RNA–Protein interactions for RNA: YMR032W

HOF1, Transcript of SH3 domain-containing protein required for cytokinesis, yeast

Gene HOF1, Length 2,010 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HOF1	YMR032W	CSE1	P33307	960 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	TSC10	P38342	320 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	VAB2	P40003	282 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	JLP2	P40206	208 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	SLM1	P40485	686 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	RTT101	P47050	842 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	COX16	P47081	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	YJR149W	P47177	404 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	YGR042W	P53227	271 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	CSM4	Q08955	156 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	SIA1	Q12212	622 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	YDL177C	Q12257	170 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	PNS1	Q12412	539 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	LAS17	Q12446	633 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	ATP10	P18496	279 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	CDC5	P32562	705 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	CIN4	P39110	191 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	YGR210C	P42942	411 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	PMT5	P52867	743 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	BIO4	P53630	237 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	YNL140C	P53910	189 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	MUM3	Q08750	479 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	SKI3	P17883	1432 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	CBS2	P14905	389 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	AMD2	P22580	549 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
HOF1	YMR032W	NDC1	P32500	655 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	MNS1	P32906	549 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	YBR053C	P38235	358 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	PHO86	P46956	311 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	MRPL22	P53881	309 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	TDA6	Q06466	467 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	PER33	Q12144	273 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	YDR215C	Q12240	137 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	OPI3	P05375	206 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	SSO1	P32867	290 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	CAF4	P36130	643 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	SRP14	P38985	146 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	YMR134W	P40207	237 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	YPS6	P40583	537 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	OST6	Q03723	332 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	SMP3	Q04174	516 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	DXO1	Q06349	442 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	THI3	Q07471	609 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
HOF1	YMR032W	YLR122C	Q12312	125 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	TRM13	Q12383	476 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	PET20	Q99373	253 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	RAV1	P47104	1357 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	PTP1	P25044	335 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	MXR2	P25566	168 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	IES6	P32617	166 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	BNA4	P38169	460 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	SEO1	P39709	593 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	ALG8	P40351	577 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	YFR057W	P43625	151 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	HOC1	P47124	396 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	NIF3	P53081	288 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	PKP2	P53170	491 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	YNL092W	P53934	400 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	MMT1	Q03218	510 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	YDR248C	Q03786	193 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	UBX2	Q04228	584 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	PEX10	Q05568	337 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	YDL057W	Q07379	328 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	YOR387C	Q08910	206 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	FRE7	Q12333	620 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HOF1	YMR032W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.84	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	PPZ1	P26570	692 aa		4.84	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	NAM9	P27929	486 aa		4.84	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	TMT1	P32643	299 aa		4.84	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	MYO3	P36006	1272 aa		4.84	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	ELF1	P36053	145 aa		4.84	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	YPT10	P38146	199 aa		4.84	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	CTP1	P38152	299 aa		4.84	□□□□□ -1.64

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