RNA–Protein interactions for RNA: YMR250W

GAD1, Transcript of Glutamate decarboxylase, yeast

Gene GAD1, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GAD1	YMR250W	ENB1	Q08299	606 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	MET2	P08465	486 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	SNC1	P31109	117 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	OM14	P38325	134 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	ARN2	P38724	620 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	ALP1	P38971	573 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	HXT9	P40885	567 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	IRC7	P43623	340 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	EXG2	P52911	562 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	HXT11	P54862	567 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	NUP49	Q02199	472 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	ATG21	Q02887	496 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	FIN1	Q03898	291 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	YMR087W	Q04299	284 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	MIX14	Q04341	121 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	SNO4	Q04902	237 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	HDA2	Q06629	674 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	HSP32	Q08992	237 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	YDL109C	Q12103	647 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.07	□□□□□ -1.76	not detected
GAD1	YMR250W	ENA1	P13587	1091 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	ERD1	P16151	362 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	GOS1	P38736	223 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	YHR035W	P38769	630 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.06	□□□□□ -1.76	not detected
GAD1	YMR250W	IPT1	P38954	527 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	FET3	P38993	636 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	KRE29	P40026	464 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	NAS2	P40555	220 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	ECL1	P48235	211 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	SAM37	P50110	327 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	BUD17	P53727	317 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	MRX10	Q05648	414 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	DCR2	Q05924	578 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	YPS7	Q06325	596 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	RAX1	Q08760	435 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	YPL278C	Q08990	100 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	BTS1	Q12051	335 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	MDM32	Q12171	622 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	SIA1	Q12212	622 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	TRM10	Q12400	293 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	ENA5	Q12691	1091 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	KIN28	P06242	306 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	YCR102C	P25608	368 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	NDC1	P32500	655 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	SLC1	P33333	303 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	TPO5	P36029	618 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	SOH1	P38633	127 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	MDM31	P38880	579 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	CHL4	P38907	458 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	YER010C	P40011	234 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	STB1	P42845	420 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	EFM3	P47163	339 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	PGU1	P47180	361 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	YGR066C	P53242	292 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	PGA1	P53896	198 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	YDR209C	Q03480	137 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	OST6	Q03723	332 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	SNX41	Q04053	625 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	ARP10	Q04549	284 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	COX20	Q04935	205 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	NEJ1	Q06148	342 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	RDR1	Q08904	546 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	MCP1	Q12106	302 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	HSP42	Q12329	375 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	APC2	Q12440	853 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	LSO1	Q3E827	93 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	NUP1	P20676	1076 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.04	□□□□□ -1.76	not detected
GAD1	YMR250W	YEF1	P32622	495 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	YKL071W	P36086	256 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	YKR015C	P36111	568 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	KAE1	P36132	386 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	APD1	P38281	316 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	PKP1	P40530	394 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	RPE1	P46969	238 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	MDE1	P47095	244 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	COS10	P52924	374 aa		4.04	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.5 ms