RNA–Protein interactions for RNA: YKR018C

YKR018C, Transcript of Protein of unknown function, yeastyeast

Gene YKR018C, Length 2,178 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR018CYKR018C TPM2P40414 161 aa8.67□□□□□ -1.02
YKR018CYKR018C GCR2Q01722 534 aa8.66□□□□□ -1.02
YKR018CYKR018C RPN12P32496 274 aa8.65□□□□□ -1.02
YKR018CYKR018C BDH2P39713 417 aa8.65□□□□□ -1.02
YKR018CYKR018C VPS20Q04272 221 aa8.65□□□□□ -1.02
YKR018CYKR018C RPN1P38764 993 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
YKR018CYKR018C HXT13P39924 564 aa8.65□□□□□ -1.03
YKR018CYKR018C KRE33P53914 1056 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
YKR018CYKR018C TAP42Q04372 366 aa8.64□□□□□ -1.03
YKR018CYKR018C ECM16Q04217 1267 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
YKR018CYKR018C ESC2Q06340 456 aa8.63□□□□□ -1.03
YKR018CYKR018C HXT17P53631 564 aa8.63□□□□□ -1.03
YKR018CYKR018C MIC60P36112 540 aa8.62□□□□□ -1.03
YKR018CYKR018C IPL1P38991 367 aa8.62□□□□□ -1.03
YKR018CYKR018C HST1P53685 503 aa8.62□□□□□ -1.03
YKR018CYKR018C HOS3Q02959 697 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
YKR018CYKR018C HRQ1Q05549 1077 aa8.62□□□□□ -1.03
YKR018CYKR018C RFC1P38630 861 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
YKR018CYKR018C SPO1P53541 631 aa8.61□□□□□ -1.03
YKR018CYKR018C PDI1P17967 522 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
YKR018CYKR018C PPH3P32345 308 aa8.61□□□□□ -1.03
YKR018CYKR018C SMC3P47037 1230 aa8.6□□□□□ -1.03
YKR018CYKR018C RCM1P53972 490 aa8.6□□□□□ -1.03
YKR018CYKR018C APC11Q12157 165 aa8.59□□□□□ -1.03
YKR018CYKR018C KEX1P09620 729 aa8.58□□□□□ -1.04
YKR018CYKR018C DID4P36108 232 aa8.58□□□□□ -1.04
YKR018CYKR018C NMD2P38798 1089 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
YKR018CYKR018C YNG2P38806 282 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
YKR018CYKR018C CSI1Q04368 295 aa8.58□□□□□ -1.04
YKR018CYKR018C APC1P53886 1748 aa8.58□□□□□ -1.04
YKR018CYKR018C LYS2P07702 1392 aa8.58□□□□□ -1.04
YKR018CYKR018C CWH41P53008 833 aa8.58□□□□□ -1.04
YKR018CYKR018C SSL2Q00578 843 aa8.58□□□□□ -1.04
YKR018CYKR018C TRL1P09880 827 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
YKR018CYKR018C BIK1P11709 440 aa8.57□□□□□ -1.04
YKR018CYKR018C LTV1P34078 463 aa8.57□□□□□ -1.04
YKR018CYKR018C CYC8P14922 966 aa8.56□□□□□ -1.04
YKR018CYKR018C TCD1P38756 429 aa8.56□□□□□ -1.04
YKR018CYKR018C RSM25P40496 264 aa8.56□□□□□ -1.04
YKR018CYKR018C STU2P46675 888 aa8.56□□□□□ -1.04
YKR018CYKR018C RNR2P09938 399 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
YKR018CYKR018C CLB5P30283 435 aa8.56□□□□□ -1.04
YKR018CYKR018C CIN4P39110 191 aa8.56□□□□□ -1.04
YKR018CYKR018C DSD1P53095 428 aa8.56□□□□□ -1.04
YKR018CYKR018C SRT1Q03175 343 aa8.56□□□□□ -1.04
YKR018CYKR018C NOP53Q12080 455 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
YKR018CYKR018C TIM50Q02776 476 aa8.55□□□□□ -1.04
YKR018CYKR018C MRPL10P36520 322 aa8.55□□□□□ -1.04
YKR018CYKR018C HYR1P40581 163 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
YKR018CYKR018C RPO41P13433 1351 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
YKR018CYKR018C GRX4P32642 244 aa8.54□□□□□ -1.04
YKR018CYKR018C MFT1P33441 392 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
