RNA–Protein interactions for RNA: Q0142

Q0142, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene Q0142, Length 177 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
Q0142	Q0142	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	0.57	□□□□□ -2.32
Q0142	Q0142	ERO1	Q03103	563 aa		0.57	□□□□□ -2.32
Q0142	Q0142	SCS7	Q03529	384 aa		0.57	□□□□□ -2.32
Q0142	Q0142	UBX2	Q04228	584 aa		0.57	□□□□□ -2.32
Q0142	Q0142	YIL054W	P40524	105 aa		0.56	□□□□□ -2.32
Q0142	Q0142	GAT3	Q07928	141 aa		0.56	□□□□□ -2.32
Q0142	Q0142	IES3	Q12345	250 aa		0.55	□□□□□ -2.32
Q0142	Q0142	YHR086W-A	Q3E746	53 aa		0.55	□□□□□ -2.32
Q0142	Q0142	FAR1	P21268	830 aa		0.53	□□□□□ -2.32
Q0142	Q0142	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
Q0142	Q0142	IMP2'	P32351	346 aa		0.53	□□□□□ -2.32
Q0142	Q0142	BYE1	P36106	594 aa		0.53	□□□□□ -2.32
Q0142	Q0142	IST2	P38250	946 aa		0.53	□□□□□ -2.32
Q0142	Q0142	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.53	□□□□□ -2.32	not detected
Q0142	Q0142	MOB2	P43563	287 aa		0.53	□□□□□ -2.32
Q0142	Q0142	MIC19	P43594	170 aa		0.53	□□□□□ -2.32
Q0142	Q0142	DSK2	P48510	373 aa		0.53	□□□□□ -2.32
Q0142	Q0142	ISN1	Q99312	450 aa		0.53	□□□□□ -2.32
Q0142	Q0142	ITR2	P30606	609 aa		0.52	□□□□□ -2.33
Q0142	Q0142	CTM1	P38818	585 aa		0.52	□□□□□ -2.33
Q0142	Q0142	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
Q0142	Q0142	URC2	Q04411	772 aa		0.51	□□□□□ -2.33
Q0142	Q0142	NSE1	Q07913	336 aa		0.51	□□□□□ -2.33
Q0142	Q0142	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
Q0142	Q0142	YFR018C	P43599	363 aa		0.5	□□□□□ -2.33
Q0142	Q0142	ROY1	Q04847	553 aa		0.5	□□□□□ -2.33
Q0142	Q0142	YLH47	Q06493	454 aa		0.5	□□□□□ -2.33
Q0142	Q0142	VPS63	O13549	108 aa		0.49	□□□□□ -2.33
Q0142	Q0142	URA10	P30402	227 aa		0.49	□□□□□ -2.33
Q0142	Q0142	HIT1	P46973	164 aa		0.49	□□□□□ -2.33
Q0142	Q0142	REC107	P21651	314 aa		0.48	□□□□□ -2.33
Q0142	Q0142	IRC6	P43615	237 aa		0.48	□□□□□ -2.33
Q0142	Q0142	MIG2	P53035	382 aa		0.48	□□□□□ -2.33
Q0142	Q0142	SUR7	P54003	302 aa		0.48	□□□□□ -2.33
Q0142	Q0142	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
Q0142	Q0142	QDR3	P38227	689 aa		0.47	□□□□□ -2.33
Q0142	Q0142	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
Q0142	Q0142	SLM3	Q12093	417 aa		0.47	□□□□□ -2.33
Q0142	Q0142	YRF1-4	O13559	1382 aa		0.46	□□□□□ -2.34
Q0142	Q0142	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
Q0142	Q0142	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.46	□□□□□ -2.34	not detected
Q0142	Q0142	YKL071W	P36086	256 aa		0.46	□□□□□ -2.34
Q0142	Q0142	YGL118C	P53132	145 aa		0.46	□□□□□ -2.34
Q0142	Q0142	VPS68	Q12016	184 aa		0.46	□□□□□ -2.34
Q0142	Q0142	TY3A-G	Q12173	290 aa		0.46	□□□□□ -2.34
Q0142	Q0142	TY3A-I	Q99219	290 aa		0.46	□□□□□ -2.34
Q0142	Q0142	YCR051W	P25631	222 aa		0.45	□□□□□ -2.34
Q0142	Q0142	SLM4	P38247	162 aa		0.44	□□□□□ -2.34
Q0142	Q0142	TRM82	Q03774	444 aa		0.44	□□□□□ -2.34
