RNA–Protein interactions for RNA: YGR279C

SCW4, Transcript of Cell wall protein with similarity to glucanases, yeastyeast

Gene SCW4, Length 1,161 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SCW4YGR279C YKR015CP36111 568 aa4.83□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C MCM7P38132 845 aa4.83□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C YBR138CP38277 524 aa4.83□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C SBE22P38814 852 aa4.83□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C SKN7P38889 622 aa4.83□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C HIS6P40545 261 aa4.83□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C CIN1P40987 1014 aa4.83□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C BAP3P41815 604 aa4.83□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C SWP82P43554 623 aa4.83□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C MNN5P46982 586 aa4.83□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C VPS73P53142 486 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C COS1P53822 381 aa4.83□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C ASI1P54074 624 aa4.83□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C NOG1Q02892 647 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C YPL039WQ03080 316 aa4.83□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C YMR099CQ03161 297 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C RSN1Q03516 953 aa4.83□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C NUP53Q03790 475 aa4.83□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C DFG5Q05031 458 aa4.83□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C YLR346CQ06139 101 aa4.83□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C CYK3Q07533 885 aa4.83□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C IRC19Q07843 230 aa4.83□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C BDS1Q08347 646 aa4.83□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C PST2Q12335 198 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C PCL9Q12477 304 aa4.83□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C IRA1P18963 3092 aa4.82□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C QCR7P00128 127 aa4.82□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C CDC36P06100 191 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C ERD2P18414 219 aa4.82□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C UTR1P21373 530 aa4.82□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C CNA1P23287 553 aa4.82□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C CPR3P25719 182 aa4.82□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C RPS5P26783 225 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C MTC2P34246 357 aa4.82□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C VBA2P38358 474 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C TDA11P38854 504 aa4.82□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C MDM31P38880 579 aa4.82□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C CHL4P38907 458 aa4.82□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C KRE29P40026 464 aa4.82□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C MPH1P40562 993 aa4.82□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C STB1P42845 420 aa4.82□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C YJR115WP47152 169 aa4.82□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C TOS2P50078 622 aa4.82□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C MPA43P53583 542 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C YDR209CQ03480 137 aa4.82□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C EKI1Q03764 534 aa4.82□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C RVB1Q03940 463 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C RRP17Q04031 235 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C GAL83Q04739 417 aa4.82□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C ELP6Q04868 273 aa4.82□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C MRPL51Q06090 140 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C YLR345WQ06137 509 aa4.82□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C NEJ1Q06148 342 aa4.82□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C YPL191CQ08930 360 aa4.82□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C TGS1Q12052 315 aa4.82□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C YLR126CQ12288 251 aa4.82□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C SFG1Q12507 346 aa4.82□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C MTR10Q99189 972 aa4.82□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C TEL1P38110 2787 aa4.81□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C SAM35P14693 329 aa4.81□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C PDX1P16451 410 aa4.81□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C NCP1P16603 691 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C SCO1P23833 295 aa4.81□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C GSH1P32477 678 aa4.81□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C LYP1P32487 611 aa4.81□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C ECT1P33412 323 aa4.81□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C MOH1P38191 138 aa4.81□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C AMN1P38285 549 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C MTC4P38335 694 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C RPS20P38701 121 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C ECM34P38728 170 aa4.81□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C PTI1P39927 425 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C LEM3P42838 414 aa4.81□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C SNO3P43544 222 aa4.81□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C IRC5P43610 853 aa4.81□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C IRC7P43623 340 aa4.81□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C IKS1P47042 667 aa4.81□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C PGU1P47180 361 aa4.81□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C BUD17P53727 317 aa4.81□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C RSM28Q03430 361 aa4.81□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C DML1Q03652 475 aa4.81□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C SNO4Q04902 237 aa4.81□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C LUC7Q07508 261 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C SKI7Q08491 747 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C HSP33Q08914 237 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C NIP7Q08962 181 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C HSP32Q08992 237 aa4.81□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C HER1Q12276 1246 aa4.81□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C YDL007C-AQ2V2Q0 85 aa4.81□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C YGR161W-CQ3E744 92 aa4.81□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C RPL7AP05737 244 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C RPC40P07703 335 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C HMG1P12683 1054 aa4.8□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C DAT1P13483 248 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C MDH1P17505 334 aaKnown RBP RIP-Chip data4.8□□□□□ -1.64not detected
SCW4YGR279C YCK1P23291 538 aa4.8□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C YCR100CP25606 316 aa4.8□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C HSP30P25619 332 aa4.8□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C ECM4P36156 370 aa4.8□□□□□ -1.64
SCW4YGR279C YBR096WP38256 230 aa4.8□□□□□ -1.64
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