RNA–Protein interactions for RNA: YNL146W

YNL146W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YNL146W, Length 303 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL146W	YNL146W	EFM1	P38732	585 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YNL146W	YNL146W	IRC6	P43615	237 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YNL146W	YNL146W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
YNL146W	YNL146W	ROY1	Q04847	553 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YNL146W	YNL146W	BYE1	P36106	594 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YNL146W	YNL146W	DAN1	P47178	298 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YNL146W	YNL146W	YRF1-4	O13559	1382 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YNL146W	YNL146W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
YNL146W	YNL146W	QDR3	P38227	689 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YNL146W	YNL146W	MOB2	P43563	287 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YNL146W	YNL146W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	0.48	□□□□□ -2.33
YNL146W	YNL146W	URC2	Q04411	772 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YNL146W	YNL146W	PHO80	P20052	293 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YNL146W	YNL146W	YCR051W	P25631	222 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YNL146W	YNL146W	IST2	P38250	946 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YNL146W	YNL146W	SER3	P40054	469 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YNL146W	YNL146W	YLH47	Q06493	454 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YNL146W	YNL146W	NSE1	Q07913	336 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YNL146W	YNL146W	SLM3	Q12093	417 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YNL146W	YNL146W	IES3	Q12345	250 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YNL146W	YNL146W	YHR086W-A	Q3E746	53 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YNL146W	YNL146W	REC107	P21651	314 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YNL146W	YNL146W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
YNL146W	YNL146W	SLM4	P38247	162 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YNL146W	YNL146W	YIL054W	P40524	105 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YNL146W	YNL146W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
YNL146W	YNL146W	AFI1	Q99222	893 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YNL146W	YNL146W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.45	□□□□□ -2.34	not detected
YNL146W	YNL146W	CLB6	P32943	380 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YNL146W	YNL146W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.45	□□□□□ -2.34	not detected
YNL146W	YNL146W	YFR018C	P43599	363 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YNL146W	YNL146W	SUR7	P54003	302 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YNL146W	YNL146W	VPS63	O13549	108 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YNL146W	YNL146W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
YNL146W	YNL146W	MRP7	P12687	371 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YNL146W	YNL146W	FAR1	P21268	830 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YNL146W	YNL146W	URA10	P30402	227 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YNL146W	YNL146W	MIC19	P43594	170 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YNL146W	YNL146W	DSK2	P48510	373 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YNL146W	YNL146W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
YNL146W	YNL146W	UBX2	Q04228	584 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YNL146W	YNL146W	RED1	P14291	827 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YNL146W	YNL146W	ITR2	P30606	609 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YNL146W	YNL146W	CTM1	P38818	585 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YNL146W	YNL146W	HIT1	P46973	164 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YNL146W	YNL146W	TRM82	Q03774	444 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YNL146W	YNL146W	MED1	Q12321	566 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YNL146W	YNL146W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
YNL146W	YNL146W	YSC83	P32792	385 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YNL146W	YNL146W	MRPL19	P53875	158 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YNL146W	YNL146W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
YNL146W	YNL146W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
YNL146W	YNL146W	YKL071W	P36086	256 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YNL146W	YNL146W	YGL118C	P53132	145 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YNL146W	YNL146W	FMP48	P53233	369 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YNL146W	YNL146W	RTS3	P53289	263 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YNL146W	YNL146W	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
YNL146W	YNL146W	PHO91	P27514	894 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YNL146W	YNL146W	PAC11	P40960	533 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YNL146W	YNL146W	MIG2	P53035	382 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YNL146W	YNL146W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	0.4	□□□□□ -2.35
YNL146W	YNL146W	ALE1	Q08548	619 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YNL146W	YNL146W	VPS68	Q12016	184 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YNL146W	YNL146W	AEP3	Q12089	606 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YNL146W	YNL146W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	0.39	□□□□□ -2.35
YNL146W	YNL146W	FAD1	P38913	306 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YNL146W	YNL146W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
YNL146W	YNL146W	MRPL8	P22353	238 aa		0.38	□□□□□ -2.35
YNL146W	YNL146W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	0.38	□□□□□ -2.35
YNL146W	YNL146W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
YNL146W	YNL146W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
YNL146W	YNL146W	YLR456W	Q06199	204 aa		0.38	□□□□□ -2.35
YNL146W	YNL146W	SFI1	Q12369	946 aa		0.38	□□□□□ -2.35
YNL146W	YNL146W	ERV1	P27882	189 aa		0.37	□□□□□ -2.35
YNL146W	YNL146W	RTT102	P53330	157 aa		0.37	□□□□□ -2.35
YNL146W	YNL146W	YMR166C	Q03829	368 aa		0.37	□□□□□ -2.35
YNL146W	YNL146W	TAF11	Q04226	346 aa		0.37	□□□□□ -2.35
YNL146W	YNL146W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
YNL146W	YNL146W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
YNL146W	YNL146W	SHS1	Q07657	551 aa		0.37	□□□□□ -2.35
YNL146W	YNL146W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
YNL146W	YNL146W	TY3A-G	Q12173	290 aa		0.37	□□□□□ -2.35
YNL146W	YNL146W	TY3A-I	Q99219	290 aa		0.37	□□□□□ -2.35
YNL146W	YNL146W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
YNL146W	YNL146W	FCY21	P40039	528 aa		0.36	□□□□□ -2.35
YNL146W	YNL146W	AQR1	P53943	586 aa		0.36	□□□□□ -2.35
YNL146W	YNL146W	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	0.36	□□□□□ -2.35
YNL146W	YNL146W	YLR287C	Q05881	355 aa		0.36	□□□□□ -2.35
YNL146W	YNL146W	DCR2	Q05924	578 aa		0.36	□□□□□ -2.35
YNL146W	YNL146W	RRI2	Q12348	645 aa		0.36	□□□□□ -2.35
YNL146W	YNL146W	UBA3	Q99344	299 aa		0.36	□□□□□ -2.35
YNL146W	YNL146W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
YNL146W	YNL146W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
YNL146W	YNL146W	AAD15	Q08361	143 aa		0.35	□□□□□ -2.35
YNL146W	YNL146W	INH1	P01097	85 aa		0.34	□□□□□ -2.36
YNL146W	YNL146W	PDE2	P06776	526 aa		0.34	□□□□□ -2.36
YNL146W	YNL146W	CPR2	P23285	205 aa		0.34	□□□□□ -2.36
YNL146W	YNL146W	SCO1	P23833	295 aa		0.34	□□□□□ -2.36
YNL146W	YNL146W	NFU1	P32860	256 aa		0.34	□□□□□ -2.36
YNL146W	YNL146W	PEX5	P35056	612 aa		0.34	□□□□□ -2.36

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 30.1 ms