RNA–Protein interactions for RNA: YER103W

SSA4, Transcript of Heat shock protein that is highly induced upon stress, yeastyeast

Gene SSA4, Length 1,929 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSA4YER103W HSE1P38753 452 aa11.95□□□□□ -0.5
SSA4YER103W LRP1P38801 184 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
SSA4YER103W SDT1P53078 280 aa11.95□□□□□ -0.5
SSA4YER103W MNT4P53745 580 aa11.95□□□□□ -0.5
SSA4YER103W RRN11Q04712 507 aa11.95□□□□□ -0.5
SSA4YER103W TEN1Q07921 160 aa11.95□□□□□ -0.5
SSA4YER103W DCI1Q08558 271 aa11.95□□□□□ -0.5
SSA4YER103W BMT6Q12291 365 aa11.95□□□□□ -0.5
SSA4YER103W PCL9Q12477 304 aa11.95□□□□□ -0.5
SSA4YER103W AI3P03877 415 aa11.94□□□□□ -0.5
SSA4YER103W CDC9P04819 755 aa11.94□□□□□ -0.5
SSA4YER103W FRS1P15624 595 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
SSA4YER103W EXG1P23776 448 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
SSA4YER103W STE50P25344 346 aa11.94□□□□□ -0.5
SSA4YER103W SLM5P25345 492 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
SSA4YER103W PRP18P33411 251 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
SSA4YER103W RPF2P36160 344 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
SSA4YER103W FLO10P36170 1169 aa11.94□□□□□ -0.5
SSA4YER103W SLI15P38283 698 aa11.94□□□□□ -0.5
SSA4YER103W YIL165CP40446 119 aa11.94□□□□□ -0.5
SSA4YER103W YIR016WP40572 265 aa11.94□□□□□ -0.5
SSA4YER103W SIP4P46954 829 aa11.94□□□□□ -0.5
SSA4YER103W RTS3P53289 263 aa11.94□□□□□ -0.5
SSA4YER103W OST6Q03723 332 aa11.94□□□□□ -0.5
SSA4YER103W SNF6P18888 332 aa11.94□□□□□ -0.5
SSA4YER103W IDH2P28241 369 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
SSA4YER103W MRP20P32387 263 aa11.94□□□□□ -0.5
SSA4YER103W SKN1P33336 771 aa11.94□□□□□ -0.5
SSA4YER103W YBR284WP38150 797 aa11.94□□□□□ -0.5
SSA4YER103W YHR177WP38867 453 aa11.94□□□□□ -0.5
SSA4YER103W HRB1P38922 454 aaKnown RBP RIP-Chip data11.94□□□□□ -0.5not detected
SSA4YER103W AIM2P39721 246 aa11.94□□□□□ -0.5
SSA4YER103W RPL34BP40525 121 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
SSA4YER103W CAT5P41735 233 aa11.94□□□□□ -0.5
SSA4YER103W YJL016WP47072 561 aa11.94□□□□□ -0.5
SSA4YER103W AMA1P50082 593 aa11.94□□□□□ -0.5
SSA4YER103W ARL3Q02804 198 aa11.94□□□□□ -0.5
SSA4YER103W PLM2Q04383 521 aa11.94□□□□□ -0.5
SSA4YER103W FUN26P31381 517 aa11.93□□□□□ -0.5
SSA4YER103W MCM10P32354 571 aa11.93□□□□□ -0.5
SSA4YER103W PUB1P32588 453 aaKnown RBP RIP-Chip data11.93□□□□□ -0.5not detected
SSA4YER103W MAC1P35192 417 aa11.93□□□□□ -0.5
SSA4YER103W EMC3P36039 253 aa11.93□□□□□ -0.5
SSA4YER103W HXT5P38695 592 aa11.93□□□□□ -0.5
SSA4YER103W PGD1P40356 397 aa11.93□□□□□ -0.5
SSA4YER103W BMT5P40493 336 aa11.93□□□□□ -0.5
SSA4YER103W AIM14P53109 570 aa11.93□□□□□ -0.5
SSA4YER103W TMS1Q12116 473 aa11.93□□□□□ -0.5
