RNA–Protein interactions for RNA: YHL004W

MRP4, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene MRP4, Length 1,185 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRP4	YHL004W	FHN1	P53279	174 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	SLM2	P53955	656 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	SPO19	Q03029	223 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	YDR541C	Q03049	344 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	FMN1	Q03778	218 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	SMA2	Q04658	369 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	SEC10	Q06245	871 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	GPN3	Q06543	272 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	ATG34	Q12292	412 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	YOR338W	Q99326	363 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	RAD3	P06839	778 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	GAL3	P13045	520 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	SNT1	P25357	1226 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	ASK1	P35734	292 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	YKR015C	P36111	568 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	MNL1	P38888	796 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	AIM20	P40451	204 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	CIN1	P40987	1014 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	PTR3	P43606	678 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	MPS2	P53159	387 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	PIR1	Q03178	341 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	CCE1	Q03702	353 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	CSN9	Q03981	162 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	YOL019W	Q08157	551 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	ICT1	Q12385	394 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	GTT2	Q12390	233 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	APC2	Q12440	853 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MRP4	YHL004W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	YML003W	P0CF16	290 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	IMG1	P25626	169 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	YCR099C	P25657	155 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	RAD14	P28519	371 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	ATP11	P32453	318 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	SPR1	P32603	445 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	YBR144C	P34215	104 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	YKL071W	P36086	256 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	ICS2	P38284	255 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	TAE1	P38340	232 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	RCY1	P39531	840 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	PIG2	P40187	538 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	PAN6	P40459	309 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	VHS2	P40463	436 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	BNA6	P43619	295 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	GLG2	P47011	380 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	YIP5	P53108	310 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	YGR079W	P53249	370 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	CLD1	P53264	445 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	ATG4	P53867	494 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	BNA7	Q04066	261 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	APC4	Q04601	652 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	RRG8	Q06109	277 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	YLL007C	Q07799	665 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	YPL272C	Q08984	517 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	BTS1	Q12051	335 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	APC9	Q12107	265 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	GLE1	Q12315	538 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	YOR012W	Q12351	137 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	RMD5	Q12508	421 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	CDC21	P06785	304 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	CSE1	P33307	960 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	SKT5	P34226	696 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	LHS1	P36016	881 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	MNN2	P38069	597 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	ARN1	P38731	627 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	EFM1	P38732	585 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	YHR045W	P38775	560 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	UIP3	P39547	235 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	GET2	P40056	285 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	YER085C	P40058	173 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	FMC1	P40491	155 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	ILM1	P47155	203 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	MRK1	P50873	501 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	AIF1	P52923	378 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	MIG2	P53035	382 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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