RNA–Protein interactions for RNA: YOR348C

PUT4, Transcript of Proline permease, yeast

Gene PUT4, Length 1,884 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUT4	YOR348C	PFA4	Q12006	378 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PUT4	YOR348C	YPL199C	Q08954	240 aa		13.27	□□□□□ -0.28
PUT4	YOR348C	BBP1	Q12365	385 aa		13.27	□□□□□ -0.28
PUT4	YOR348C	YLR111W	Q12528	110 aa		13.27	□□□□□ -0.28
PUT4	YOR348C	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	TOD6	P34219	525 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	PIM1	P36775	1133 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	NEM1	P38757	446 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	FMC1	P40491	155 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	ATG18	P43601	500 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	SNO2	P53823	222 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	BOP2	Q06150	570 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	RTT10	Q08924	1013 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	RTN2	Q12443	393 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	CMP2	P14747	604 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	YBR137W	P38276	179 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	RRN9	P53437	365 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	RAS1	P01119	309 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	MSN2	P33748	704 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	SHE1	P38200	338 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	PLB1	P39105	664 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	ATF2	P53296	535 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	YPR022C	Q12139	1133 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	YOL163W	P0CF20	169 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	AGP1	P25376	633 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	MDV1	P47025	714 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	OST6	Q03723	332 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	YDR344C	Q05510	147 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	TFB4	Q12004	338 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	YPR015C	Q12531	247 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	SUR1	P33300	382 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	YBR063C	P38083	404 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	RTC2	P38279	296 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	TPN1	P53099	579 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	IMO32	P53219	342 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	RKM5	Q12367	367 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	MOD5	P07884	428 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	ATG22	P25568	528 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	RNP1	P32385	249 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	GPN3	Q06543	272 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	CDA2	Q06703	312 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	AHC1	Q12433	566 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	SIR2	P06700	562 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	HSP30	P25619	332 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	NEO1	P40527	1151 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	BUD9	P53226	547 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	MRPL50	P53724	139 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	EAR1	Q03212	550 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	PHO92	Q06390	306 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	YKL151C	P36059	337 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	HXT5	P38695	592 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	TED1	P40533	473 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	OPI10	Q08202	246 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	SPC3	Q12133	184 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	GID8	P40208	455 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	YPL068C	Q02749	293 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	BUR2	Q05949	395 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	PCL9	Q12477	304 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	NAG1	Q8TGN9	163 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PUT4	YOR348C	ERG9	P29704	444 aa		13.21	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	SFC1	P33303	322 aa		13.21	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	MRPL37	P36532	105 aa		13.21	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	MLH1	P38920	769 aa		13.21	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	TOS2	P50078	622 aa		13.21	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	MNT4	P53745	580 aa		13.21	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	NAT4	Q04751	285 aa		13.21	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	PIB1	Q06651	286 aa		13.21	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	PUS9	Q12069	462 aa		13.21	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		13.21	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	LSO1	Q3E827	93 aa		13.21	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	APN1	P22936	367 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	DOA1	P36037	715 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	YKL077W	P36081	392 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	MNN5	P46982	586 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	MAL11	P53048	616 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	ERV29	P53337	310 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	MSS11	Q03825	758 aa		13.2	□□□□□ -0.3

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