RNA–Protein interactions for RNA: YMR203W

TOM40, Transcript of Component of the TOM (translocase of outer membrane) complex, yeast

Gene TOM40, Length 1,164 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOM40	YMR203W	YCH1	P42937	148 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	YGR210C	P42942	411 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	RRT5	P43607	289 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	YPL080C	Q02826	108 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	CSM3	Q04659	317 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	MDM36	Q06820	579 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	SLY1	P22213	666 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	RBK1	P25332	333 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	ACB1	P31787	87 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	MKK1	P32490	508 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	CAB3	P36076	571 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	YHK8	P38776	514 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	BIG1	P38813	335 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	YHR182W	P38870	785 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	AGP3	P43548	558 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	YMR209C	Q03648	457 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	YEH2	Q07950	538 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	YPL199C	Q08954	240 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	APC9	Q12107	265 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	RGT2	Q12300	763 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	ERP3	Q12403	225 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	YPK9	Q12697	1472 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	RRT12	P25381	491 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	DCC1	P25559	380 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	ERG9	P29704	444 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	PAN1	P32521	1480 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	CHK1	P38147	527 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	COA1	P40452	197 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	COS1	P53822	381 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	KTR6	P54070	446 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	BCH1	Q05029	724 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	ALE1	Q08548	619 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	RAX1	Q08760	435 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TOM40	YMR203W	GLN3	P18494	730 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	SRB4	P32569	687 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	PCL6	P40038	420 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	YJR030C	P47101	745 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	SED5	Q01590	340 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	PIR3	Q03180	325 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	PAM18	Q07914	168 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	ATX2	Q12067	313 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	CSR2	Q12734	1121 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	NTE1	Q04958	1679 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	HEM15	P16622	393 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	DAL81	P21657	970 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	ZRT1	P32804	376 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	YBR137W	P38276	179 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	SMF2	P38778	549 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	CAF40	P53829	373 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	RTT103	Q05543	409 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	YLR283W	Q05867	314 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	YLR108C	Q12259	485 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	JIP3	O13555	125 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	ATP6	P00854	259 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	DAL82	P21705	255 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	PCI8	P40512	444 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	YIR014W	P40570	242 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	YFL040W	P43562	540 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	IKS1	P47042	667 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
TOM40	YMR203W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	YOS9	Q99220	542 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	VPS15	P22219	1454 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TOM40	YMR203W	ITR2	P30606	609 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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