RNA–Protein interactions for RNA: YMR001C-A

YMR001C-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR001C-A, Length 231 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR001C-AYMR001C-A IXR1P33417 597 aa6.65□□□□□ -1.34
YMR001C-AYMR001C-A RSC30P38781 883 aa6.65□□□□□ -1.34
YMR001C-AYMR001C-A GLY1P37303 387 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
YMR001C-AYMR001C-A CSN12P47130 423 aa6.63□□□□□ -1.35
YMR001C-AYMR001C-A ITT1Q04638 464 aa6.63□□□□□ -1.35
YMR001C-AYMR001C-A ARG8P18544 423 aa6.62□□□□□ -1.35
YMR001C-AYMR001C-A YLR346CQ06139 101 aa6.62□□□□□ -1.35
YMR001C-AYMR001C-A TY1A-BLQ12266 440 aa6.62□□□□□ -1.35
YMR001C-AYMR001C-A SRF1Q12516 437 aa6.62□□□□□ -1.35
YMR001C-AYMR001C-A MRT4P33201 236 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
YMR001C-AYMR001C-A NUP85P46673 744 aa6.61□□□□□ -1.35
YMR001C-AYMR001C-A VAC17P25591 423 aa6.59□□□□□ -1.35
YMR001C-AYMR001C-A SCW11P53189 542 aa6.59□□□□□ -1.35
YMR001C-AYMR001C-A RAD59Q12223 238 aa6.57□□□□□ -1.36
YMR001C-AYMR001C-A KIN1P13185 1064 aa6.56□□□□□ -1.36
YMR001C-AYMR001C-A MIP1P15801 1254 aa6.56□□□□□ -1.36
YMR001C-AYMR001C-A APP1P53933 587 aa6.56□□□□□ -1.36
YMR001C-AYMR001C-A FIG4P42837 879 aa6.53□□□□□ -1.36
YMR001C-AYMR001C-A LEU3P08638 886 aa6.51□□□□□ -1.37
YMR001C-AYMR001C-A YBL086CP38177 466 aa6.5□□□□□ -1.37
YMR001C-AYMR001C-A AAD14P42884 376 aa6.49□□□□□ -1.37
YMR001C-AYMR001C-A DLD1P32891 587 aa6.48□□□□□ -1.37
YMR001C-AYMR001C-A GUA1P38625 525 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
YMR001C-AYMR001C-A ICP55P40051 511 aa6.48□□□□□ -1.37
YMR001C-AYMR001C-A EMW1P42842 904 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
YMR001C-AYMR001C-A SSA2P10592 639 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
YMR001C-AYMR001C-A YJR098CP47139 656 aa6.47□□□□□ -1.37
YMR001C-AYMR001C-A LSC2P53312 427 aa6.47□□□□□ -1.37
YMR001C-AYMR001C-A CCP1P00431 361 aa6.46□□□□□ -1.38
YMR001C-AYMR001C-A TEC1P18412 486 aa6.46□□□□□ -1.38
YMR001C-AYMR001C-A LSB3P43603 459 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
YMR001C-AYMR001C-A TCB1Q12466 1186 aa6.46□□□□□ -1.38
YMR001C-AYMR001C-A MDJ1P35191 511 aa6.45□□□□□ -1.38
YMR001C-AYMR001C-A ROG3P43602 733 aa6.45□□□□□ -1.38
YMR001C-AYMR001C-A UBP2Q01476 1272 aa6.45□□□□□ -1.38
YMR001C-AYMR001C-A YPR084WQ06821 456 aa6.45□□□□□ -1.38
YMR001C-AYMR001C-A ARG82P07250 355 aa6.44□□□□□ -1.38
YMR001C-AYMR001C-A RPN1P38764 993 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
YMR001C-AYMR001C-A RTT106P40161 455 aa6.44□□□□□ -1.38
YMR001C-AYMR001C-A TY1A-MR1Q04215 440 aa6.44□□□□□ -1.38
YMR001C-AYMR001C-A MAK16P10962 306 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
YMR001C-AYMR001C-A DFG5Q05031 458 aa6.43□□□□□ -1.38
YMR001C-AYMR001C-A MKS1P34072 584 aa6.42□□□□□ -1.38
YMR001C-AYMR001C-A OSH7P38755 437 aa6.42□□□□□ -1.38
YMR001C-AYMR001C-A YPR204WQ08995 1032 aa6.42□□□□□ -1.38
YMR001C-AYMR001C-A PUS1Q12211 544 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
YMR001C-AYMR001C-A DPH6Q12429 685 aa6.39□□□□□ -1.39
YMR001C-AYMR001C-A GUT2P32191 649 aa6.38□□□□□ -1.39
YMR001C-AYMR001C-A FBP26P32604 452 aa6.36□□□□□ -1.39
YMR001C-AYMR001C-A NAM8Q00539 523 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
YMR001C-AYMR001C-A BDS1Q08347 646 aa6.36□□□□□ -1.39
