RNA–Protein interactions for RNA: YHR167W

THP2, Transcript of Subunit of the THO and TREX complexes, yeast

Gene THP2, Length 786 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
THP2	YHR167W	VPS60	Q03390	229 aa		3.17	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	PRM6	Q04705	352 aa		3.17	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	FUS2	Q05670	677 aa		3.17	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	YLR108C	Q12259	485 aa		3.17	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	PHO13	P19881	312 aa		3.16	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	URA4	P20051	364 aa		3.16	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.16	□□□□□ -1.9	not detected
THP2	YHR167W	ERV1	P27882	189 aa		3.16	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	YAL037W	P39728	267 aa		3.16	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	YEL075C	P39972	122 aa		3.16	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	PRM5	P40476	318 aa		3.16	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	REE1	P40893	198 aa		3.16	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	PHO86	P46956	311 aa		3.16	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	GPI15	P53961	229 aa		3.16	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	YMR181C	Q03231	154 aa		3.16	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	TAF12	Q03761	539 aa		3.16	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	ACL4	Q03771	387 aa		3.16	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	TAF10	Q12030	206 aa		3.16	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	HKR1	P41809	1802 aa		3.16	□□□□□ -1.9
THP2	YHR167W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.15	□□□□□ -1.91	not detected
THP2	YHR167W	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	CLN1	P20437	546 aa		3.15	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	SLY1	P22213	666 aa		3.15	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	CLB1	P24868	471 aa		3.15	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	DBF4	P32325	704 aa		3.15	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	DPH2	P32461	534 aa		3.15	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.15	□□□□□ -1.91	not detected
THP2	YHR167W	CSG2	P35206	410 aa		3.15	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	SLM4	P38247	162 aa		3.15	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	RRT2	P38332	387 aa		3.15	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	AVT2	P39981	480 aa		3.15	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	YGR210C	P42942	411 aa		3.15	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	NCA3	P46955	337 aa		3.15	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	TCB2	P48231	1178 aa		3.15	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	BRO1	P48582	844 aa		3.15	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	SHE10	P53075	577 aa		3.15	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	GIP3	Q03016	1276 aa		3.15	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	PPM1	Q04081	328 aa		3.15	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	DCS1	Q06151	350 aa		3.15	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	VAC14	Q06708	880 aa		3.15	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	DDC1	Q08949	612 aa		3.15	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	HRT3	Q12347	344 aa		3.15	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	AHC1	Q12433	566 aa		3.15	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	REV1	P12689	985 aa		3.14	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	RAD57	P25301	460 aa		3.14	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	BRF1	P29056	596 aa		3.14	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	TFB1	P32776	642 aa		3.14	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	SDH3	P33421	198 aa		3.14	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	KKQ8	P36004	724 aa		3.14	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	SWD3	P38123	315 aa		3.14	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	RRN10	P38204	145 aa		3.14	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	HIS2	P38635	335 aa		3.14	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	MTC6	P38849	526 aa		3.14	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	YER186C	P40101	306 aa		3.14	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	YJR054W	P47114	497 aa		3.14	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	TOM22	P49334	152 aa		3.14	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	PHB2	P50085	310 aa		3.14	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	YML6	P51998	286 aa		3.14	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	OCA2	P53949	197 aa		3.14	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	RSN1	Q03516	953 aa		3.14	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	BET5	Q03630	159 aa		3.14	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	ARO80	Q04052	950 aa		3.14	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	YMR130W	Q04223	302 aa		3.14	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	REX4	Q08237	289 aa		3.14	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	COX3	P00420	269 aa		3.13	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	TRP1	P00912	224 aa		3.13	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	COX4	P04037	155 aa		3.13	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	BUD2	P33314	1104 aa		3.13	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	YHL026C	P38740	315 aa		3.13	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	TCD1	P38756	429 aa		3.13	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	YER189W	P40104	122 aa		3.13	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	ASG7	P46993	209 aa		3.13	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	RPC17	P47076	161 aa		3.13	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
THP2	YHR167W	KAP114	P53067	1004 aa		3.13	□□□□□ -1.91

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