RNA–Protein interactions for RNA: YOR033C

EXO1, Transcript of 5'-3' exonuclease and flap-endonuclease, yeast

Gene EXO1, Length 2,109 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EXO1	YOR033C	YAP1802	P53309	568 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YPL077C	Q02831	240 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	MSC2	Q03455	724 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	MAK3	Q03503	176 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	RIM13	Q03792	727 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	ARA2	Q04212	335 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	PUS5	Q06244	254 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	BSC6	Q08280	497 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	RAD28	Q12021	506 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	LCB4	Q12246	624 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	PTC5	Q12511	572 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	QCR2	P07257	368 aa		4.84	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	ATP5	P09457	212 aa		4.84	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	HOG1	P32485	435 aa		4.84	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	UBS1	P38290	277 aa		4.84	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	ARP1	P38696	384 aa		4.84	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	END3	P39013	349 aa		4.84	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	YIL054W	P40524	105 aa		4.84	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	YGL101W	P53144	215 aa		4.84	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	YGR035C	P53222	116 aa		4.84	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	MEP3	P53390	489 aa		4.84	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	MRPL19	P53875	158 aa		4.84	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	MRPS16	Q02608	121 aa		4.84	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	PPM2	Q08282	695 aa		4.84	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	YLR126C	Q12288	251 aa		4.84	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	TRM10	Q12400	293 aa		4.84	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	YDL199C	Q12407	687 aa		4.84	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		4.84	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.84	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	COX5B	P00425	151 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	RHO2	P06781	192 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	ASP3-2	P0CX77	362 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	ASP3-3	P0CX78	362 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	ASP3-4	P0CX79	362 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	REV1	P12689	985 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	HAP3	P13434	144 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	ELO2	P25358	347 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	UPS2	P35200	230 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	FLO10	P36170	1169 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
EXO1	YOR033C	YPC1	P38298	316 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	SFB3	P38810	929 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	IPT1	P38954	527 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	PRM10	P42946	383 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	GWT1	P47026	490 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	SPP2	Q02521	185 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	YDR278C	Q05612	105 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	ASR1	Q06834	288 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	TPO1	Q07824	586 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	ATG10	Q07879	167 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	MED7	Q08278	222 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	GRE1	Q08969	168 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	POM33	Q12164	279 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	RRI1	Q12468	440 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	MHT1	Q12525	324 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	YLR422W	Q06409	1932 aa		4.83	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	AI1	P03875	834 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	SPS2	P08459	502 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	STE4	P18851	423 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	KAR4	P25583	335 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	UGX2	P32772	223 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	YKL075C	P36083	450 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	RCK1	P38622	512 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	YHR035W	P38769	630 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	ATG4	P53867	494 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	YNL034W	P53963	612 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	YNL018C	P53976	612 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	VPS28	Q02767	242 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	FRK1	Q03002	865 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	SNO1	Q03144	224 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	YMR253C	Q04835	414 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	RIF2	Q06208	395 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	ECM30	Q06673	1274 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	PUN1	Q06991	263 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	COX2	P00410	251 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	MSS18	P08593	268 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	PHO80	P20052	293 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	EHD3	P28817	500 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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