RNA–Protein interactions for RNA: YDR093W

DNF2, Transcript of Aminophospholipid translocase (flippase), yeast

Gene DNF2, Length 4,839 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DNF2	YDR093W	ATP16	Q12165	160 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	DTR1	P38125	572 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	TRR2	P38816	342 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	HXT7	P39004	570 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	MIG2	P53035	382 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	SUR7	P54003	302 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	YPL068C	Q02749	293 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	EKI1	Q03764	534 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	REP2	P03872	296 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	GAL7	P08431	366 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	DSF1	P0CX08	502 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	YNR073C	P0CX09	502 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	CBF1	P17106	351 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	PHO12	P38693	467 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	YHR210C	P38893	341 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	MET30	P39014	640 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	HEM14	P40012	539 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	JLP2	P40206	208 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	PKP1	P40530	394 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	GTS1	P40956	396 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	RNH70	P53331	553 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	SWP1	Q02795	286 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	MSS11	Q03825	758 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	SUL2	Q12325	893 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	CDC42	P19073	191 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	ATG22	P25568	528 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	BUB3	P26449	341 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
DNF2	YDR093W	PET112	P33893	541 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	YPK3	P38070	525 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	PFS1	P38872	237 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	NBP35	P52920	328 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	YGR015C	P53208	328 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	YLR460C	P54007	376 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	REX3	Q12090	404 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	HYM1	P32464	399 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	AFR1	P33304	620 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	CAF4	P36130	643 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	YER184C	P39961	794 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	IRC22	P40006	225 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	AZF1	P41696	914 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	REX4	Q08237	289 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	MRX4	Q12467	430 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	MED11	Q99278	115 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	MKK2	P32491	506 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	YOR062C	P36025	268 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	ECM34	P38728	170 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	PRK1	P40494	810 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	AMA1	P50082	593 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	YPL113C	Q02961	396 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	YMR210W	Q03649	449 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	LPP1	Q04396	274 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	RMP1	Q12530	201 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	HMG1	P12683	1054 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	KEX2	P13134	814 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	HNM1	P19807	563 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	LST4	P34239	828 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	YBR071W	P38243	211 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	YFL052W	P43551	465 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	GPI8	P49018	411 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	RSM27	P53305	110 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	HLR1	Q04429	423 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	LIP2	Q06005	328 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	FRQ1	Q06389	190 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	YLR030W	Q07967	263 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	PLB3	Q08108	686 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	RPN13	O13563	156 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	STE4	P18851	423 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	GPX1	P36014	167 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	TUL1	P36096	758 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	PTC4	P38089	393 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	PET100	P38958	111 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	SPG5	P42933	373 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	ALY2	P47029	1046 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	AIM22	P47051	409 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	SLD3	P53135	668 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	CPR8	P53728	308 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	IRC19	Q07843	230 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	LCB4	Q12246	624 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	ATG40	Q99325	256 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	ADE1	P27616	306 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DNF2	YDR093W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67

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