RNA–Protein interactions for RNA: YGR063C

SPT4, Transcript of Component of the universally conserved Spt4/5 complex (DSIF complex), yeastyeast

Gene SPT4, Length 309 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT4YGR063C TAH11P47112 604 aa3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C TAF4P50105 388 aa3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C ALT2P52892 507 aa3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C ROG1P53118 685 aa3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C YGL101WP53144 215 aa3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C PKP2P53170 491 aa3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C YGR017WP53210 297 aa3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C TNA1P53322 534 aa3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C RNH70P53331 553 aa3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C ERV29P53337 310 aa3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C YPR003CP53394 754 aa3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C RRN9P53437 365 aa3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C SSU72P53538 206 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C ALG11P53954 548 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C APM1Q00776 475 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C REG1Q00816 1014 aa3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C GRX5Q02784 150 aa3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C CTL1Q03220 320 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C SKY1Q03656 742 aa3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C TY1A-DR1Q03856 440 aa3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C RKM2Q03942 479 aa3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C ATC1Q04005 294 aa3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C LRS4Q04087 347 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C YHC1Q05900 231 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C FRQ1Q06389 190 aa3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C SDO1Q07953 250 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C FMP25Q08023 583 aa3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C RRT8Q08219 342 aa3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C RRG7Q08774 242 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C SCP1Q08873 200 aa3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C LEA1Q08963 238 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C GPM2Q12008 311 aa3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C SLM3Q12093 417 aa3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C RTK1Q12100 620 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C YPL245WQ12179 454 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C TY1A-BRQ12217 440 aa3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C YOR114WQ12219 294 aa3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C TY1A-DR3Q12441 440 aa3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C TY1A-NL2Q12470 440 aa3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C TY1A-GR2Q12485 440 aa3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C SKS1Q12505 502 aa3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C YDL085C-AQ3E7B7 68 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C MEX67Q99257 599 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C FRT1Q99332 602 aa3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C Q0142Q9ZZW4 58 aa3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C MOT1P32333 1867 aa3.33□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C YER152CP10356 443 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C REV1P12689 985 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C RPL8AP17076 256 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C SDH2P21801 266 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C PRE1P22141 198 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C YCR102CP25608 368 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C LAC1P28496 418 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C RPL8BP29453 256 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C CYS3P31373 394 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C ARP2P32381 391 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C TCA17P32613 152 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C MGM101P32787 269 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C YPT7P32939 208 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C SUR1P33300 382 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C SNU114P36048 1008 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C TUL1P36096 758 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C BET3P36149 193 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C MRPL36P36531 177 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C AHP1P38013 176 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C ATG8P38182 117 aaRIP-Chip data3.32□□□□□ -1.88not detected
SPT4YGR063C SHG1P38337 142 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C CKB2P38930 258 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C GAA1P39012 614 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C GDS1P41913 522 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C ATG18P43601 500 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C YJL132WP47014 750 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C NET1P47035 1189 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C YAE1P47118 141 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C MTR3P48240 250 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C ASN2P49090 572 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C NCS6P53088 359 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C YGL185CP53100 379 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C NSA1P53136 463 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C PUS2P53167 370 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C ATF2P53296 535 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C TIM8P57744 87 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C KIN4Q01919 800 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C YPL014WQ02606 381 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C MSC1Q03104 513 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C CUE4Q04201 117 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C TVP18Q04767 167 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C SPR28Q04921 423 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C DCR2Q05924 578 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C RIF2Q06208 395 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C TPO3Q06451 622 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C SSK1Q07084 712 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C CYK3Q07533 885 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C YOL131WQ08270 108 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C HFI1Q12060 488 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C NMD4Q12129 218 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C RGT2Q12300 763 aa3.32□□□□□ -1.88
SPT4YGR063C ERG27Q12452 347 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
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