RNA–Protein interactions for RNA: YPL178W

CBC2, Transcript of Small subunit of the heterodimeric cap binding complex with Sto1p, yeast

Gene CBC2, Length 627 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CBC2	YPL178W	YDL211C	Q12121	372 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	PNS1	Q12412	539 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	MTR10	Q99189	972 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	FPS1	P23900	669 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	ADH7	P25377	361 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	HSP150	P32478	413 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	APD1	P38281	316 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	TDA11	P38854	504 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	SWD1	P39706	426 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	FAR7	P43592	221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	RMR1	P53060	241 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	YDR541C	Q03049	344 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	TFB3	Q03290	321 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	MIX14	Q04341	121 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	PLM2	Q04383	521 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	YDL218W	Q07629	317 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	AVO1	Q08236	1176 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	RSA1	Q08932	381 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	SFG1	Q12507	346 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	ERD2	P18414	219 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	ITR2	P30606	609 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	SNC1	P31109	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	APE4	P38821	490 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	YIL166C	P40445	542 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	VHR1	P40522	640 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	REE1	P40893	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	AGP3	P43548	558 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	RPE1	P46969	238 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	YJR142W	P47173	342 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	TOS2	P50078	622 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	ASI1	P54074	624 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	YSA1	Q01976	231 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	FDC1	Q03034	503 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	RSN1	Q03516	953 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	EKI1	Q03764	534 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	YDR239C	Q03780	787 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	RNH202	Q05635	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	ENB1	Q08299	606 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	NPC2	Q12408	173 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	SNF4	P12904	322 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	YAK1	P14680	807 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
CBC2	YPL178W	SLC1	P33333	303 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	TAT2	P38967	592 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	YAR028W	P39548	234 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	MDJ2	P42834	146 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	IDS2	P46958	469 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	MNN5	P46982	586 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	UBX6	P47049	396 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	PGU1	P47180	361 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	ORM1	P53224	222 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	MEP3	P53390	489 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	ATG4	P53867	494 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	GIS1	Q03833	894 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	SWA2	Q06677	668 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	SYO1	Q07395	620 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	YDL109C	Q12103	647 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	MCP1	Q12106	302 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	YRM1	Q12340	786 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	MEC1	P38111	2368 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	PHO2	P07269	559 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	STE12	P13574	688 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	PDX1	P16451	410 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	UBC8	P28263	218 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	EHD3	P28817	500 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	GSH1	P32477	678 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	ECM15	P35195	104 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	GPX1	P36014	167 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	YHR180W	P38868	163 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	GPI16	P38875	610 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CBC2	YPL178W	CTF8	P38877	133 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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