RNA–Protein interactions for RNA: YJL054W

TIM54, Transcript of Component of the mitochondrial TIM22 complex, yeastyeast

Gene TIM54, Length 1,437 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TIM54YJL054W SPO77Q06134 477 aa4.83□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W ATG33Q06485 197 aa4.83□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W PSY3Q12318 242 aa4.83□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W MF(ALPHA)1P01149 165 aa4.82□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W TRP4P07285 380 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W PDX1P16451 410 aa4.82□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W AIM17P23180 465 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W YIM1P28625 365 aa4.82□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W DGR2P32330 852 aa4.82□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W HEK2P38199 381 aaKnown RBP RIP-Chip data4.82□□□□□ -1.64not detected
TIM54YJL054W FAD1P38913 306 aa4.82□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W SHO1P40073 367 aa4.82□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W YNL208WP40159 199 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W YGR201CP42936 225 aa4.82□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W YFR054CP43622 192 aa4.82□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W BNA2P47125 453 aa4.82□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W USE1P53146 245 aa4.82□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W TWF1P53250 332 aa4.82□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W COG2P53271 262 aa4.82□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W IGO1P53897 168 aa4.82□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W MTQ1P53944 314 aa4.82□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W RSC9Q03124 581 aa4.82□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W KRE28Q04431 385 aa4.82□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W PSR1Q07800 427 aa4.82□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W RRT8Q08219 342 aa4.82□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W MUM3Q08750 479 aa4.82□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W MCP1Q12106 302 aa4.82□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W HER1Q12276 1246 aa4.82□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W MET2P08465 486 aa4.81□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W CTA1P15202 515 aa4.81□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W ATP7P30902 174 aa4.81□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W MTC4P38335 694 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W ECM34P38728 170 aa4.81□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W HPM1P40481 377 aa4.81□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W COS6P53344 381 aa4.81□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W OGG1P53397 376 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W YPL039WQ03080 316 aa4.81□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W RSN1Q03516 953 aa4.81□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W DLT1Q04216 342 aa4.81□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W GRE1Q08969 168 aa4.81□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W YDL211CQ12121 372 aa4.81□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W YRA1Q12159 226 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W MET3P08536 511 aa4.8□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W UTR1P21373 530 aa4.8□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W YCK1P23291 538 aa4.8□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W ERG4P25340 473 aa4.8□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W CDC39P25655 2108 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W SSE1P32589 693 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W SWH1P35845 1188 aa4.8□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W TDP1P38319 544 aa4.8□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W PTH1P38876 190 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W SEN34P39707 275 aa4.8□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W MET28P40573 187 aa4.8□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W SNM1P40993 198 aa4.8□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W ARF3P40994 183 aaRIP-Chip data4.8□□□□□ -1.64not detected
TIM54YJL054W TOM22P49334 152 aa4.8□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W TOS2P50078 622 aa4.8□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W MIG2P53035 382 aa4.8□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W MKC7P53379 596 aa4.8□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W SVL3Q03088 825 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W ARV1Q06541 321 aa4.8□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W BRX1Q08235 291 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W SFM1Q12314 213 aa4.8□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W UGA1P17649 471 aa4.8□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W MDH2P22133 377 aa4.8□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W RPI1P23250 407 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W SCO1P23833 295 aa4.8□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W MRX1P40050 688 aa4.8□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W COG3P40094 801 aa4.8□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W MSE1P48525 536 aa4.8□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W MSY1P48527 492 aa4.8□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W COX20Q04935 205 aa4.8□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W THP1Q08231 455 aa4.8□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W RDL2Q08742 149 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W YDL109CQ12103 647 aa4.8□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W YOR097CQ12274 175 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W TRM13Q12383 476 aa4.8□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W FOL3Q12676 427 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W HEM4P06174 275 aa4.79□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W SUI3P09064 285 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W SPS100P13130 326 aa4.79□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W MTR2P34232 184 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W CHK1P38147 527 aa4.79□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W YGP1P38616 354 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W YHL037CP38733 133 aa4.79□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W RRP4P38792 359 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W TRM5P38793 499 aa4.79□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W YHR097CP38809 366 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W YHR180WP38868 163 aa4.79□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W YHR218WP38899 603 aa4.79□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W YMR144WP40214 342 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W NUP57P48837 541 aa4.79□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W MPC1P53157 130 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W YNL033WP53964 284 aa4.79□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W YNL019CP53975 284 aa4.79□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W UTP21Q06078 939 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W ARO10Q06408 635 aa4.79□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W RAF1Q06891 181 aa4.79□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W YLR040CQ07988 224 aa4.79□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W SNX3Q08826 162 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
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