RNA–Protein interactions for RNA: YML121W

GTR1, Transcript of Cytoplasmic GTPase, yeast

Gene GTR1, Length 933 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GTR1	YML121W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	COX2	P00410	251 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	KRE6	P32486	720 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	MRX5	P47007	382 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	GWT1	P47026	490 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	COX16	P47081	118 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	ABM1	P47146	123 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	HER2	Q03557	464 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	GMC2	Q06201	188 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	MUM3	Q08750	479 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	RAD3	P06839	778 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	YSR3	P23501	404 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	ACB1	P31787	87 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	CYM1	P32898	989 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	YKL071W	P36086	256 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	SCO2	P38072	301 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	GUF1	P46943	645 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	AIM24	P47127	394 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	AZR1	P50080	613 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	ESBP6	P53918	673 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	HXT11	P54862	567 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	GTO3	Q04806	366 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	YOR029W	Q12243	111 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	POM152	P39685	1337 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	RIP-Chip
GTR1	YML121W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	POP5	P28005	173 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	PRR1	P28708	518 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	YEF1	P32622	495 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	GEP4	P38812	185 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	RBG1	P39729	369 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	AVT4	P50944	713 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	POP6	P53218	158 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	MKC7	P53379	596 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	MDM36	Q06820	579 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	GAT3	Q07928	141 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	YEH2	Q07950	538 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	YPQ1	Q12010	308 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GTR1	YML121W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	MKK1	P32490	508 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	SRB4	P32569	687 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	GPX2	P38143	162 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	FHL1	P39521	936 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	MST28	P39552	234 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	SLM1	P40485	686 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	SFH5	P47008	294 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	OKP1	P53298	406 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	KTR6	P54070	446 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	YMR209C	Q03648	457 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	CCE1	Q03702	353 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	SNA4	Q07549	140 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	ERP3	Q12403	225 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	JIP3	O13555	125 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	CAP2	P13517	287 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	DCC1	P25559	380 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	TIR2	P33890	251 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	YHK8	P38776	514 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	BIG1	P38813	335 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	HAT2	P39984	401 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	YIR016W	P40572	265 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	AZF1	P41696	914 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	YCH1	P42937	148 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	AGP3	P43548	558 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	KEG1	P43614	200 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	CSM3	Q04659	317 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	YLR283W	Q05867	314 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	PAM18	Q07914	168 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	RAX1	Q08760	435 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTR1	YML121W	SET6	Q12529	373 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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