RNA–Protein interactions for RNA: tM(CAU)Q1

tM(CAU)Q1, Transcript of Mitochondrial methionine tRNA (tRNA-Met), yeastyeast

Gene tM(CAU)Q1, Length 76 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 SLM3Q12093 417 aa-0.27□□□□□ -2.45
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 DCP1Q12517 231 aaPredicted RBP-0.27□□□□□ -2.45
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 RPL12AP0CX53 165 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 RPL12BP0CX54 165 aa-0.28□□□□□ -2.45
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 SLM5P25345 492 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 DOA1P36037 715 aa-0.28□□□□□ -2.45
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 IST2P38250 946 aa-0.28□□□□□ -2.45
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 YJR146WP47174 117 aa-0.28□□□□□ -2.45
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 INM2Q05533 292 aa-0.28□□□□□ -2.45
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 YNL040WP53960 456 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 YLH47Q06493 454 aa-0.29□□□□□ -2.46
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 ARF1P11076 181 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 CLC1P17891 233 aa-0.3□□□□□ -2.46
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 CTM1P38818 585 aa-0.3□□□□□ -2.46
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 YIL054WP40524 105 aa-0.3□□□□□ -2.46
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 MOB2P43563 287 aa-0.3□□□□□ -2.46
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 YFR018CP43599 363 aa-0.3□□□□□ -2.46
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 SUR7P54003 302 aa-0.3□□□□□ -2.46
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 SUE1Q06524 206 aa-0.3□□□□□ -2.46
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 MTR10Q99189 972 aa-0.3□□□□□ -2.46
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 ISN1Q99312 450 aa-0.3□□□□□ -2.46
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 CDC42P19073 191 aa-0.31□□□□□ -2.46
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 SCO1P23833 295 aa-0.31□□□□□ -2.46
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 MMS21P38632 267 aa-0.31□□□□□ -2.46
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 EFM1P38732 585 aa-0.31□□□□□ -2.46
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 ARF3P40994 183 aaRIP-Chip data-0.31□□□□□ -2.46not detected
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 YGL118CP53132 145 aa-0.31□□□□□ -2.46
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 LSG1P53145 640 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 FMP48P53233 369 aa-0.31□□□□□ -2.46
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 IMH1Q06704 911 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 YOR012WQ12351 137 aa-0.31□□□□□ -2.46
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 TY3A-GQ12173 290 aa-0.32□□□□□ -2.46
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 TY3A-IQ99219 290 aa-0.32□□□□□ -2.46
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 VPS63O13549 108 aa-0.33□□□□□ -2.46
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 HIT1P46973 164 aa-0.33□□□□□ -2.46
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 ERO1Q03103 563 aa-0.33□□□□□ -2.46
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 DON1Q05610 365 aa-0.33□□□□□ -2.46
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 RUP1Q12242 671 aa-0.33□□□□□ -2.46
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 ITR2P30606 609 aa-0.34□□□□□ -2.46
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 BYE1P36106 594 aa-0.34□□□□□ -2.46
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 LCB2P40970 561 aa-0.34□□□□□ -2.46
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 MIC19P43594 170 aa-0.34□□□□□ -2.46
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 TOM22P49334 152 aa-0.34□□□□□ -2.46
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 RPT4P53549 437 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 PRP3Q03338 469 aaPredicted RBP-0.34□□□□□ -2.46
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 TRM82Q03774 444 aa-0.34□□□□□ -2.46
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 URC2Q04411 772 aa-0.34□□□□□ -2.46
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 AEP3Q12089 606 aa-0.34□□□□□ -2.46
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 PRE7P23724 241 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 URA10P30402 227 aa-0.35□□□□□ -2.47
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 RFT1P38206 574 aaPredicted RBP-0.35□□□□□ -2.47
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 OLA1P38219 394 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 QDR3P38227 689 aa-0.35□□□□□ -2.47
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 AQR1P53943 586 aa-0.35□□□□□ -2.47
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 YPL150WQ12152 901 aa-0.35□□□□□ -2.47
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 UBR2Q07963 1872 aa-0.35□□□□□ -2.47
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 CLB3P24870 427 aa-0.36□□□□□ -2.47
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 HSP104P31539 908 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 RIM1P32445 135 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 SER3P40054 469 aa-0.36□□□□□ -2.47
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 RNA1P11745 407 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 CKA1P15790 372 aa-0.37□□□□□ -2.47
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 CAB3P36076 571 aa-0.37□□□□□ -2.47
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 SDS23P53172 527 aa-0.37□□□□□ -2.47
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 TIM22Q12328 207 aa-0.37□□□□□ -2.47
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 NRP1P32770 719 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.38□□□□□ -2.47not detected
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 YSC83P32792 385 aa-0.38□□□□□ -2.47
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 YKL071WP36086 256 aa-0.38□□□□□ -2.47
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 ZTA1P38230 334 aaKnown RBP-0.38□□□□□ -2.47
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 GRE3P38715 327 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.38□□□□□ -2.47not detected
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 ACT1P60010 375 aaKnown RBP-0.38□□□□□ -2.47
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 ROY1Q04847 553 aa-0.38□□□□□ -2.47
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 DET1Q99288 334 aaKnown RBP-0.38□□□□□ -2.47
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 RPL26AP05743 127 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 SLM1P40485 686 aa-0.39□□□□□ -2.47
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 RPL26BP53221 127 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 ALE1Q08548 619 aa-0.39□□□□□ -2.47
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 DSE2P38844 325 aa-0.4□□□□□ -2.47
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 UTP9P38882 575 aaKnown RBP-0.4□□□□□ -2.47
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 DSE1P40077 573 aa-0.4□□□□□ -2.47
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 YDR341CQ05506 607 aaKnown RBP-0.4□□□□□ -2.47
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 NSE1Q07913 336 aa-0.4□□□□□ -2.47
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 MED2Q12124 431 aa-0.4□□□□□ -2.47
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 YRF1-4O13559 1382 aa-0.41□□□□□ -2.47
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 YER188C-AP0C0V2 99 aa-0.41□□□□□ -2.48
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 YOL163WP0CF20 169 aa-0.41□□□□□ -2.48
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 SLM4P38247 162 aa-0.41□□□□□ -2.48
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 EBS1Q03466 884 aaKnown RBP-0.41□□□□□ -2.48
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 SMF2P38778 549 aa-0.42□□□□□ -2.48
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 RSC1P53236 928 aa-0.42□□□□□ -2.48
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 SLM2P53955 656 aa-0.42□□□□□ -2.48
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 NUP49Q02199 472 aa-0.42□□□□□ -2.48
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 TPC1P53257 314 aa-0.43□□□□□ -2.48
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 TAF10Q12030 206 aa-0.43□□□□□ -2.48
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 PRR2Q12310 699 aa-0.43□□□□□ -2.48
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 AFI1Q99222 893 aa-0.43□□□□□ -2.48
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 DAP2P18962 818 aa-0.44□□□□□ -2.48
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 YCR051WP25631 222 aa-0.44□□□□□ -2.48
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 RPN8Q08723 338 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 UBA3Q99344 299 aa-0.44□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.3 ms