RNA–Protein interactions for RNA: YHR060W

VMA22, Transcript of Protein that is required for vacuolar H+-ATPase (V-ATPase) function, yeast

Gene VMA22, Length 546 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA22	YHR060W	YDL109C	Q12103	647 aa		3.82	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	PER33	Q12144	273 aa		3.82	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	TFC7	Q12415	435 aa		3.82	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	PRM4	Q12498	284 aa		3.82	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	HEM4	P06174	275 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	CBS2	P14905	389 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	YCR022C	P25620	114 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	DEP1	P31385	405 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	ATO2	P32907	282 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	SPO23	P33757	523 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	HAC1	P41546	238 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	YFL067W	P43537	175 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	RPC17	P47076	161 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	COS1	P53822	381 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	MTQ1	P53944	314 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	VBA1	Q04301	562 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	FMP42	Q04991	504 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	CTR3	Q06686	241 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	REP1	P03871	373 aa		3.8	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		3.8	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	TFS1	P14306	219 aa		3.8	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	IFM1	P25038	676 aa		3.8	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	AGA1	P32323	725 aa		3.8	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	MRPL6	P32904	214 aa		3.8	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	MCH2	P36032	473 aa		3.8	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	ECM4	P36156	370 aa		3.8	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	XBP1	P40489	647 aa		3.8	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	PCI8	P40512	444 aa		3.8	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	GLG2	P47011	380 aa		3.8	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	YJR012C	P47087	207 aa		3.8	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	TIS11	P47977	285 aa		3.8	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	SCS3	P53012	380 aa		3.8	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	GOR1	P53839	350 aa		3.8	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	NUP116	Q02630	1113 aa		3.8	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	SNF8	Q12483	233 aa		3.8	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	INO2	P26798	304 aa		3.79	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	NAM9	P27929	486 aa		3.79	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	FUN26	P31381	517 aa		3.79	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	SSO1	P32867	290 aa		3.79	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	RIB1	P38066	345 aa		3.79	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	GDS1	P41913	522 aa		3.79	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	LCB3	P47013	409 aa		3.79	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	UBC13	P52490	153 aa		3.79	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	CLD1	P53264	445 aa		3.79	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	TRM82	Q03774	444 aa		3.79	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	DCR2	Q05924	578 aa		3.79	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	MHR1	Q06630	226 aa		3.79	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	YPR091C	Q06833	770 aa		3.79	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	FCY22	Q12119	530 aa		3.79	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	AYT1	Q12226	474 aa		3.79	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	YFL068W	P0CX99	160 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	HEM15	P16622	393 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	RPO26	P20435	155 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	VPS51	P36116	164 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	CUE1	P38428	203 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	NCA3	P46955	337 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	HOC1	P47124	396 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	RPN6	Q12377	434 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VMA22	YHR060W	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMA22	YHR060W	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMA22	YHR060W	NAM2	P11325	894 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMA22	YHR060W	LDS1	P31379	325 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMA22	YHR060W	PDC2	P32896	925 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMA22	YHR060W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
VMA22	YHR060W	YBR137W	P38276	179 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMA22	YHR060W	SDS24	P38314	527 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMA22	YHR060W	MIC12	P38341	106 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VMA22	YHR060W	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
VMA22	YHR060W	CIN2	P46670	268 aa		3.77	□□□□□ -1.81

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