RNA–Protein interactions for RNA: YML035C

AMD1, Transcript of AMP deaminase, yeast

Gene AMD1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AMD1	YML035C	YGR266W	P53326	701 aa		5.33	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	YPL107W	Q02873	248 aa		5.33	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	YPR091C	Q06833	770 aa		5.33	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	YOR365C	Q08844	703 aa		5.33	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	HER1	Q12276	1246 aa		5.33	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	5.32	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	LYP1	P32487	611 aa		5.32	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	MKK2	P32491	506 aa		5.32	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	5.32	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	YOR062C	P36025	268 aa		5.32	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	5.32	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	RPS27B	P38711	82 aa		5.32	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	VMA22	P38784	181 aa		5.32	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	RCY1	P39531	840 aa		5.32	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	SOK1	P40317	901 aa		5.32	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	ALR2	P43553	858 aa		5.32	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	5.32	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	TWF1	P53250	332 aa		5.32	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	DAM1	P53267	343 aa		5.32	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	YAT1	P80235	687 aa		5.32	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	ENT2	Q05785	613 aa		5.32	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	YPQ2	Q06328	317 aa		5.32	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	YPR172W	Q06608	200 aa		5.32	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	YPL066W	Q12194	479 aa		5.32	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	MHF1	Q3E835	90 aa		5.32	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	RIB3	Q99258	208 aa		5.32	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	MED11	Q99278	115 aa		5.32	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	5.32	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	REP1	P03871	373 aa		5.32	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	CBS1	P14066	229 aa		5.32	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	SEC2	P17065	759 aa		5.32	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	5.32	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	OCA5	P38738	679 aa		5.32	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	ICE2	P40499	491 aa		5.32	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	PRM8	P53174	237 aa		5.32	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	DCI1	Q08558	271 aa		5.32	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	5.32	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	FMP27	Q06179	2628 aa		5.31	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	5.31	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	5.31	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	PET122	P10355	254 aa		5.31	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	MXR2	P25566	168 aa		5.31	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.31	□□□□□ -1.56	not detected
AMD1	YML035C	PTR2	P32901	601 aa		5.31	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	LST4	P34239	828 aa		5.31	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	SPO73	P40031	143 aa		5.31	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	5.31	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	BIT61	P47041	543 aa		5.31	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	ASK10	P48361	1146 aa		5.31	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	TRM9	P49957	279 aa		5.31	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	5.31	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	TFB3	Q03290	321 aa		5.31	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	COA4	Q05809	96 aa		5.31	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	YLR125W	Q12138	136 aa		5.31	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.31	□□□□□ -1.56	not detected
AMD1	YML035C	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		5.31	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	HOM3	P10869	527 aa		5.31	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	DCG1	P32460	244 aa		5.31	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	VPS51	P36116	164 aa		5.31	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	BET3	P36149	193 aa		5.31	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	UBS1	P38290	277 aa		5.31	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	5.31	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	MIT1	P40002	666 aa		5.31	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	FMP52	P40008	231 aa		5.31	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	5.31	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	NUP49	Q02199	472 aa		5.31	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	5.31	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	MDM36	Q06820	579 aa		5.31	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	YDL114W	Q07530	308 aa		5.31	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	YOR214C	Q12282	236 aa		5.31	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	PBN1	P25580	416 aa		5.3	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	5.3	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	LEM3	P42838	414 aa		5.3	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	5.3	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	DIE2	P50076	525 aa		5.3	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	SWP1	Q02795	286 aa		5.3	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	TPP1	Q03796	238 aa		5.3	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	ARP10	Q04549	284 aa		5.3	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	NAT4	Q04751	285 aa		5.3	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	VID22	Q05934	901 aa		5.3	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	BRE4	Q07660	1125 aa		5.3	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	RBD2	Q12270	262 aa		5.3	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	GCN3	P14741	305 aa		5.29	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	5.29	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	5.29	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	MBP1	P39678	833 aa		5.29	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	VPS52	P39904	641 aa		5.29	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	MET28	P40573	187 aa		5.29	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	YJL055W	P47044	245 aa		5.29	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	APS3	P47064	194 aa		5.29	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	5.29	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	MTQ1	P53944	314 aa		5.29	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	YMR210W	Q03649	449 aa		5.29	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	RNH202	Q05635	350 aa		5.29	□□□□□ -1.56
AMD1	YML035C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56

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