RNA–Protein interactions for RNA: YGR082W

TOM20, Transcript of Component of the TOM (translocase of outer membrane) complex, yeast

Gene TOM20, Length 552 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOM20	YGR082W	COX10	P21592	462 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM20	YGR082W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TOM20	YGR082W	SDS23	P53172	527 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM20	YGR082W	IRC4	Q03036	179 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM20	YGR082W	INP2	Q03824	705 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM20	YGR082W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TOM20	YGR082W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TOM20	YGR082W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TOM20	YGR082W	DSE1	P40077	573 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM20	YGR082W	HIT1	P46973	164 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM20	YGR082W	FMP48	P53233	369 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM20	YGR082W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TOM20	YGR082W	SKI3	P17883	1432 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TOM20	YGR082W	SSN2	P38931	1420 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM20	YGR082W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TOM20	YGR082W	YKL187C	P34231	750 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM20	YGR082W	FRM2	P37261	193 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM20	YGR082W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TOM20	YGR082W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TOM20	YGR082W	UFE1	P41834	346 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM20	YGR082W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TOM20	YGR082W	YPR1	Q12458	312 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM20	YGR082W	ERD1	P16151	362 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM20	YGR082W	ZIP1	P31111	875 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM20	YGR082W	ZRT1	P32804	376 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM20	YGR082W	ZRT3	P34240	503 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM20	YGR082W	YHR035W	P38769	630 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM20	YGR082W	SNX41	Q04053	625 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM20	YGR082W	ECM19	Q06011	112 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM20	YGR082W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TOM20	YGR082W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TOM20	YGR082W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TOM20	YGR082W	HST4	P53688	370 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM20	YGR082W	MRX8	Q05473	314 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM20	YGR082W	VAC14	Q06708	880 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM20	YGR082W	RPB9	P27999	122 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOM20	YGR082W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TOM20	YGR082W	YNR066C	P53752	436 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOM20	YGR082W	APC4	Q04601	652 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOM20	YGR082W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TOM20	YGR082W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TOM20	YGR082W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOM20	YGR082W	VOA1	P53262	265 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TOM20	YGR082W	BIO4	P53630	237 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TOM20	YGR082W	RRG8	Q06109	277 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TOM20	YGR082W	YDL211C	Q12121	372 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TOM20	YGR082W	FAB1	P34756	2278 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TOM20	YGR082W	CTM1	P38818	585 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TOM20	YGR082W	BDH1	P39714	382 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TOM20	YGR082W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TOM20	YGR082W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TOM20	YGR082W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TOM20	YGR082W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TOM20	YGR082W	MCH2	P36032	473 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOM20	YGR082W	PRY2	P36110	329 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOM20	YGR082W	TRR2	P38816	342 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOM20	YGR082W	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TOM20	YGR082W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TOM20	YGR082W	YBR062C	P38239	180 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOM20	YGR082W	YPC1	P38298	316 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOM20	YGR082W	FRT2	P39734	528 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOM20	YGR082W	LOH1	P47055	219 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOM20	YGR082W	ECM18	Q04623	453 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOM20	YGR082W	CKA2	P19454	339 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TOM20	YGR082W	INO2	P26798	304 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TOM20	YGR082W	FMT1	P32785	401 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TOM20	YGR082W	YMR262W	P38430	313 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TOM20	YGR082W	RRF1	P38771	230 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TOM20	YGR082W	MIC19	P43594	170 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TOM20	YGR082W	YGR266W	P53326	701 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TOM20	YGR082W	YLR446W	Q06204	433 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TOM20	YGR082W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TOM20	YGR082W	YOR292C	Q08743	309 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TOM20	YGR082W	APC9	Q12107	265 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TOM20	YGR082W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TOM20	YGR082W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TOM20	YGR082W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TOM20	YGR082W	SLM1	P40485	686 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TOM20	YGR082W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TOM20	YGR082W	TRM10	Q12400	293 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TOM20	YGR082W	GPX1	P36014	167 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TOM20	YGR082W	UBC13	P52490	153 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TOM20	YGR082W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
TOM20	YGR082W	APJ1	P53940	528 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TOM20	YGR082W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
TOM20	YGR082W	SIA1	Q12212	622 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TOM20	YGR082W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.5	□□□□□ -1.69	not detected
TOM20	YGR082W	RAD7	P06779	565 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TOM20	YGR082W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
TOM20	YGR082W	CAB3	P36076	571 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TOM20	YGR082W	COX16	P47081	118 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TOM20	YGR082W	YGL118C	P53132	145 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TOM20	YGR082W	ZRG17	P53735	605 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TOM20	YGR082W	SPO19	Q03029	223 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TOM20	YGR082W	GMC1	Q04399	608 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TOM20	YGR082W	UGA1	P17649	471 aa		4.49	□□□□□ -1.69
TOM20	YGR082W	CPT1	P17898	393 aa		4.49	□□□□□ -1.69
TOM20	YGR082W	RPC25	P35718	212 aa		4.49	□□□□□ -1.69
TOM20	YGR082W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
TOM20	YGR082W	MRPL40	P36534	297 aa		4.49	□□□□□ -1.69

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