RNA–Protein interactions for RNA: YJL064W

YJL064W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YJL064W, Length 396 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJL064W	YJL064W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
YJL064W	YJL064W	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
YJL064W	YJL064W	RTF1	P53064	558 aa		11.75	□□□□□ -0.53
YJL064W	YJL064W	YKL222C	P35995	705 aa		11.74	□□□□□ -0.53
YJL064W	YJL064W	ERT1	P38140	529 aa		11.74	□□□□□ -0.53
YJL064W	YJL064W	PEX21	P50091	288 aa		11.74	□□□□□ -0.53
YJL064W	YJL064W	CWH41	P53008	833 aa		11.74	□□□□□ -0.53
YJL064W	YJL064W	FKH1	P40466	484 aa		11.73	□□□□□ -0.53
YJL064W	YJL064W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
YJL064W	YJL064W	PUS5	Q06244	254 aa		11.72	□□□□□ -0.53
YJL064W	YJL064W	AUS1	Q08409	1394 aa		11.7	□□□□□ -0.54
YJL064W	YJL064W	RRT14	P40470	206 aa		11.7	□□□□□ -0.54
YJL064W	YJL064W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
YJL064W	YJL064W	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
YJL064W	YJL064W	SCT1	P32784	759 aa		11.67	□□□□□ -0.54
YJL064W	YJL064W	YBP2	P53169	641 aa		11.67	□□□□□ -0.54
YJL064W	YJL064W	GRX4	P32642	244 aa		11.65	□□□□□ -0.54
YJL064W	YJL064W	HIM1	Q06674	414 aa		11.65	□□□□□ -0.54
YJL064W	YJL064W	RTG3	P38165	486 aa		11.64	□□□□□ -0.55
YJL064W	YJL064W	TAP42	Q04372	366 aa		11.64	□□□□□ -0.55
YJL064W	YJL064W	CTI6	Q08923	506 aa		11.64	□□□□□ -0.55
YJL064W	YJL064W	FPK1	P53739	893 aa		11.63	□□□□□ -0.55
YJL064W	YJL064W	NYV1	Q12255	253 aa		11.63	□□□□□ -0.55
YJL064W	YJL064W	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
YJL064W	YJL064W	NST1	P53935	1240 aa		11.6	□□□□□ -0.55
YJL064W	YJL064W	NUP145	P49687	1317 aa		11.59	□□□□□ -0.55
YJL064W	YJL064W	SLI15	P38283	698 aa		11.58	□□□□□ -0.56
YJL064W	YJL064W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	11.57	□□□□□ -0.56
YJL064W	YJL064W	PFF1	P38244	976 aa		11.57	□□□□□ -0.56
YJL064W	YJL064W	BUB1	P41695	1021 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.57	□□□□□ -0.56	not detected
YJL064W	YJL064W	TOP1	P04786	769 aa		11.56	□□□□□ -0.56
YJL064W	YJL064W	TOM1	Q03280	3268 aa		11.55	□□□□□ -0.56
YJL064W	YJL064W	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.55	□□□□□ -0.56	not detected
YJL064W	YJL064W	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	11.54	□□□□□ -0.56
YJL064W	YJL064W	TEA1	P47988	759 aa		11.53	□□□□□ -0.56
YJL064W	YJL064W	DSD1	P53095	428 aa		11.53	□□□□□ -0.56
YJL064W	YJL064W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	11.52	□□□□□ -0.57
YJL064W	YJL064W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	11.52	□□□□□ -0.57
YJL064W	YJL064W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	11.52	□□□□□ -0.57
YJL064W	YJL064W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
YJL064W	YJL064W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
YJL064W	YJL064W	ATG20	Q07528	640 aa		11.51	□□□□□ -0.57
YJL064W	YJL064W	CTF4	Q01454	927 aa		11.5	□□□□□ -0.57
YJL064W	YJL064W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
YJL064W	YJL064W	ERO1	Q03103	563 aa		11.48	□□□□□ -0.57
YJL064W	YJL064W	RMT2	Q03305	412 aa		11.48	□□□□□ -0.57
YJL064W	YJL064W	YLR278C	Q05854	1341 aa		11.47	□□□□□ -0.57
YJL064W	YJL064W	SHC1	P39000	512 aa		11.47	□□□□□ -0.57
