RNA–Protein interactions for RNA: YGR215W

RSM27, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene RSM27, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RSM27	YGR215W	SHS1	Q07657	551 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RSM27	YGR215W	ATP16	Q12165	160 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RSM27	YGR215W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
RSM27	YGR215W	SFM1	Q12314	213 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RSM27	YGR215W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RSM27	YGR215W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RSM27	YGR215W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RSM27	YGR215W	PEX5	P35056	612 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RSM27	YGR215W	MLC1	P53141	149 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RSM27	YGR215W	CDH1	P53197	566 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RSM27	YGR215W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RSM27	YGR215W	PEX27	Q08580	376 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RSM27	YGR215W	UNG1	P12887	359 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RSM27	YGR215W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RSM27	YGR215W	PSO2	P30620	661 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RSM27	YGR215W	LDS1	P31379	325 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RSM27	YGR215W	COS9	P36034	407 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RSM27	YGR215W	CHL4	P38907	458 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RSM27	YGR215W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RSM27	YGR215W	SNL1	P40548	159 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RSM27	YGR215W	YJR030C	P47101	745 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RSM27	YGR215W	RNH201	P53942	307 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RSM27	YGR215W	RAX2	Q12465	1220 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RSM27	YGR215W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RSM27	YGR215W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RSM27	YGR215W	SMP1	P38128	452 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RSM27	YGR215W	AIM33	Q04516	312 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RSM27	YGR215W	GAS2	Q06135	555 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RSM27	YGR215W	PIN3	Q06449	215 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RSM27	YGR215W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
RSM27	YGR215W	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
RSM27	YGR215W	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
RSM27	YGR215W	MSP1	P28737	362 aa		2.72	□□□□□ -1.97
RSM27	YGR215W	PMT2	P31382	759 aa		2.72	□□□□□ -1.97
RSM27	YGR215W	MSK1	P32048	576 aa		2.72	□□□□□ -1.97
RSM27	YGR215W	YHR182W	P38870	785 aa		2.72	□□□□□ -1.97
RSM27	YGR215W	JEM1	P40358	645 aa		2.72	□□□□□ -1.97
RSM27	YGR215W	STB1	P42845	420 aa		2.72	□□□□□ -1.97
RSM27	YGR215W	HST1	P53685	503 aa		2.72	□□□□□ -1.97
RSM27	YGR215W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
RSM27	YGR215W	RMI1	Q02685	241 aa		2.72	□□□□□ -1.97
RSM27	YGR215W	MRX11	Q03079	207 aa		2.72	□□□□□ -1.97
RSM27	YGR215W	YPR078C	Q06813	372 aa		2.72	□□□□□ -1.97
RSM27	YGR215W	YFH1	Q07540	174 aa		2.72	□□□□□ -1.97
RSM27	YGR215W	EPT1	P22140	391 aa		2.71	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	DTR1	P38125	572 aa		2.71	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	YBL028C	P38202	106 aa		2.71	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	YSW1	P38280	609 aa		2.71	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	ECM34	P38728	170 aa		2.71	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	FHL1	P39521	936 aa		2.71	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	AIM23	P47015	356 aa		2.71	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	YJR054W	P47114	497 aa		2.71	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	RET3	P53600	189 aa		2.71	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	SLT2	Q00772	484 aa		2.71	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	YOL075C	Q08234	1294 aa		2.71	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	PRM7	Q12459	698 aa		2.71	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	RXT2	P38255	430 aa		2.7	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	YGR015C	P53208	328 aa		2.7	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	LDB17	Q12342	491 aa		2.7	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	HIF1	Q12373	385 aa		2.7	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	FSH3	Q99369	266 aa		2.7	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	RRT13	P40042	185 aa		2.69	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	SMP3	Q04174	516 aa		2.69	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	YOR012W	Q12351	137 aa		2.69	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	DAP2	P18962	818 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	PUP2	P32379	260 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	VAM7	P32912	316 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	SHE1	P38200	338 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	FRE6	Q12473	712 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	UBA3	Q99344	299 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	FLO11	P08640	1367 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	FMT1	P32785	401 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	YKR015C	P36111	568 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	ATG7	P38862	630 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	MPS2	P53159	387 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	YGR067C	P53243	804 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	SLM3	Q12093	417 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	FRE8	Q12209	686 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	GLE1	Q12315	538 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	YOL085C	Q99345	113 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	FAR1	P21268	830 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	COQ5	P49017	307 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	LST7	P53237	242 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	YNR068C	P53754	272 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	TRM82	Q03774	444 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	DDC1	Q08949	612 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
RSM27	YGR215W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98

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