RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W PTC2P39966 464 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W YJL068CP40363 299 aa9.63□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W YIL165CP40446 119 aa9.63□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W MAL11P53048 616 aa9.63□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W SWC4P53201 476 aa9.63□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W YNR065CP53751 1116 aa9.63□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W YPL014WQ02606 381 aa9.63□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W BOP2Q06150 570 aa9.63□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W YLR108CQ12259 485 aa9.63□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W WHI5Q12416 295 aa9.63□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W RDI1Q12434 202 aa9.63□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W UBR1P19812 1950 aa9.63□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W YCP4P25349 247 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W POT1P27796 417 aaKnown RBP RIP-Chip data9.63□□□□□ -0.87not detected
PRP4YPR178W DOA4P32571 926 aa9.63□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W PDC2P32896 925 aa9.63□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W SFC1P33303 322 aa9.63□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W PAU24P38155 120 aa9.63□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W YPT35P38815 214 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W DMA1P38823 416 aa9.63□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W NSG1P38837 291 aa9.63□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W CHL4P38907 458 aa9.63□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W PFA3P42836 336 aa9.63□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W LOH1P47055 219 aa9.63□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W BAT2P47176 376 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W PMT5P52867 743 aa9.63□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W INN1P53901 409 aa9.63□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W YMR178WQ03219 274 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W VBA1Q04301 562 aa9.63□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W DCR2Q05924 578 aa9.63□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W UTP21Q06078 939 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W YPR084WQ06821 456 aa9.63□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W YGR161W-CQ3E744 92 aa9.63□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W CAN1P04817 590 aa9.62□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W CHL1P22516 861 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W APN1P22936 367 aa9.62□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W YHR122WP38829 231 aa9.62□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W AXL2P38928 823 aa9.62□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W PHB1P40961 287 aa9.62□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W PAM16P42949 149 aa9.62□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W SDT1P53078 280 aa9.62□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W SYF2P53277 215 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W SAY1P53324 424 aa9.62□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W CWC24P53769 259 aa9.62□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W MTQ1P53944 314 aa9.62□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W EMI2Q04409 500 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W FRE6Q12473 712 aa9.62□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W CDC9P04819 755 aa9.61□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W COQ2P32378 372 aa9.61□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W ECM25P32525 599 aa9.61□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W SRB6P32570 121 aa9.61□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W GMH1P36125 273 aa9.61□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W MRPL36P36531 177 aa9.61□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W YBR238CP38330 731 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W AIM2P39721 246 aa9.61□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W POP1P41812 875 aa9.61□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W MRPS18P42847 217 aa9.61□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W FAA4P47912 694 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W KXD1P53158 218 aa9.61□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W CSL4P53859 292 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W RSF1Q05043 376 aa9.61□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W RSC58Q07979 502 aa9.61□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W YDL007C-AQ2V2Q0 85 aa9.61□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W PDA1P16387 420 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W PRP2P20095 876 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W PDE1P22434 369 aa9.6□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W YCR061WP25639 631 aa9.6□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W DTR1P38125 572 aa9.6□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W THI2P38141 450 aa9.6□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W IML3P38265 245 aa9.6□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W APQ12P40532 138 aa9.6□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W HIS6P40545 261 aa9.6□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W GLR1P41921 483 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W PGA1P53896 198 aa9.6□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W RSM28Q03430 361 aa9.6□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W SPC3Q12133 184 aa9.6□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W PER33Q12144 273 aa9.6□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W YRM1Q12340 786 aa9.6□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W YDR524C-BQ3E6R4 66 aa9.6□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W YOS9Q99220 542 aa9.6□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W TDH1P00360 332 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W STE7P06784 515 aa9.59□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W PET494P07390 489 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W AAC3P18238 307 aa9.59□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W KKQ8P36004 724 aa9.59□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W PTH1P38876 190 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W GIM4P40005 111 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W AZF1P41696 914 aa9.59□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W PRM10P42946 383 aa9.59□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W CAF16P43569 289 aa9.59□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W DOC1P53068 250 aa9.59□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W EMC4P53073 190 aa9.59□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W HHO1P53551 258 aa9.59□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W NAM8Q00539 523 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W SKI7Q08491 747 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W YOR289WQ12012 251 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W TPO4Q12256 659 aa9.59□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W INP53Q12271 1107 aa9.59□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W YOL162WP0CF19 215 aa9.58□□□□□ -0.88
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