RNA–Protein interactions for RNA: YKL125W

RRN3, Transcript of Protein required for transcription of rDNA by RNA polymerase I, yeastyeast

Gene RRN3, Length 1,884 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN3YKL125W YPL245WQ12179 454 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W YPL066WQ12194 479 aa5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W YDL199CQ12407 687 aa5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W RTN2Q12443 393 aa5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W MHF1Q3E835 90 aa5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W HBN1Q96VH4 193 aa5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W GAL4P04386 881 aa4.99□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W ASP3-2P0CX77 362 aa4.99□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W ASP3-3P0CX78 362 aa4.99□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W ASP3-4P0CX79 362 aa4.99□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W ASP3-1P0CZ17 362 aa4.99□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W HEM13P11353 328 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W RPB3P16370 318 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W ERD2P18414 219 aa4.99□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W MSN2P33748 704 aa4.99□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W WBP1P33767 430 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W FRE2P36033 711 aa4.99□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W MRPL4P36517 319 aa4.99□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W RCK1P38622 512 aa4.99□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W AFG3P39925 761 aa4.99□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W OPT1P40897 799 aa4.99□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W GAB1P41733 394 aa4.99□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W SSY5P47002 699 aa4.99□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W YGL159WP53110 370 aa4.99□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W SAE3P89114 91 aa4.99□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W ARG5,6Q01217 863 aa4.99□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W SKY1Q03656 742 aa4.99□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W YDR222WQ04925 415 aa4.99□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W RIF2Q06208 395 aa4.99□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W REX4Q08237 289 aa4.99□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W CSM4Q08955 156 aa4.99□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W KEL3Q08979 651 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W YGR161W-CQ3E744 92 aa4.99□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W MTR10Q99189 972 aa4.99□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W RIF1P29539 1916 aa4.99□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W YLR358CO13565 187 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W ALG7P07286 448 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W CDC42P19073 191 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W SEC59P20048 519 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W ZRC1P20107 442 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W YCR102CP25608 368 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W YUH1P35127 236 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W GPT2P36148 743 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W APE3P37302 537 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W MRPL16P38064 232 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W HAT2P39984 401 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W NPP2P39997 493 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W MET28P40573 187 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W PRM10P42946 383 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W ALY2P47029 1046 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W YJR012CP47087 207 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W IBA57P47158 497 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W COG7P53195 279 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W RPN14P53196 417 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W YPR003CP53394 754 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W YLR455WQ06188 304 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W AIM6Q07716 390 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W RRT8Q08219 342 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W RRG7Q08774 242 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W LEU9Q12166 604 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W YOL159C-AQ3E769 90 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W MEX67Q99257 599 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W CDC36P06100 191 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W HAP2P06774 265 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W PDX1P16451 410 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W ERG6P25087 383 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W TAH1P25638 111 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W CYS3P31373 394 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W SSH4P32343 579 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W TCD2P36101 447 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W GMH1P36125 273 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W MRPL28P36527 147 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W YBR220CP38318 560 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W ARN1P38731 627 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W FAD1P38913 306 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W VPS45P38932 577 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W GET2P40056 285 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W MGS1P40151 587 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W SLZ1P40167 298 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W YJL218WP40892 196 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W LSB3P43603 459 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W PTR3P43606 678 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W TAD2P47058 250 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W DAN1P47178 298 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W NUP57P48837 541 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W YGR017WP53210 297 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W TOF2Q02208 771 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W MRP51Q02950 344 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W SLD5Q03406 294 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W YAP6Q03935 383 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W LRS4Q04087 347 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W CUE4Q04201 117 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W TRM12Q04235 462 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W PEX12Q04370 399 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W NAT4Q04751 285 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W THI7Q05998 598 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W MED7Q08278 222 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W SRO7Q12038 1033 aa4.98□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W PSF1Q12488 208 aa4.98□□□□□ -1.61
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