SSA4YER103W YFR010W-AP0C5N0 62 aa11.92□□□□□ -0.5
SSA4YER103W SED4P25365 1065 aa11.92□□□□□ -0.5
SSA4YER103W SHM2P37291 469 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
SSA4YER103W PRS3P38689 320 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
SSA4YER103W YEL073CP39974 107 aa11.92□□□□□ -0.5
SSA4YER103W NSE4P43124 402 aa11.92□□□□□ -0.5
SSA4YER103W PHO23P50947 330 aa11.92□□□□□ -0.5
SSA4YER103W SYF2P53277 215 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
SSA4YER103W HST3P53687 447 aa11.92□□□□□ -0.5
SSA4YER103W YLR012CQ07927 99 aa11.92□□□□□ -0.5
SSA4YER103W SCP1Q08873 200 aa11.92□□□□□ -0.5
SSA4YER103W REV1P12689 985 aa11.92□□□□□ -0.5
SSA4YER103W PAU24P38155 120 aa11.92□□□□□ -0.5
SSA4YER103W RMD6P39975 231 aa11.92□□□□□ -0.5
SSA4YER103W MRX5P47007 382 aa11.92□□□□□ -0.5
SSA4YER103W YJR030CP47101 745 aa11.92□□□□□ -0.5
SSA4YER103W YGR079WP53249 370 aa11.92□□□□□ -0.5
SSA4YER103W FRE4P53746 719 aa11.92□□□□□ -0.5
SSA4YER103W ASI3P53983 676 aa11.92□□□□□ -0.5
SSA4YER103W ACS1Q01574 713 aa11.92□□□□□ -0.5
SSA4YER103W ICL2Q12031 575 aa11.92□□□□□ -0.5
SSA4YER103W INP53Q12271 1107 aa11.92□□□□□ -0.5
SSA4YER103W HTS1P07263 546 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
SSA4YER103W ERD1P16151 362 aa11.91□□□□□ -0.5
SSA4YER103W PDA1P16387 420 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
SSA4YER103W MRP17P28778 131 aa11.91□□□□□ -0.5
SSA4YER103W HXT4P32467 576 aa11.91□□□□□ -0.5
SSA4YER103W SUA5P32579 426 aa11.91□□□□□ -0.5
SSA4YER103W YKL162CP36052 402 aa11.91□□□□□ -0.5
SSA4YER103W PTH1P38876 190 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
SSA4YER103W SPR28Q04921 423 aa11.91□□□□□ -0.5
SSA4YER103W YPR091CQ06833 770 aa11.91□□□□□ -0.5
SSA4YER103W RRP40Q08285 240 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
SSA4YER103W YPR063CQ12160 140 aa11.91□□□□□ -0.5
SSA4YER103W HBN1Q96VH4 193 aa11.91□□□□□ -0.5
SSA4YER103W Q0142Q9ZZW4 58 aa11.91□□□□□ -0.5
SSA4YER103W SST2P11972 698 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
SSA4YER103W SOL2P37262 315 aa11.9□□□□□ -0.5
SSA4YER103W MTC4P38335 694 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
SSA4YER103W PHB2P50085 310 aa11.9□□□□□ -0.5
SSA4YER103W DOC1P53068 250 aa11.9□□□□□ -0.5
SSA4YER103W YGR015CP53208 328 aa11.9□□□□□ -0.5
SSA4YER103W FPK1P53739 893 aa11.9□□□□□ -0.5
SSA4YER103W DFG16Q99234 619 aa11.9□□□□□ -0.5
SSA4YER103W ITR1P30605 584 aa11.9□□□□□ -0.51
SSA4YER103W MKK1P32490 508 aa11.9□□□□□ -0.51
SSA4YER103W ALG3P38179 458 aa11.9□□□□□ -0.51
SSA4YER103W GCV3P39726 170 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.51
SSA4YER103W PRM10P42946 383 aa11.9□□□□□ -0.51
SSA4YER103W PAC10P48363 199 aa11.9□□□□□ -0.51
SSA4YER103W MDM34P53083 459 aa11.9□□□□□ -0.51
SSA4YER103W PAU12P53343 120 aa11.9□□□□□ -0.51
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