RNA–Protein interactions for RNA: YHR004C

NEM1, Transcript of Probable catalytic subunit of Nem1p-Spo7p phosphatase holoenzyme, yeast

Gene NEM1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NEM1	YHR004C	BUB3	P26449	341 aa		3.3	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	YKL162C	P36052	402 aa		3.3	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	MRPL10	P36520	322 aa		3.3	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	PRM5	P40476	318 aa		3.3	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	AIM24	P47127	394 aa		3.3	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	AZR1	P50080	613 aa		3.3	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	PMT5	P52867	743 aa		3.3	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	RMR1	P53060	241 aa		3.3	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	POP6	P53218	158 aa		3.3	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	SED5	Q01590	340 aa		3.3	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	BET5	Q03630	159 aa		3.3	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	FUS2	Q05670	677 aa		3.3	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	IMA2	Q08295	589 aa		3.3	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	MUM3	Q08750	479 aa		3.3	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	YPL199C	Q08954	240 aa		3.3	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	YPQ1	Q12010	308 aa		3.3	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	MSH5	Q12175	901 aa		3.3	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	IZH4	Q99393	312 aa		3.3	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		3.29	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	POP5	P28005	173 aa		3.29	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	ZRT1	P32804	376 aa		3.29	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	YKL063C	P35725	167 aa		3.29	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	MIX23	P38162	196 aa		3.29	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	YHR035W	P38769	630 aa		3.29	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	SBE22	P38814	852 aa		3.29	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	ATG7	P38862	630 aa		3.29	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	COX15	P40086	486 aa		3.29	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	TAD2	P47058	250 aa		3.29	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	ABM1	P47146	123 aa		3.29	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	YIP1	P53039	248 aa		3.29	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	OKP1	P53298	406 aa		3.29	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	BIO4	P53630	237 aa		3.29	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	IRC4	Q03036	179 aa		3.29	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	YDR209C	Q03480	137 aa		3.29	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	RAD9	P14737	1309 aa		3.29	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	CBF1	P17106	351 aa		3.28	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	UTR1	P21373	530 aa		3.28	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	CSE1	P33307	960 aa		3.28	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	KDX1	P36005	433 aa		3.28	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	RIB1	P38066	345 aa		3.28	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	DDI1	P40087	428 aa		3.28	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	LST7	P53237	242 aa		3.28	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	FRE4	P53746	719 aa		3.28	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	DIA1	P54005	336 aa		3.28	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	NUP116	Q02630	1113 aa		3.28	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	YDR222W	Q04925	415 aa		3.28	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	NCA2	Q12374	616 aa		3.28	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	ORT1	Q12375	292 aa		3.28	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	ATP6	P00854	259 aa		3.27	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	RAD1	P06777	1100 aa		3.27	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	CMK2	P22517	447 aa		3.27	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	YCR100C	P25606	316 aa		3.27	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	SSO1	P32867	290 aa		3.27	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	AST1	P35183	429 aa		3.27	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	IST2	P38250	946 aa		3.27	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	TRM5	P38793	499 aa		3.27	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	COA1	P40452	197 aa		3.27	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	PHB2	P50085	310 aa		3.27	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	GET1	P53192	235 aa		3.27	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	CPD1	P53314	239 aa		3.27	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	3.27	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	YNR048W	P53740	393 aa		3.27	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	HCH1	P53834	153 aa		3.27	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	DCR2	Q05924	578 aa		3.27	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	ATG17	Q06410	417 aa		3.27	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	ASR1	Q06834	288 aa		3.27	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	PER33	Q12144	273 aa		3.27	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	3.26	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.26	□□□□□ -1.89	not detected
NEM1	YHR004C	MKK1	P32490	508 aa		3.26	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	IES6	P32617	166 aa		3.26	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	3.26	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	YCR041W	P37265	110 aa		3.26	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	SMF2	P38778	549 aa		3.26	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	DSN1	P40568	576 aa		3.26	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	KEG1	P43614	200 aa		3.26	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	RPC17	P47076	161 aa		3.26	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	ODC1	Q03028	310 aa		3.26	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	PRM15	Q03262	622 aa		3.26	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	NDE2	Q07500	545 aa		3.26	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	TIM18	Q08749	192 aa		3.26	□□□□□ -1.89

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