RNA–Protein interactions for RNA: YOR247W

SRL1, Transcript of Mannoprotein that exhibits a tight association with the cell wall, yeast

Gene SRL1, Length 633 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cellular bud, Cytoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SRL1	YOR247W	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SRL1	YOR247W	YDL206W	Q12424	762 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SRL1	YOR247W	MOD5	P07884	428 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SRL1	YOR247W	TPD3	P31383	635 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SRL1	YOR247W	HXT10	P43581	546 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SRL1	YOR247W	YPR097W	Q06839	1073 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SRL1	YOR247W	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SRL1	YOR247W	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SRL1	YOR247W	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SRL1	YOR247W	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SRL1	YOR247W	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SRL1	YOR247W	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SRL1	YOR247W	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SRL1	YOR247W	HED1	Q03937	162 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SRL1	YOR247W	MRX10	Q05648	414 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SRL1	YOR247W	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SRL1	YOR247W	TRK1	P12685	1235 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SRL1	YOR247W	RIM21	P48565	533 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SRL1	YOR247W	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
SRL1	YOR247W	CDC4	P07834	779 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SRL1	YOR247W	PUP1	P25043	261 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SRL1	YOR247W	KIP2	P28743	706 aa		5	□□□□□ -1.61
SRL1	YOR247W	TGL4	P36165	910 aa		5	□□□□□ -1.61
SRL1	YOR247W	ENV9	Q08651	330 aa		5	□□□□□ -1.61
SRL1	YOR247W	ATG3	P40344	310 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRL1	YOR247W	SRC1	Q03707	834 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRL1	YOR247W	PUS5	Q06244	254 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRL1	YOR247W	MCM16	Q12262	181 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRL1	YOR247W	IXR1	P33417	597 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRL1	YOR247W	MRX12	P47084	519 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRL1	YOR247W	GCR2	Q01722	534 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRL1	YOR247W	PEP12	P32854	288 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SRL1	YOR247W	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SRL1	YOR247W	YML083C	Q04526	418 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SRL1	YOR247W	VAC17	P25591	423 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SRL1	YOR247W	GUT2	P32191	649 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SRL1	YOR247W	EMP47	P43555	445 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SRL1	YOR247W	CLA4	P48562	842 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SRL1	YOR247W	HST3	P53687	447 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SRL1	YOR247W	ECM23	Q02710	187 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SRL1	YOR247W	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SRL1	YOR247W	HAT1	Q12341	374 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SRL1	YOR247W	TEC1	P18412	486 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRL1	YOR247W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SRL1	YOR247W	RTT106	P40161	455 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRL1	YOR247W	KTR7	P40504	517 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRL1	YOR247W	GAL2	P13181	574 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SRL1	YOR247W	AFT1	P22149	690 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SRL1	YOR247W	HEM3	P28789	327 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SRL1	YOR247W	ISF1	P32488	338 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SRL1	YOR247W	BRE2	P43132	505 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SRL1	YOR247W	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SRL1	YOR247W	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SRL1	YOR247W	ASH1	P34233	588 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SRL1	YOR247W	FRA1	Q07825	749 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SRL1	YOR247W	MET32	Q12041	191 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SRL1	YOR247W	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SRL1	YOR247W	UBX7	P38349	436 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SRL1	YOR247W	FIG4	P42837	879 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SRL1	YOR247W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SRL1	YOR247W	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SRL1	YOR247W	HAP4	P14064	554 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRL1	YOR247W	UGA3	P26370	528 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRL1	YOR247W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SRL1	YOR247W	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SRL1	YOR247W	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SRL1	YOR247W	PHO87	P25360	923 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRL1	YOR247W	AIM44	Q99299	758 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRL1	YOR247W	SEC20	P28791	383 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRL1	YOR247W	ASF1	P32447	279 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRL1	YOR247W	SOH1	P38633	127 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRL1	YOR247W	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SRL1	YOR247W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SRL1	YOR247W	KAR5	Q04746	504 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRL1	YOR247W	SRF1	Q12516	437 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRL1	YOR247W	YFL034W	P43564	1073 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRL1	YOR247W	YPR084W	Q06821	456 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRL1	YOR247W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRL1	YOR247W	TSC13	Q99190	310 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRL1	YOR247W	APL6	P46682	809 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRL1	YOR247W	APP1	P53933	587 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRL1	YOR247W	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SRL1	YOR247W	GAS4	Q08271	471 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRL1	YOR247W	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SRL1	YOR247W	VAN1	P23642	535 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SRL1	YOR247W	MKS1	P34072	584 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SRL1	YOR247W	YBL086C	P38177	466 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SRL1	YOR247W	YJR115W	P47152	169 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SRL1	YOR247W	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SRL1	YOR247W	ARG82	P07250	355 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SRL1	YOR247W	ERP5	P38819	212 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SRL1	YOR247W	PNP1	Q05788	311 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SRL1	YOR247W	PUN1	Q06991	263 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SRL1	YOR247W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SRL1	YOR247W	SRS2	P12954	1174 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SRL1	YOR247W	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SRL1	YOR247W	RRN6	P32786	894 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SRL1	YOR247W	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SRL1	YOR247W	ROM1	P53046	1155 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SRL1	YOR247W	YLR346C	Q06139	101 aa		4.83	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11 ms