RNA–Protein interactions for RNA: YML031W

NDC1, Transcript of Subunit of the transmembrane ring of the nuclear pore complex (NPC), yeast

Gene NDC1, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NDC1	YML031W	YHR218W	P38899	603 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	PZF1	P39933	429 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	SOK1	P40317	901 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	XBP1	P40489	647 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	MNN5	P46982	586 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	CDH1	P53197	566 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	SPR6	Q01684	191 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	YPL107W	Q02873	248 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	RSC9	Q03124	581 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	TLG1	Q03322	224 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	MIX14	Q04341	121 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	PEX12	Q04370	399 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	PLM2	Q04383	521 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	URC2	Q04411	772 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	COA4	Q05809	96 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	SEI1	Q06058	285 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	GAS2	Q06135	555 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	YLR413W	Q06689	675 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	RSA1	Q08932	381 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	MED11	Q99278	115 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	YPR096C	O13587	100 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	ARG3	P05150	338 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	HMG1	P12683	1054 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	MRP13	P12686	339 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	AAC3	P18238	307 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	CMK2	P22517	447 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	CLB3	P24870	427 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	PTC6	P25646	442 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	CTS1	P29029	562 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	ATS1	P31386	333 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	CAF4	P36130	643 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	AIM2	P39721	246 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	YEN1	P40028	759 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	RNH70	P53331	553 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	DMA2	P53924	522 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	GAL83	Q04739	417 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	GPI11	Q06636	219 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	BRE4	Q07660	1125 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	NFI1	Q12216	726 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	PSF1	Q12488	208 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	HTA2	P04912	132 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	ATP4	P05626	244 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	PUT2	P07275	575 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	ERD1	P16151	362 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	MAK32	P23060	363 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	ECM8	P38246	354 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	EFM3	P47163	339 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	SLD3	P53135	668 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	TWF1	P53250	332 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	SWP1	Q02795	286 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	DCR2	Q05924	578 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	STE14	P32584	239 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	FRE2	P36033	711 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	MRPL17	P36528	281 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	BOL3	P39724	118 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	RBG1	P39729	369 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	YIL169C	P40442	995 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	PTR3	P43606	678 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	PGU1	P47180	361 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	CUZ1	P53899	274 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	COG5	P53951	403 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	UGO1	Q03327	502 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	GIS1	Q03833	894 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	RAD33	Q04231	177 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	UAF30	Q08747	228 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	MED2	Q12124	431 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	SKS1	Q12505	502 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	SFG1	Q12507	346 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	ARG81	P05085	880 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	NFT1	P0CE68	1218 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	TOP3	P13099	656 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	PEX3	P28795	441 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	NTG1	P31378	399 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	SEC17	P32602	292 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	LOT5	P34234	306 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	JLP2	P40206	208 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	MSE1	P48525	536 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	KEL2	P50090	882 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NDC1	YML031W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65

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