RNA–Protein interactions for RNA: YDR319C

YFT2, Transcript of Protein required for normal ER membrane biosynthesis, yeast

Gene YFT2, Length 825 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YFT2	YDR319C	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	SRB4	P32569	687 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	MRPL15	P36523	253 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	SMF2	P38778	549 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	CAF40	P53829	373 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.14	□□□□□ -1.75	not detected
YFT2	YDR319C	PET117	Q02771	107 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	ODC1	Q03028	310 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	YET2	Q04210	160 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	OCA6	Q12454	224 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	YLR462W	O13556	202 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	SPO12	P17123	173 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	CLN1	P20437	546 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	YCR100C	P25606	316 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	YIM1	P28625	365 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	SFC1	P33303	322 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	CAB3	P36076	571 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	MRPL10	P36520	322 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	YHL049C	P38722	271 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	YFL064C	P43540	174 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	YPI1	P43587	155 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	KAP114	P53067	1004 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	DAS2	Q12084	232 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	CSF1	Q12150	2958 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	UTP20	P35194	2493 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	REC114	P32841	428 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	SKN1	P33336	771 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	MRP21	P38175	177 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	LDB7	P38210	180 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	YEL073C	P39974	107 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	BRO1	P48582	844 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	SPC19	Q03954	165 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	YDR018C	Q12185	396 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	RPL43B	P0CX26	92 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	HEM15	P16622	393 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	PHO13	P19881	312 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	URA4	P20051	364 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	YCL068C	P25593	260 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	YSW1	P38280	609 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	POP6	P53218	158 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	FRE4	P53746	719 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	PEX25	Q02969	394 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	HSP31	Q04432	237 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	RSA1	Q08932	381 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	SRN2	Q99176	213 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	HOM3	P10869	527 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	CLB3	P24870	427 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	MSP1	P28737	362 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	MEI5	P32489	222 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	YOX1	P34161	385 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	HCS1	P34243	683 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	MRPL37	P36532	105 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	POP4	P38336	279 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	CAJ1	P39101	391 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	SCC4	P40090	624 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	SPG5	P42933	373 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	RPC17	P47076	161 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	IBA57	P47158	497 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	YOR114W	Q12219	294 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	ECM25	P32525	599 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	YCR041W	P37265	110 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	RFC3	P38629	340 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	YMR134W	P40207	237 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	YIP1	P53039	248 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	YNL260C	P53846	198 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	DSL1	P53847	754 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	NHP10	Q03435	203 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	YDR387C	Q04162	555 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	TRM12	Q04235	462 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	TMS1	Q12116	473 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YFT2	YDR319C	YCL042W	P25572	119 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YFT2	YDR319C	URA10	P30402	227 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YFT2	YDR319C	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YFT2	YDR319C	TIP20	P33891	701 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YFT2	YDR319C	NAT2	P37293	288 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YFT2	YDR319C	YBR139W	P38109	508 aa		4.08	□□□□□ -1.76

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