RNA–Protein interactions for RNA: YML116W

ATR1, Transcript of Multidrug efflux pump of the major facilitator superfamily, yeast

Gene ATR1, Length 1,629 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATR1	YML116W	ARP6	Q12509	438 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	SPR1	P32603	445 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	REC114	P32841	428 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	YHR122W	P38829	231 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	SNL1	P40548	159 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	KEL2	P50090	882 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	BIO3	P50277	480 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	RET3	P53600	189 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	PIG1	Q06216	648 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	RUP1	Q12242	671 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	CCH1	P50077	2039 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	SNA3	P14359	133 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	MER1	P16523	270 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	ADY2	P25613	283 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	YKL097C	P34245	136 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	RPC37	P36121	282 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	GAA1	P39012	614 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	MNT4	P53745	580 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	RTC4	P53850	401 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	TAF12	Q03761	539 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	NUP53	Q03790	475 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	URC2	Q04411	772 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	FAB1	P34756	2278 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	DST1	P07273	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	RAD57	P25301	460 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	RTC2	P38279	296 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	LAG1	P38703	411 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	TOS2	P50078	622 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	ORC5	P50874	479 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	TIM21	P53220	239 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	YDL218W	Q07629	317 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	YDR262W	Q12331	272 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	FRE7	Q12333	620 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	MSK1	P32048	576 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	TVP38	P36164	337 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	YHR045W	P38775	560 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	RCY1	P39531	840 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	YPT11	P48559	417 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	DIC1	Q06143	298 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	AAD15	Q08361	143 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	AFT2	Q08957	416 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	PFA4	Q12006	378 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	GIS3	Q12418	502 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	RPN13	O13563	156 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	BI2	P03873	423 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	GSY2	P27472	705 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	CIN8	P27895	1000 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	HXT1	P32465	570 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	ECT1	P33412	323 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	CBP4	P37267	147 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	FET3	P38993	636 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	YAL037W	P39728	267 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	PAC2	P39937	518 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	INA22	P40576	216 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	YDL186W	P48568	277 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	PHB2	P50085	310 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	DSL1	P53847	754 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	PGA2	P53903	129 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	RHO4	Q00246	291 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	APC4	Q04601	652 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	SYO1	Q07395	620 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATR1	YML116W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATR1	YML116W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATR1	YML116W	ACH1	P32316	526 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATR1	YML116W	IML3	P38265	245 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATR1	YML116W	ARN1	P38731	627 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATR1	YML116W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATR1	YML116W	MRK1	P50873	501 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATR1	YML116W	PCP1	P53259	346 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATR1	YML116W	MPS1	P54199	764 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATR1	YML116W	PNG1	Q02890	363 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATR1	YML116W	TLG2	Q08144	397 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATR1	YML116W	NRT1	Q08485	598 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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