RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A MRX4Q12467 430 aa0.1□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A FUR1P18562 216 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A MRPL20P22354 195 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A GRX4P32642 244 aa0.09□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A YME2P32843 850 aa0.09□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A THI2P38141 450 aa0.09□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A MAL13P53338 473 aa0.09□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A SLT2Q00772 484 aa0.09□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A URH1Q04179 340 aa0.09□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A ARC18Q05933 178 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A PLP2Q12017 286 aa0.09□□□□□ -2.39
YPL060C-AYPL060C-A TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A MET2P08465 486 aa0.09□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A AMD1P15274 810 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A RHB1P25378 209 aa0.09□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A URA10P30402 227 aa0.09□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A RRN3P36070 627 aa0.09□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A BAT1P38891 393 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A YJR008WP47085 338 aa0.09□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A YJR030CP47101 745 aa0.09□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A STE24P47154 453 aa0.09□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A BAT2P47176 376 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A YGL108CP53139 140 aa0.09□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A YSA1Q01976 231 aa0.09□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A TSR2Q06672 205 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A YGK3Q12222 375 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A NUP188P52593 1655 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A VMR1P38735 1592 aa0.09□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A MHP1P43638 1398 aa0.09□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A PEP4P07267 405 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A OCA4P25366 362 aa0.08□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A YER010CP40011 234 aa0.08□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A SCC4P40090 624 aa0.08□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A YJR154WP47181 346 aa0.08□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A DCS1Q06151 350 aa0.08□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A YLR177WQ06251 628 aa0.08□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A RAX1Q08760 435 aa0.08□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A MMT2Q08970 484 aa0.08□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A ATG29Q12092 213 aa0.08□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A TDH1P00360 332 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A KGD1P20967 1014 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A DTR1P38125 572 aa0.08□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A ECM7Q06200 448 aa0.08□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A IMH1Q06704 911 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A URB1P34241 1764 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A TY2B-BQ12491 1770 aa0.08□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A CKA2P19454 339 aa0.08□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A JNM1P36224 373 aa0.08□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A EPL1P43572 832 aa0.08□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A TRS85P46944 698 aa0.08□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A SXM1Q04175 944 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A RRP9Q06506 573 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A YEH1Q07804 573 aa0.08□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A CMS1Q07897 291 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A ATP4P05626 244 aa0.07□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A MSS116P15424 664 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A PRP2P20095 876 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A ART5P53244 586 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A YPL113CQ02961 396 aa0.07□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A CSI1Q04368 295 aa0.07□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A DFR1P07807 211 aaKnown RBP RIP-Chip data0.07□□□□□ -2.4not detected
YPL060C-AYPL060C-A APA1P16550 321 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A ATP11P32453 318 aa0.07□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A YBL028CP38202 106 aa0.07□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A FHL1P39521 936 aa0.07□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A TFG2P41896 400 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A ZIM17P42844 174 aa0.07□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A TWF1P53250 332 aa0.07□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A SYF2P53277 215 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A HXT11P54862 567 aa0.07□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A UBX2Q04228 584 aa0.07□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A YDL109CQ12103 647 aa0.07□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A YDL211CQ12121 372 aa0.07□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A YSP2Q06681 1438 aa0.07□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A RPC53P25441 422 aa0.07□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A RPL16AP26784 199 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A SSE1P32589 693 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A GYP6P32806 458 aa0.07□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A MYO3P36006 1272 aa0.07□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A RPS10BP46784 105 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A YNR048WP53740 393 aa0.07□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A MSC3Q05812 728 aa0.07□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A GIT1P25346 518 aa0.06□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A CAT2P32796 670 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A INA17Q02888 182 aa0.06□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A MDM36Q06820 579 aa0.06□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A FCY22Q12119 530 aa0.06□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A YDL007C-AQ2V2Q0 85 aa0.06□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A YPT6Q99260 215 aa0.06□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A MTF2P10849 440 aa0.06□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A GPI10P30777 616 aa0.06□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A SMY1P32364 656 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A LOS1P33418 1100 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A NOP4P37838 685 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A SMF2P38778 549 aa0.06□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A LSM4P40070 187 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A ERV29P53337 310 aa0.06□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A YNR062CP53748 327 aa0.06□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A ISA2Q12425 185 aa0.06□□□□□ -2.4
YPL060C-AYPL060C-A SEC39Q12745 709 aa0.06□□□□□ -2.4
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