RNA–Protein interactions for RNA: YOL082W

ATG19, Transcript of Receptor protein for the cytoplasm-to-vacuole targeting (Cvt) pathway, yeast

Gene ATG19, Length 1,248 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG19	YOL082W	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		3.17	□□□□□ -1.9
ATG19	YOL082W	MET5	P47169	1442 aa		3.17	□□□□□ -1.9
ATG19	YOL082W	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
ATG19	YOL082W	PSO2	P30620	661 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ATG19	YOL082W	PEX5	P35056	612 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ATG19	YOL082W	SHE1	P38200	338 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ATG19	YOL082W	YHR182W	P38870	785 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ATG19	YOL082W	FHL1	P39521	936 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ATG19	YOL082W	STB1	P42845	420 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ATG19	YOL082W	YJR054W	P47114	497 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ATG19	YOL082W	COQ5	P49017	307 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ATG19	YOL082W	RET3	P53600	189 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ATG19	YOL082W	MRX11	Q03079	207 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ATG19	YOL082W	PEX27	Q08580	376 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ATG19	YOL082W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
ATG19	YOL082W	YPS3	Q12303	508 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ATG19	YOL082W	YOL085C	Q99345	113 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ATG19	YOL082W	SNT2	P53127	1403 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ATG19	YOL082W	DNF1	P32660	1571 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ATG19	YOL082W	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
ATG19	YOL082W	NUP159	P40477	1460 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ATG19	YOL082W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	MSK1	P32048	576 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	VAM7	P32912	316 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	PMT2	P31382	759 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	RRT13	P40042	185 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	SNL1	P40548	159 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	YJR030C	P47101	745 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	YPR078C	Q06813	372 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	TY1B-DR3	Q99231	1755 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	TY2B-B	Q12491	1770 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	CAT8	P39113	1433 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	ZIP1	P31111	875 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	YOL075C	Q08234	1294 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	DDC1	Q08949	612 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	TY1B-GR3	Q12316	1755 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	TY1B-OR	Q92393	1755 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	ULS1	Q08562	1619 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	LTE1	P07866	1435 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	NTE1	Q04958	1679 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	VPS15	P22219	1454 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	FRT2	P39734	528 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	AIM33	Q04516	312 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	UBA3	Q99344	299 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	FSH3	Q99369	266 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	TY1B-H	O13535	1793 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	TY1B-DR5	P0C2I2	1755 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	TY1B-DR6	P0C2I3	1755 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	TY1B-LR2	P0C2I5	1755 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	TY1B-LR3	P0C2I6	1755 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	TY1B-PR1	P0C2I9	1755 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	TY1B-PR2	P0C2J0	1756 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	TY1B-PR3	P0C2J1	1755 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	TY1B-JR1	P47098	1755 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	TY1B-ML2	Q03434	1755 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	TY1B-ER1	Q03612	1755 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	TY1B-ML1	Q04711	1755 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	TY1B-GR2	Q12269	1755 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	TY1B-OL	Q12273	1755 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	TY1B-PL	Q12414	1755 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	JEM1	P40358	645 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	MPS2	P53159	387 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	RFM1	Q12192	310 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	MLP2	P40457	1679 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	PDR12	Q02785	1511 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	STE2	D6VTK4	431 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	PUP2	P32379	260 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	PRY2	P36110	329 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	MOB2	P43563	287 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	LST7	P53237	242 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	HST4	P53688	370 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	TRM82	Q03774	444 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	YPR195C	Q06594	109 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	SLM3	Q12093	417 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	FRE8	Q12209	686 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	AUS1	Q08409	1394 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	IRC20	Q06554	1556 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATG19	YOL082W	FAR1	P21268	830 aa		3.09	□□□□□ -1.91

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