RNA–Protein interactions for RNA: YGL019W

CKB1, Transcript of Beta regulatory subunit of casein kinase 2 (CK2), yeast

Gene CKB1, Length 837 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CKB1	YGL019W	RAM1	P22007	431 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	PUP1	P25043	261 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	FUN26	P31381	517 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	ORC2	P32833	620 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	RPC34	P32910	317 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	SKN1	P33336	771 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	GID8	P40208	455 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	IDS2	P46958	469 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	ECM27	P47144	725 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	PAU12	P53343	120 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	PGA1	P53896	198 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	SPC19	Q03954	165 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	YDR344C	Q05510	147 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	YPR022C	Q12139	1133 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	YLR111W	Q12528	110 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	VPS13	Q07878	3144 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	CAN1	P04817	590 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	ERD1	P16151	362 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	ERD2	P18414	219 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	NPR1	P22211	790 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	SLY41	P22215	453 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	SFC1	P33303	322 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	SDS22	P36047	338 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	OMA1	P36163	345 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	DTR1	P38125	572 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	PAU24	P38155	120 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	IFA38	P38286	347 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	MSS4	P38994	779 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.98	□□□□□ -1.29	not detected
CKB1	YGL019W	PLB1	P39105	664 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	HXT9	P40885	567 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	APS3	P47064	194 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	PMT5	P52867	743 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	NPY1	P53164	384 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	RRN11	Q04712	507 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	CDA2	Q06703	312 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	CRT10	Q08226	957 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	PFA4	Q12006	378 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	ATG41	Q12048	136 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	YDL211C	Q12121	372 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	FRE6	Q12473	712 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	YPR117W	Q06116	2489 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	HIS3	P06633	220 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	YCR100C	P25606	316 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	DOA4	P32571	926 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	ECT1	P33412	323 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	LST4	P34239	828 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	ECM15	P35195	104 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	OAR1	P35731	278 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	YKL077W	P36081	392 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	THI2	P38141	450 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	LEU5	P38702	357 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	RRF1	P38771	230 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	PKP1	P40530	394 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	MDE1	P47095	244 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	TOS2	P50078	622 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	VOA1	P53262	265 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	YHM2	Q04013	314 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	DLT1	Q04216	342 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	MFB1	Q04922	465 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	YLR224W	Q05947	369 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	ARV1	Q06541	321 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	SSK1	Q07084	712 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	OPI10	Q08202	246 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	FRE3	Q08905	711 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	MPD2	Q99316	277 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	TAO3	P40468	2376 aa		6.96	□□□□□ -1.29
CKB1	YGL019W	GCN4	P03069	281 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CKB1	YGL019W	URA3	P03962	267 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CKB1	YGL019W	CDC9	P04819	755 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CKB1	YGL019W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
CKB1	YGL019W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
CKB1	YGL019W	BUB3	P26449	341 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CKB1	YGL019W	ITR1	P30605	584 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CKB1	YGL019W	VPS17	P32913	551 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CKB1	YGL019W	PDR3	P33200	976 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CKB1	YGL019W	TAF14	P35189	244 aa		6.96	□□□□□ -1.3

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