RNA–Protein interactions for RNA: RDN25-2

RDN25-2, Transcript of 25S ribosomal RNA (25S rRNA), yeastyeast

Gene RDN25-2, Length 3,396 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDN25-2RDN25-2 RIB3Q99258 208 aa9.07□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 VPS13Q07878 3144 aa9.07□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 RPC40P07703 335 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 CKS1P20486 150 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 SSU1P41930 458 aa9.07□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 HOL1P53389 586 aa9.07□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 MRPL22P53881 309 aa9.07□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 RAD28Q12021 506 aa9.07□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 YOR019WQ99248 730 aa9.07□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 HRP1Q99383 534 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 URA6P15700 204 aa9.07□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 MPM1P40364 252 aa9.07□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 IRC24P40580 263 aa9.07□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 GAB1P41733 394 aa9.07□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 FRE4P53746 719 aa9.07□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 LSM7P53905 115 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 SMA1Q02651 245 aa9.07□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 YPL108WQ02872 168 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 CAC2Q04199 468 aa9.07□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 YDR056CQ12025 205 aa9.07□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 CDC4P07834 779 aa9.06□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 HOM3P10869 527 aa9.06□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 YGR168CP53293 376 aa9.06□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 SPP2Q02521 185 aa9.06□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 PEX25Q02969 394 aa9.06□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 CAT2P32796 670 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 LDB7P38210 180 aa9.06□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 SHG1P38337 142 aa9.06□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 SSY5P47002 699 aa9.06□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 TAD2P47058 250 aa9.06□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 SHY1P53266 389 aa9.06□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 HHO1P53551 258 aa9.06□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 ARG5,6Q01217 863 aa9.06□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 PHO92Q06390 306 aa9.06□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 ARO10Q06408 635 aa9.06□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 SPT3P06844 337 aa9.06□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 ATG15P25641 520 aa9.06□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 WBP1P33767 430 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 GCS1P35197 352 aa9.06□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 TMA19P35691 167 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 ERV15P38312 142 aa9.06□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 RSP5P39940 809 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 TOK1P40310 691 aa9.06□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 HIS6P40545 261 aa9.06□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 YNL143CP53908 130 aa9.06□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 MFG1Q07684 458 aa9.06□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 MPD2Q99316 277 aa9.06□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 SAM35P14693 329 aa9.05□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 TCM62P38228 572 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 EHT1P38295 451 aa9.05□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 RCK1P38622 512 aa9.05□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 SSK1Q07084 712 aa9.05□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 KIN28P06242 306 aa9.05□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 RPB3P16370 318 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 FUN14P18411 198 aa9.05□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 NRP1P32770 719 aaKnown RBP RIP-Chip data9.05□□□□□ -0.96not detected
RDN25-2RDN25-2 SCD5P34758 872 aa9.05□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 YKL069WP36088 180 aa9.05□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 RIB1P38066 345 aa9.05□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 YIL089WP40500 205 aa9.05□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 PIR3Q03180 325 aa9.05□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 ECM22Q05958 814 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 YLR179CQ06252 201 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 HVG1P0CE11 249 aa9.04□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 VPH1P32563 840 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 IST3P40565 148 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 GTS1P40956 396 aa9.04□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 PMT4P46971 762 aa9.04□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 OST6Q03723 332 aa9.04□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 GSF2Q04697 403 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 MCA1Q08601 432 aa9.04□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 YOR387CQ08910 206 aa9.04□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 YPL245WQ12179 454 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 SPS2P08459 502 aa9.04□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 PET54P10834 293 aa9.04□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 OAR1P35731 278 aa9.04□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 SRO77P38163 1010 aa9.04□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 YBR013CP38215 129 aa9.04□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 HMS2P47175 358 aa9.04□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 YGL159WP53110 370 aa9.04□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 CST9Q06032 482 aa9.04□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 YPR063CQ12160 140 aa9.04□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 CTF13P35203 478 aa9.04□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 BET3P36149 193 aa9.04□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 ART5P53244 586 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 YGR250CP53316 781 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 HST3P53687 447 aa9.04□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 PNS1Q12412 539 aa9.04□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 PHO80P20052 293 aa9.03□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 AFT1P22149 690 aa9.03□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 SOF1P33750 489 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 YKL162CP36052 402 aa9.03□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 YMR144WP40214 342 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 SIP4P46954 829 aa9.03□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 NIT2P47016 307 aa9.03□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 AIM22P47051 409 aa9.03□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 COS12P53053 380 aa9.03□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 YNL034WP53963 612 aa9.03□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 GIP3Q03016 1276 aa9.03□□□□□ -0.96
RDN25-2RDN25-2 YPR145C-AQ2V2P0 78 aa9.03□□□□□ -0.96
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