YJL064W	YJL064W	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
YJL064W	YJL064W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
YJL064W	YJL064W	NOP53	Q12080	455 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
YJL064W	YJL064W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
YJL064W	YJL064W	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
YJL064W	YJL064W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
YJL064W	YJL064W	YKU70	P32807	602 aa		11.44	□□□□□ -0.58
YJL064W	YJL064W	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
YJL064W	YJL064W	IRC3	Q06683	689 aa		11.44	□□□□□ -0.58
YJL064W	YJL064W	UTP10	P42945	1769 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
YJL064W	YJL064W	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
YJL064W	YJL064W	MDG1	P53885	366 aa		11.43	□□□□□ -0.58
YJL064W	YJL064W	BDF2	Q07442	638 aa		11.43	□□□□□ -0.58
YJL064W	YJL064W	PHM7	Q12252	991 aa		11.43	□□□□□ -0.58
YJL064W	YJL064W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
YJL064W	YJL064W	VHR2	P40041	505 aa		11.42	□□□□□ -0.58
YJL064W	YJL064W	YGL082W	P53155	381 aa		11.42	□□□□□ -0.58
YJL064W	YJL064W	PMD1	P32634	1753 aa		11.41	□□□□□ -0.58
YJL064W	YJL064W	AOS1	Q06624	347 aa		11.41	□□□□□ -0.58
YJL064W	YJL064W	ALE1	Q08548	619 aa		11.41	□□□□□ -0.58
YJL064W	YJL064W	POM152	P39685	1337 aa		11.4	□□□□□ -0.58
YJL064W	YJL064W	SIT4	P20604	311 aa		11.4	□□□□□ -0.58
YJL064W	YJL064W	DIP2	Q12220	943 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
YJL064W	YJL064W	KCC4	P25389	1037 aa		11.38	□□□□□ -0.59
YJL064W	YJL064W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
YJL064W	YJL064W	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
YJL064W	YJL064W	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
YJL064W	YJL064W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
YJL064W	YJL064W	GRX6	Q12438	231 aa		11.36	□□□□□ -0.59
YJL064W	YJL064W	PDS5	Q04264	1277 aa		11.35	□□□□□ -0.59
YJL064W	YJL064W	NTH2	P35172	780 aa		11.34	□□□□□ -0.59
YJL064W	YJL064W	YIL089W	P40500	205 aa		11.34	□□□□□ -0.59
YJL064W	YJL064W	FET4	P40988	552 aa		11.33	□□□□□ -0.6
YJL064W	YJL064W	SSP2	Q08646	371 aa		11.33	□□□□□ -0.6
YJL064W	YJL064W	DCD1	P06773	312 aa		11.32	□□□□□ -0.6
YJL064W	YJL064W	MSM1	P22438	575 aa		11.32	□□□□□ -0.6
YJL064W	YJL064W	ARG8	P18544	423 aa		11.31	□□□□□ -0.6
YJL064W	YJL064W	UBP16	Q02863	499 aa		11.31	□□□□□ -0.6
YJL064W	YJL064W	SDH2	P21801	266 aa		11.3	□□□□□ -0.6
YJL064W	YJL064W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
YJL064W	YJL064W	GLC3	P32775	704 aa		11.3	□□□□□ -0.6
YJL064W	YJL064W	DPL1	Q05567	589 aa		11.3	□□□□□ -0.6
YJL064W	YJL064W	FIG2	P25653	1609 aa		11.3	□□□□□ -0.6
YJL064W	YJL064W	TRK1	P12685	1235 aa		11.29	□□□□□ -0.6
YJL064W	YJL064W	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
YJL064W	YJL064W	AIM7	Q12156	149 aa		11.28	□□□□□ -0.6
YJL064W	YJL064W	TIM50	Q02776	476 aa		11.27	□□□□□ -0.61
YJL064W	YJL064W	SAS4	Q04003	481 aa		11.27	□□□□□ -0.61
YJL064W	YJL064W	PEA2	P40091	420 aa		11.26	□□□□□ -0.61
YJL064W	YJL064W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
YJL064W	YJL064W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
YJL064W	YJL064W	YPR204W	Q08995	1032 aa		11.25	□□□□□ -0.61

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