YMR001C-AYMR001C-A ISF1P32488 338 aa6.35□□□□□ -1.39
YMR001C-AYMR001C-A NAF1P53919 492 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
YMR001C-AYMR001C-A TFB3Q03290 321 aa6.34□□□□□ -1.39
YMR001C-AYMR001C-A STE20Q03497 939 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
YMR001C-AYMR001C-A ATG20Q07528 640 aa6.34□□□□□ -1.39
YMR001C-AYMR001C-A PHM7Q12252 991 aa6.34□□□□□ -1.39
YMR001C-AYMR001C-A STE6P12866 1290 aa6.33□□□□□ -1.4
YMR001C-AYMR001C-A PKC1P24583 1151 aa6.33□□□□□ -1.4
YMR001C-AYMR001C-A YBL036CP38197 257 aa6.33□□□□□ -1.4
YMR001C-AYMR001C-A JJJ3P47138 172 aa6.33□□□□□ -1.4
YMR001C-AYMR001C-A HPC2Q01448 625 aa6.33□□□□□ -1.4
YMR001C-AYMR001C-A FRA1Q07825 749 aa6.33□□□□□ -1.4
YMR001C-AYMR001C-A YDJ1P25491 409 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
YMR001C-AYMR001C-A CSE4P36012 229 aa6.32□□□□□ -1.4
YMR001C-AYMR001C-A YFL066CP43538 392 aa6.32□□□□□ -1.4
YMR001C-AYMR001C-A LYS5P50113 272 aa6.32□□□□□ -1.4
YMR001C-AYMR001C-A ISU1Q03020 165 aa6.32□□□□□ -1.4
YMR001C-AYMR001C-A EMP47P43555 445 aa6.31□□□□□ -1.4
YMR001C-AYMR001C-A BRL1P38770 471 aa6.3□□□□□ -1.4
YMR001C-AYMR001C-A CDC19P00549 500 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
YMR001C-AYMR001C-A NSG2P53898 299 aa6.29□□□□□ -1.4
YMR001C-AYMR001C-A MCM16Q12262 181 aa6.29□□□□□ -1.4
YMR001C-AYMR001C-A NRD1P53617 575 aaKnown RBP RIP-Chip data6.28□□□□□ -1.4not detected
YMR001C-AYMR001C-A ISR1Q06098 443 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
YMR001C-AYMR001C-A THI72Q08579 599 aa6.27□□□□□ -1.41
YMR001C-AYMR001C-A BIO2P32451 375 aa6.26□□□□□ -1.41
YMR001C-AYMR001C-A CCT8P47079 568 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
YMR001C-AYMR001C-A SPT5P27692 1063 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
YMR001C-AYMR001C-A HAL5P38970 855 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
YMR001C-AYMR001C-A YNL108CP53929 270 aa6.24□□□□□ -1.41
YMR001C-AYMR001C-A DLD3P39976 496 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
YMR001C-AYMR001C-A APL6P46682 809 aa6.23□□□□□ -1.41
YMR001C-AYMR001C-A WTM2Q12206 467 aa6.23□□□□□ -1.41
YMR001C-AYMR001C-A DAT1P13483 248 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
YMR001C-AYMR001C-A MRX12P47084 519 aa6.21□□□□□ -1.42
YMR001C-AYMR001C-A CUZ1P53899 274 aa6.21□□□□□ -1.42
YMR001C-AYMR001C-A ENO2P00925 437 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
YMR001C-AYMR001C-A DAL1P32375 460 aa6.2□□□□□ -1.42
YMR001C-AYMR001C-A UTR2P32623 467 aa6.2□□□□□ -1.42
YMR001C-AYMR001C-A SOH1P38633 127 aa6.2□□□□□ -1.42
YMR001C-AYMR001C-A AI1P03875 834 aa6.19□□□□□ -1.42
YMR001C-AYMR001C-A SUP45P12385 437 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
YMR001C-AYMR001C-A VTC4P47075 721 aa6.19□□□□□ -1.42
YMR001C-AYMR001C-A RPP2BP02400 110 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
YMR001C-AYMR001C-A SPT2P06843 333 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
YMR001C-AYMR001C-A SSN3P39073 555 aa6.18□□□□□ -1.42
YMR001C-AYMR001C-A UTP7P40055 554 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
YMR001C-AYMR001C-A YJL007CP47080 104 aa6.18□□□□□ -1.42
YMR001C-AYMR001C-A SLA1P32790 1244 aa6.15□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 26.7 ms