698 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	MGA1	P53050	456 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	MTL1	P53214	551 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	YKR005C	Q02203	525 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	SWP1	Q02795	286 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	YDR476C	Q03362	224 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	PRM6	Q04705	352 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	YPR196W	Q06595	470 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	YAP7	Q08182	245 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	ALE1	Q08548	619 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	THI21	Q08975	551 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	ATG34	Q12292	412 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	TRM13	Q12383	476 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	YOP1	Q12402	180 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	PSF1	Q12488	208 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	CUP2	P15315	225 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	ATO2	P32907	282 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	YBR220C	P38318	560 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	RCK2	P38623	610 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	HIS2	P38635	335 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
VAN1	YML115C	PHO90	P39535	881 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	YAR028W	P39548	234 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	VFA1	P40080	203 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	BMT5	P40493	336 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	SER2	P42941	309 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	EXG2	P52911	562 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	HRD3	Q05787	833 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	YLL058W	Q12198	575 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	YOR114W	Q12219	294 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	YLR046C	Q12253	270 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	RGT2	Q12300	763 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	GLO4	Q12320	285 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	JLP1	Q12358	412 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	RMD5	Q12508	421 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	PUT2	P07275	575 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	FUB1	P25659	250 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	PRO1	P32264	428 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	REC114	P32841	428 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	ARA1	P38115	344 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	VPS52	P39904	641 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	PGD1	P40356	397 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	MAM33	P40513	266 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	SLS1	P42900	643 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	ROG1	P53118	685 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	GIP3	Q03016	1276 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	VHS1	Q03785	461 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	PLB3	Q08108	686 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	THI72	Q08579	599 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	SLM3	Q12093	417 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	YPR1	Q12458	312 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VAN1	YML115C	COX3	P00420	269 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VAN1	YML115C	AI3	P03877	415 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VAN1	YML115C	YSP3	P25036	478 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VAN1	YML115C	HYM1	P32464	399 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VAN1	YML115C	SRB5	P32585	307 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VAN1	YML115C	IES6	P32617	166 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VAN1	YML115C	GPI16	P38875	610 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VAN1	YML115C	DSE1	P40077	573 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VAN1	YML115C	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VAN1	YML115C	COS1	P53822	381 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VAN1	YML115C	NRK1	P53915	240 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VAN1	YML115C	SED5	Q01590	340 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VAN1	YML115C	AIM34	Q03673	198 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VAN1	YML115C	OST6	Q03723	332 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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