RNA–Protein interactions for RNA: YKL214C

YRA2, Transcript of Member of the REF (RNA and export factor binding proteins) family, yeast

Gene YRA2, Length 612 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YRA2	YKL214C	ABF1	P14164	731 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	YSP3	P25036	478 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	ELO2	P25358	347 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	CDC20	P26309	610 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	KRE2	P27809	442 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.12	□□□□□ -1.75	not detected
YRA2	YKL214C	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	MNS1	P32906	549 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	RRN10	P38204	145 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	FIG1	P38224	298 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	AME1	P38313	324 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	VMA22	P38784	181 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	UBA4	P38820	440 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	YHR177W	P38867	453 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	UIP3	P39547	235 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	ECM1	P39715	212 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	ERG28	P40030	148 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	YNL194C	P40169	301 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	ICE2	P40499	491 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	PAC11	P40960	533 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	PEX12	Q04370	399 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	CDC123	Q05791	360 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	SPO77	Q06134	477 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	BAG7	Q12128	409 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	PER33	Q12144	273 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	FRE7	Q12333	620 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	PNS1	Q12412	539 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	COR1	P07256	457 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	SNA3	P14359	133 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	GIT1	P25346	518 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	RRT12	P25381	491 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	TRM2	P33753	639 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	SPO23	P33757	523 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	YOX1	P34161	385 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	YPK3	P38070	525 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	DTR1	P38125	572 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	SDH8	P38345	138 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	HIS2	P38635	335 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	FMO1	P38866	432 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	CIN4	P39110	191 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	RPH1	P39956	796 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	ECM10	P39987	644 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	OPT1	P40897	799 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	YFR020W	P43600	232 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	YAR1	P46683	200 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	ATG27	P46989	271 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	GET1	P53192	235 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	MTL1	P53214	551 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	FHN1	P53279	174 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	SPC98	P53540	846 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	ZRG17	P53735	605 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	RNT1	Q02555	471 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	NUP116	Q02630	1113 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	AIM33	Q04516	312 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	YEH2	Q07950	538 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	DDC1	Q08949	612 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	MSH5	Q12175	901 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	ERP3	Q12403	225 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	APC1	P53886	1748 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	YRF1-6	P53819	1859 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	SNF2	P22082	1703 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	RIP1	P08067	215 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	POX1	P13711	748 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	MSK1	P32048	576 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	BCS1	P32839	456 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	RGT1	P32862	1170 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	SPT10	P35208	640 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	INM1	P38710	295 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	TRM5	P38793	499 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	SBE22	P38814	852 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	SRP14	P38985	146 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	MBB1	P39534	108 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	NDC80	P40460	691 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	POP1	P41812	875 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	AGP3	P43548	558 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	TAF6	P53040	516 aa		4.1	□□□□□ -1.75

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