Q0142	Q0142	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
Q0142	Q0142	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	0.43	□□□□□ -2.34
Q0142	Q0142	SER3	P40054	469 aa		0.43	□□□□□ -2.34
Q0142	Q0142	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
Q0142	Q0142	FMP48	P53233	369 aa		0.43	□□□□□ -2.34
Q0142	Q0142	DCR2	Q05924	578 aa		0.43	□□□□□ -2.34
Q0142	Q0142	AFI1	Q99222	893 aa		0.43	□□□□□ -2.34
Q0142	Q0142	MRP7	P12687	371 aa		0.42	□□□□□ -2.34
Q0142	Q0142	YSC83	P32792	385 aa		0.42	□□□□□ -2.34
Q0142	Q0142	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
Q0142	Q0142	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
Q0142	Q0142	AQR1	P53943	586 aa		0.42	□□□□□ -2.34
Q0142	Q0142	ALE1	Q08548	619 aa		0.42	□□□□□ -2.34
Q0142	Q0142	AEP3	Q12089	606 aa		0.42	□□□□□ -2.34
Q0142	Q0142	MRPL8	P22353	238 aa		0.41	□□□□□ -2.34
Q0142	Q0142	PAC11	P40960	533 aa		0.41	□□□□□ -2.34
Q0142	Q0142	YMR166C	Q03829	368 aa		0.41	□□□□□ -2.34
Q0142	Q0142	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	0.4	□□□□□ -2.35
Q0142	Q0142	CAB3	P36076	571 aa		0.4	□□□□□ -2.35
Q0142	Q0142	RTS3	P53289	263 aa		0.4	□□□□□ -2.35
Q0142	Q0142	SCO1	P23833	295 aa		0.39	□□□□□ -2.35
Q0142	Q0142	PHO91	P27514	894 aa		0.39	□□□□□ -2.35
Q0142	Q0142	FCY21	P40039	528 aa		0.39	□□□□□ -2.35
Q0142	Q0142	MRPL19	P53875	158 aa		0.39	□□□□□ -2.35
Q0142	Q0142	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
Q0142	Q0142	RED1	P14291	827 aa		0.38	□□□□□ -2.35
Q0142	Q0142	YAK1	P14680	807 aa		0.38	□□□□□ -2.35
Q0142	Q0142	MED1	Q12321	566 aa		0.38	□□□□□ -2.35
Q0142	Q0142	PEX5	P35056	612 aa		0.37	□□□□□ -2.35
Q0142	Q0142	SMF2	P38778	549 aa		0.37	□□□□□ -2.35
Q0142	Q0142	SLM1	P40485	686 aa		0.37	□□□□□ -2.35
Q0142	Q0142	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	0.37	□□□□□ -2.35
Q0142	Q0142	SHS1	Q07657	551 aa		0.37	□□□□□ -2.35
Q0142	Q0142	YOR012W	Q12351	137 aa		0.37	□□□□□ -2.35
Q0142	Q0142	NUP57	P48837	541 aa		0.36	□□□□□ -2.35
Q0142	Q0142	RTT102	P53330	157 aa		0.36	□□□□□ -2.35
Q0142	Q0142	TIM22	Q12328	207 aa		0.36	□□□□□ -2.35
Q0142	Q0142	UBA3	Q99344	299 aa		0.36	□□□□□ -2.35
Q0142	Q0142	CSE1	P33307	960 aa		0.35	□□□□□ -2.35
Q0142	Q0142	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
Q0142	Q0142	YLR456W	Q06199	204 aa		0.35	□□□□□ -2.35
Q0142	Q0142	SUE1	Q06524	206 aa		0.35	□□□□□ -2.35
Q0142	Q0142	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
Q0142	Q0142	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	0.35	□□□□□ -2.35
Q0142	Q0142	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
Q0142	Q0142	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
Q0142	Q0142	YOL163W	P0CF20	169 aa		0.34	□□□□□ -2.36
Q0142	Q0142	FAD1	P38913	306 aa		0.34	□□□□□ -2.36
Q0142	Q0142	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	0.34	□□□□□ -2.36
Q0142	Q0142	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
Q0142	Q0142	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.9 ms