RNA–Protein interactions for RNA: YER018C

SPC25, Transcript of Component of the kinetochore-associated Ndc80 complex, yeastyeast

Gene SPC25, Length 666 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC25YER018C ASF2P32448 525 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
SPC25YER018C BCK2P33306 851 aa10.01□□□□□ -0.81
SPC25YER018C LHS1P36016 881 aa10.01□□□□□ -0.81
SPC25YER018C CTF8P38877 133 aa10.01□□□□□ -0.81
SPC25YER018C GID8P40208 455 aa10.01□□□□□ -0.81
SPC25YER018C RPL17BP46990 184 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
SPC25YER018C MAL11P53048 616 aa10.01□□□□□ -0.81
SPC25YER018C BDS1Q08347 646 aa10.01□□□□□ -0.81
SPC25YER018C YOR214CQ12282 236 aa10.01□□□□□ -0.81
SPC25YER018C HFA1P32874 2273 aa10.01□□□□□ -0.81
SPC25YER018C SEN1Q00416 2231 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
SPC25YER018C HOP09932 586 aa10□□□□□ -0.81
SPC25YER018C YOL163WP0CF20 169 aa10□□□□□ -0.81
SPC25YER018C PMT2P31382 759 aa10□□□□□ -0.81
SPC25YER018C AHP1P38013 176 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SPC25YER018C UBS1P38290 277 aa10□□□□□ -0.81
SPC25YER018C SIC1P38634 284 aa10□□□□□ -0.81
SPC25YER018C SSZ1P38788 538 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SPC25YER018C SMK1P41808 388 aa10□□□□□ -0.81
SPC25YER018C SNF12P53628 566 aa10□□□□□ -0.81
SPC25YER018C SMP3Q04174 516 aa10□□□□□ -0.81
SPC25YER018C ARV1Q06541 321 aa10□□□□□ -0.81
SPC25YER018C BRR2P32639 2163 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SPC25YER018C FAS1P07149 2051 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SPC25YER018C URE2P23202 354 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SPC25YER018C BUD5P25300 642 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SPC25YER018C STP22P25604 385 aa9.99□□□□□ -0.81
SPC25YER018C ITR2P30606 609 aa9.99□□□□□ -0.81
SPC25YER018C PRP21P32524 280 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SPC25YER018C SEC61P32915 480 aa9.99□□□□□ -0.81
SPC25YER018C ARC19P33204 171 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SPC25YER018C SEA4P38164 1038 aa9.99□□□□□ -0.81
SPC25YER018C YBR138CP38277 524 aa9.99□□□□□ -0.81
SPC25YER018C YHR097CP38809 366 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SPC25YER018C APE4P38821 490 aa9.99□□□□□ -0.81
SPC25YER018C YHR219WP38900 624 aa9.99□□□□□ -0.81
SPC25YER018C PRE6P40303 254 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SPC25YER018C BAP3P41815 604 aa9.99□□□□□ -0.81
SPC25YER018C SNO3P43544 222 aa9.99□□□□□ -0.81
SPC25YER018C IMD4P50094 524 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SPC25YER018C SKI7Q08491 747 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SPC25YER018C YDL211CQ12121 372 aa9.99□□□□□ -0.81
SPC25YER018C PRP46Q12417 451 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SPC25YER018C COX1P00401 534 aa9.98□□□□□ -0.81
SPC25YER018C AI1P03875 834 aa9.98□□□□□ -0.81
SPC25YER018C BAR1P12630 587 aa9.98□□□□□ -0.81
SPC25YER018C KGD1P20967 1014 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
SPC25YER018C SBE22P38814 852 aa9.98□□□□□ -0.81
SPC25YER018C SOK1P40317 901 aa9.98□□□□□ -0.81
SPC25YER018C MSS2P40990 351 aa9.98□□□□□ -0.81
SPC25YER018C GCN20P43535 752 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
SPC25YER018C SPO19Q03029 223 aa9.98□□□□□ -0.81
SPC25YER018C RSN1Q03516 953 aa9.98□□□□□ -0.81
SPC25YER018C ATG17Q06410 417 aa9.98□□□□□ -0.81
SPC25YER018C REX3Q12090 404 aa9.98□□□□□ -0.81
SPC25YER018C TPK3P05986 398 aa9.97□□□□□ -0.81
SPC25YER018C NAR1P23503 491 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
SPC25YER018C VPH2P32341 215 aa9.97□□□□□ -0.81
SPC25YER018C HIR2P32480 875 aa9.97□□□□□ -0.81
SPC25YER018C LST4P34239 828 aa9.97□□□□□ -0.81
SPC25YER018C EGD2P38879 174 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
SPC25YER018C SWP82P43554 623 aa9.97□□□□□ -0.81
SPC25YER018C SEH1P53011 349 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
SPC25YER018C MPA43P53583 542 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
SPC25YER018C COG5P53951 403 aa9.97□□□□□ -0.81
SPC25YER018C YLR460CP54007 376 aa9.97□□□□□ -0.81
SPC25YER018C TMA20P89886 181 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
SPC25YER018C YSA1Q01976 231 aa9.97□□□□□ -0.81
SPC25YER018C YKR011CQ02209 353 aa9.97□□□□□ -0.81
SPC25YER018C YMR210WQ03649 449 aa9.97□□□□□ -0.81
SPC25YER018C URC2Q04411 772 aa9.97□□□□□ -0.81
SPC25YER018C VID22Q05934 901 aa9.97□□□□□ -0.81
SPC25YER018C YME2P32843 850 aa9.96□□□□□ -0.82
SPC25YER018C SRO77P38163 1010 aa9.96□□□□□ -0.82
SPC25YER018C AST2P39945 430 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SPC25YER018C YNL195CP40168 261 aa9.96□□□□□ -0.82
SPC25YER018C CIN1P40987 1014 aa9.96□□□□□ -0.82
SPC25YER018C CUP9P41817 306 aa9.96□□□□□ -0.82
SPC25YER018C HMS2P47175 358 aa9.96□□□□□ -0.82
SPC25YER018C BAT2P47176 376 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SPC25YER018C SLD3P53135 668 aa9.96□□□□□ -0.82
SPC25YER018C LCL3P53153 274 aa9.96□□□□□ -0.82
SPC25YER018C NCE101Q02820 53 aa9.96□□□□□ -0.82
SPC25YER018C PEX25Q02969 394 aa9.96□□□□□ -0.82
SPC25YER018C TLG1Q03322 224 aa9.96□□□□□ -0.82
SPC25YER018C YMD8Q03697 442 aa9.96□□□□□ -0.82
SPC25YER018C BRX1Q08235 291 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SPC25YER018C DAT1P13483 248 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SPC25YER018C CNA1P23287 553 aa9.95□□□□□ -0.82
SPC25YER018C PBN1P25580 416 aa9.95□□□□□ -0.82
SPC25YER018C LYP1P32487 611 aa9.95□□□□□ -0.82
SPC25YER018C PRP19P32523 503 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SPC25YER018C PAC1P39946 494 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SPC25YER018C RRG9P40156 214 aa9.95□□□□□ -0.82
SPC25YER018C MDV1P47025 714 aa9.95□□□□□ -0.82
SPC25YER018C COS1P53822 381 aa9.95□□□□□ -0.82
SPC25YER018C ABZ2Q03266 374 aa9.95□□□□□ -0.82
SPC25YER018C TPO4Q12256 659 aa9.95□□□□□ -0.82
SPC25YER018C FRE7Q12333 620 aa9.95□□□□□ -0.82
SPC25YER018C NPC2Q12408 173 aa9.95□□□□□ -0.82
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