RNA–Protein interactions for RNA: YAL032C

PRP45, Transcript of Protein required for pre-mRNA splicing, yeastyeast

Gene PRP45, Length 1,140 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP45YAL032C YSA1Q01976 231 aa4.82□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C YMD8Q03697 442 aa4.82□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C NUP53Q03790 475 aa4.82□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C RIM13Q03792 727 aa4.82□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C YLR446WQ06204 433 aa4.82□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C ARO10Q06408 635 aa4.82□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C SWA2Q06677 668 aa4.82□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C RSC58Q07979 502 aa4.82□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C NBA1Q08229 501 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C FDH1Q08911 376 aa4.82□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C ENV7Q12003 364 aa4.82□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C AKR2Q12013 749 aa4.82□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C PRP46Q12417 451 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C YKL033W-AQ86ZR7 236 aa4.82□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C RPN13O13563 156 aa4.81□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C CYC7P00045 113 aa4.81□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C CDC9P04819 755 aa4.81□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C GCN3P14741 305 aa4.81□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C MDH1P17505 334 aaKnown RBP RIP-Chip data4.81□□□□□ -1.64not detected
PRP45YAL032C BUD5P25300 642 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C GIT1P25346 518 aa4.81□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C LST4P34239 828 aa4.81□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C TEF4P36008 412 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C YHR177WP38867 453 aa4.81□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C PEX7P39108 375 aa4.81□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C RRG9P40156 214 aa4.81□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C ALB1P47019 175 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C HMS2P47175 358 aa4.81□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C RPS12P48589 143 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C IMD3P50095 523 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C SPT20P50875 604 aa4.81□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C YGL260WP53056 76 aa4.81□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C YGR067CP53243 804 aa4.81□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C TPC1P53257 314 aa4.81□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C SUR7P54003 302 aa4.81□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C NUP49Q02199 472 aa4.81□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C NOP12Q08208 459 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C RCN2Q12044 265 aa4.81□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C MSL5Q12186 476 aaKnown RBP RIP-Chip data4.81□□□□□ -1.64not detected
PRP45YAL032C NFI1Q12216 726 aa4.81□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C RBD2Q12270 262 aa4.81□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C YLR126CQ12288 251 aa4.81□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C DCP1Q12517 231 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C GCN1P33892 2672 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C NFT1P0CE68 1218 aa4.8□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C ZWF1P11412 505 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C IDH1P28834 360 aaKnown RBP RIP-Chip data4.8□□□□□ -1.64not detected
PRP45YAL032C MKK1P32490 508 aa4.8□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C ORC2P32833 620 aa4.8□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C SEF1P34228 1148 aa4.8□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C MTC2P34246 357 aa4.8□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C TUL1P36096 758 aa4.8□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C IFA38P38286 347 aa4.8□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C CIN1P40987 1014 aa4.8□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C SNM1P40993 198 aa4.8□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C SSY5P47002 699 aa4.8□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C UBC9P50623 157 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C EXG2P52911 562 aa4.8□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C ARO8P53090 500 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C LCL3P53153 274 aa4.8□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C YDR514CQ04408 483 aa4.8□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C PEX10Q05568 337 aa4.8□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C YPR091CQ06833 770 aa4.8□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C BRE4Q07660 1125 aa4.8□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C YEH1Q07804 573 aa4.8□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C NGL1Q08213 363 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C GSH2Q08220 491 aa4.8□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C DCI1Q08558 271 aa4.8□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C YOR376WQ08900 122 aa4.8□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C SIA1Q12212 622 aa4.8□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C YBR056W-AI2HB52 66 aa4.79□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C PET9P18239 318 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C MCK1P21965 375 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C YIM1P28625 365 aa4.79□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C RPN2P32565 945 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C LHP1P33399 275 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C RCN1P36054 211 aa4.79□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C GPX2P38143 162 aa4.79□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C BIG1P38813 335 aa4.79□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C CHA4P43634 648 aa4.79□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C APS3P47064 194 aa4.79□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C OCA1P50946 238 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C YGR079WP53249 370 aa4.79□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C CPR8P53728 308 aa4.79□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C ABZ2Q03266 374 aa4.79□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C KRE28Q04431 385 aa4.79□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C YMR310CQ04867 317 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C YPR172WQ06608 200 aa4.79□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C CYK3Q07533 885 aa4.79□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C YOL024WQ08172 172 aa4.79□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C HSP42Q12329 375 aa4.79□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C YRM1Q12340 786 aa4.79□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C RPL20AP0CX23 172 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C RPL20BP0CX24 172 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C AAC3P18238 307 aa4.78□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C RPL24BP24000 155 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C STP22P25604 385 aa4.78□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C YCR102CP25608 368 aa4.78□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C PTC6P25646 442 aa4.78□□□□□ -1.64
PRP45YAL032C PCL2P25693 308 aa4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 54.9 ms