RNA–Protein interactions for RNA: YOL033W

MSE1, Transcript of Mitochondrial glutamyl-tRNA synthetase, yeast

Gene MSE1, Length 1,611 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSE1	YOL033W	STE18	P18852	110 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	CCA1	P21269	546 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	YSP3	P25036	478 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	SKT5	P34226	696 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	MRPL4	P36517	319 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	ERG28	P40030	148 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	PFA3	P42836	336 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	YJL043W	P47053	257 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	YML096W	Q04489	525 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	DUS4	Q06063	367 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	YPR078C	Q06813	372 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	ATX2	Q12067	313 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	GTT2	Q12390	233 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	RRD2	Q12461	358 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	QCR7	P00128	127 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	CDC50	P25656	391 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	PCL2	P25693	308 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	YUR1	P26725	428 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	PEX4	P29340	183 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	UGX2	P32772	223 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	UME6	P39001	836 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	SFH5	P47008	294 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	YPT11	P48559	417 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	CTF18	P49956	741 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	YGL114W	P53134	725 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	GND2	P53319	492 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	YTP1	P53584	459 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	YNR066C	P53752	436 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	SNO2	P53823	222 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	HCH1	P53834	153 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	MRPL22	P53881	309 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	YMR209C	Q03648	457 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	TVP18	Q04767	167 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	PAM18	Q07914	168 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	DCI1	Q08558	271 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	PER33	Q12144	273 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	YOR012W	Q12351	137 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	TRM13	Q12383	476 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	SLO1	Q3E784	85 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	STU1	P38198	1513 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	GAL10	P04397	699 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	CBP1	P07252	654 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.35	□□□□□ -1.71	not detected
MSE1	YOL033W	NAM2	P11325	894 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	GSY2	P27472	705 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	YPT53	P36019	220 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	EFM1	P38732	585 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	GIC1	P38785	314 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	GPI16	P38875	610 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	COX15	P40086	486 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	PGD1	P40356	397 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	YIR035C	P40579	254 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	PMT4	P46971	762 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	HOC1	P47124	396 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	MTC3	P53077	123 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	BOR1	P53838	576 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	RRG8	Q06109	277 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	ATG33	Q06485	197 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	CYK3	Q07533	885 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	COS7	Q07788	383 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	SCP1	Q08873	200 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	DAP1	Q12091	152 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	FCY22	Q12119	530 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	YLL058W	Q12198	575 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	RUP1	Q12242	671 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	HIS5	P07172	385 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	PUT1	P09368	476 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MSE1	YOL033W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71

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