RNA–Protein interactions for RNA: YJL036W

SNX4, Transcript of Sorting nexin, yeastyeast

Gene SNX4, Length 1,272 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNX4YJL036W KAR9P32526 644 aa3.01□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W YKR015CP36111 568 aa3.01□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W DFG10P40526 253 aa3.01□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W YNL320WP42840 284 aa3.01□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W YCH1P42937 148 aa3.01□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W COS10P52924 374 aa3.01□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W MSO1P53604 210 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W SPP2Q02521 185 aa3.01□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W YMR102CQ03177 834 aa3.01□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W GRX3Q03835 250 aa3.01□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W TY3A-GQ12173 290 aa3.01□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W RUD3Q12234 484 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W MED4Q12343 284 aa3.01□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W PRP46Q12417 451 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W TY3A-IQ99219 290 aa3.01□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W UBA3Q99344 299 aa3.01□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W CYC3P06182 269 aa3□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W CPR4P25334 318 aa3□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W ZRT1P32804 376 aa3□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W SKG6P32900 734 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W DTR1P38125 572 aa3□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W MMS21P38632 267 aa3□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W HIS2P38635 335 aa3□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W CTM1P38818 585 aa3□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W YIL067CP40514 678 aa3□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W HAC1P41546 238 aa3□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W CTK3P46963 296 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W SEH1P53011 349 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W HCH1P53834 153 aa3□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W YNL134CP53912 376 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W MTQ1P53944 314 aa3□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W IRC4Q03036 179 aa3□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W TDA1Q03533 586 aa3□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W YLR173WQ06247 608 aa3□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W ALE1Q08548 619 aa3□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W ESA1Q08649 445 aa3□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W RSA1Q08932 381 aa3□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W TMS1Q12116 473 aa3□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W ERP3Q12403 225 aa3□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W CDC42P19073 191 aa2.99□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W YSR3P23501 404 aa2.99□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W DAL2P25335 343 aa2.99□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W MEI5P32489 222 aa2.99□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W SPO23P33757 523 aa2.99□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W SWD2P36104 329 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W SMF2P38778 549 aa2.99□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W NDT80P38830 627 aa2.99□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W FMP33P46998 180 aa2.99□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W MRX5P47007 382 aa2.99□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W OKP1P53298 406 aa2.99□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W MKC7P53379 596 aa2.99□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W BIO4P53630 237 aa2.99□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W CWC25P53854 179 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W GPN3Q06543 272 aa2.99□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W BER1Q06688 274 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W YPR091CQ06833 770 aa2.99□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W HNT3Q08702 217 aa2.99□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W YOR387CQ08910 206 aa2.99□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W PPT2Q12036 173 aa2.99□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W BTS1Q12051 335 aa2.99□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W APC9Q12107 265 aa2.99□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W FCY22Q12119 530 aa2.99□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W YGK3Q12222 375 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W FRS2P15625 503 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W AVT5P38176 459 aa2.98□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W HSM3P38348 480 aa2.98□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W TDA11P38854 504 aa2.98□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W IDP2P41939 412 aa2.98□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W BNA6P43619 295 aa2.98□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W YJL118WP47022 219 aa2.98□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W LSG1P53145 640 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W LSB1P53281 241 aa2.98□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W REX2P54964 269 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W CWC21Q03375 135 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W COX20Q04935 205 aa2.98□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W RTN1Q04947 295 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W TSR1Q07381 788 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W DDC1Q08949 612 aa2.98□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W YDL109CQ12103 647 aa2.98□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W HMS1Q12398 434 aa2.98□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W YCL021W-AQ96VH3 125 aa2.98□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W RVS161P25343 265 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W CPR3P25719 182 aa2.97□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W NTG1P31378 399 aa2.97□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W GCG1P32656 232 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W IMP3P32899 183 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W SDH3P33421 198 aa2.97□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W YHR045WP38775 560 aa2.97□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W BFR1P38934 470 aaKnown RBP RIP-Chip data2.97□□□□□ -1.93 RIP-Chip
SNX4YJL036W AGP3P43548 558 aa2.97□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W SED5Q01590 340 aa2.97□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W CTS2Q06350 511 aa2.97□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W YDL114WQ07530 308 aa2.97□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W RBD2Q12270 262 aa2.97□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W YBR298C-AQ8TGK4 73 aa2.97□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W IZH4Q99393 312 aa2.97□□□□□ -1.93
SNX4YJL036W TDH3P00359 332 aaKnown RBP RIP-Chip data2.96□□□□□ -1.94not detected
SNX4YJL036W HEM4P06174 275 aa2.96□□□□□ -1.94
SNX4YJL036W RPL23AP0CX41 137 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
SNX4YJL036W RPL23BP0CX42 137 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
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