RNA–Protein interactions for RNA: YCL043C

PDI1, Transcript of Protein disulfide isomerase, yeast

Gene PDI1, Length 1,569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PDI1	YCL043C	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	GAB1	P41733	394 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	CAF16	P43569	289 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	SRB7	P47822	140 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	PPT1	P53043	513 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	COG7	P53195	279 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	BSC5	P53755	489 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	TGL2	P54857	326 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	YMR010W	Q03687	405 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	SNX41	Q04053	625 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	MRL1	Q06815	381 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	YEH1	Q07804	573 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	MCA1	Q08601	432 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	YLR126C	Q12288	251 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	PST1	Q12355	444 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	YDL199C	Q12407	687 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	MPD2	Q99316	277 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	TEL1	P38110	2787 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	DST1	P07273	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	APA2	P22108	325 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	EPT1	P22140	391 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	NPR1	P22211	790 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	SNC1	P31109	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	PET127	P32606	800 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	PDC2	P32896	925 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	YKL097C	P34245	136 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	NEM1	P38757	446 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	MDM31	P38880	579 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	RMD6	P39975	231 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	ATG18	P43601	500 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	CHA4	P43634	648 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	NUP85	P46673	744 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	AIM22	P47051	409 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	AAD10	P47182	288 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	SWC4	P53201	476 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	YGR026W	P53217	278 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	RRN9	P53437	365 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	HST3	P53687	447 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	YMR130W	Q04223	302 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	YDR124W	Q04608	324 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	CRR1	Q05790	422 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	YOR352W	Q08816	343 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	YPR063C	Q12160	140 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	DFG16	Q99234	619 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	STE12	P13574	688 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	MET8	P15807	274 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	PRP28	P23394	588 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	SED4	P25365	1065 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	AGP1	P25376	633 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	RSC6	P25632	483 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	ACB1	P31787	87 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	PMT1	P33775	817 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	APL3	P38065	1025 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	YBR063C	P38083	404 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	YBR071W	P38243	211 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	IML3	P38265	245 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	RTT105	P40063	208 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	OSW5	P40219	148 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	HIS6	P40545	261 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
PDI1	YCL043C	PMT4	P46971	762 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	YJR030C	P47101	745 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	HMS2	P47175	358 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	GCV1	P48015	400 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	PMT5	P52867	743 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	GPG1	P53130	126 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	CAF120	P53836	1060 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	ACS1	Q01574	713 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	YLR446W	Q06204	433 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	GPN3	Q06543	272 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	RRT8	Q08219	342 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	SIA1	Q12212	622 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	YLR108C	Q12259	485 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	DGK1	Q12382	290 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	MHT1	Q12525	324 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63

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