YKR018CYKR018C GYP7P48365 746 aa8.54□□□□□ -1.04
YKR018CYKR018C CWC22P53333 577 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
YKR018CYKR018C SFI1Q12369 946 aa8.54□□□□□ -1.04
YKR018CYKR018C MNR2P35724 969 aa8.54□□□□□ -1.04
YKR018CYKR018C PBY1P38254 753 aa8.54□□□□□ -1.04
YKR018CYKR018C YBR287WP38355 427 aa8.53□□□□□ -1.04
YKR018CYKR018C BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data8.53□□□□□ -1.04not detected
YKR018CYKR018C KRI1P42846 591 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
YKR018CYKR018C MPE1P35728 441 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
YKR018CYKR018C MRX12P47084 519 aa8.52□□□□□ -1.04
YKR018CYKR018C SPB4P25808 606 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
YKR018CYKR018C LEU2P04173 364 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
YKR018CYKR018C AKL1P38080 1108 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
YKR018CYKR018C RTF1P53064 558 aa8.51□□□□□ -1.05
YKR018CYKR018C VPS60Q03390 229 aa8.51□□□□□ -1.05
YKR018CYKR018C UTP13Q05946 817 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
YKR018CYKR018C PEX19Q07418 342 aa8.51□□□□□ -1.05
YKR018CYKR018C NOP14Q99207 810 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
YKR018CYKR018C RPS19AP07280 144 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
YKR018CYKR018C RPS19BP07281 144 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
YKR018CYKR018C CDC16P09798 840 aa8.51□□□□□ -1.05
YKR018CYKR018C GAS4Q08271 471 aa8.51□□□□□ -1.05
YKR018CYKR018C RRP5Q05022 1729 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
YKR018CYKR018C VAS1P07806 1104 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
YKR018CYKR018C MBR1P23493 339 aa8.5□□□□□ -1.05
YKR018CYKR018C YIL177CP40434 1758 aa8.5□□□□□ -1.05
YKR018CYKR018C YJL225CP40889 1758 aa8.5□□□□□ -1.05
YKR018CYKR018C SES1P07284 462 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
YKR018CYKR018C CEP3P40969 608 aa8.49□□□□□ -1.05
YKR018CYKR018C YGR122WP53272 402 aa8.49□□□□□ -1.05
YKR018CYKR018C YRF1-2P40105 1681 aa8.48□□□□□ -1.05
YKR018CYKR018C RNA1P11745 407 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
YKR018CYKR018C YNL050CP53952 270 aa8.48□□□□□ -1.05
YKR018CYKR018C FRS2P15625 503 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
YKR018CYKR018C MED8P38304 223 aa8.48□□□□□ -1.05
YKR018CYKR018C ECM1P39715 212 aa8.48□□□□□ -1.05
YKR018CYKR018C ZDS1P50111 915 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
YKR018CYKR018C TRS33Q99394 268 aa8.48□□□□□ -1.05
YKR018CYKR018C SWE1P32944 819 aa8.47□□□□□ -1.05
YKR018CYKR018C NPR3P38742 1146 aa8.47□□□□□ -1.05
YKR018CYKR018C FPR4Q06205 392 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
YKR018CYKR018C CLB1P24868 471 aa8.46□□□□□ -1.05
YKR018CYKR018C RAD24P32641 659 aa8.46□□□□□ -1.05
YKR018CYKR018C MTR4P47047 1073 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
YKR018CYKR018C ATE1P16639 503 aa8.46□□□□□ -1.06
YKR018CYKR018C DEP1P31385 405 aa8.46□□□□□ -1.06
YKR018CYKR018C CCT5P40413 562 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
YKR018CYKR018C YGL082WP53155 381 aa8.45□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22.9 ms