RNA–Protein interactions for RNA: YKL208W

CBT1, Transcript of Protein involved in 5' RNA end processing, yeast

Gene CBT1, Length 816 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CBT1	YKL208W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	ZIP1	P31111	875 aa		5	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	COS9	P36034	407 aa		5	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	YFL040W	P43562	540 aa		5	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	BNA6	P43619	295 aa		5	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	SWC4	P53201	476 aa		5	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	YDL199C	Q12407	687 aa		5	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	XRN1	P22147	1528 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	COX2	P00410	251 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	CBS2	P14905	389 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	PRR1	P28708	518 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	LDS1	P31379	325 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	NUP2	P32499	720 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	YKL063C	P35725	167 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	YFR057W	P43625	151 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	CIN2	P46670	268 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	TRM82	Q03774	444 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	COX20	Q04935	205 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	RIF2	Q06208	395 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	YOR387C	Q08910	206 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	PRM4	Q12498	284 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	RAD3	P06839	778 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	DAL82	P21705	255 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	YHR045W	P38775	560 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	NDT80	P38830	627 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	PRM9	P39551	298 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	MRPL50	P53724	139 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	PBA1	Q05778	276 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	ECM5	Q03214	1411 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	RRT12	P25381	491 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	SRB4	P32569	687 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	RPC37	P36121	282 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	DTR1	P38125	572 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	SMF2	P38778	549 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	YIA6	P40556	373 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	SHY1	P53266	389 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	SNX41	Q04053	625 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	CTS2	Q06350	511 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	ASR1	Q06834	288 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	IRC25	Q07951	179 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	TMS1	Q12116	473 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CBT1	YKL208W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
CBT1	YKL208W	REP1	P03871	373 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	VPS3	P23643	1011 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	YBL059W	P34224	193 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	YER085C	P40058	173 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	YIL067C	P40514	678 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	MOB2	P43563	287 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	CGR1	P53188	120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	YLR283W	Q05867	314 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	GAS2	Q06135	555 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	FRE8	Q12209	686 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	ERV2	Q12284	196 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	SFM1	Q12314	213 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	RPN6	Q12377	434 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	DEP1	P31385	405 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	SUA5	P32579	426 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
CBT1	YKL208W	YKL071W	P36086	256 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	RCK2	P38623	610 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	MNT4	P53745	580 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	YMR209C	Q03648	457 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	FSH2	Q05015	223 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	TIP41	Q12199	356 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	ICT1	Q12385	394 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	IFM1	P25038	676 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	PDC2	P32896	925 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	CYM1	P32898	989 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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